43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1338 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_1338  PAP2 family protein  100 
 
 
347 aa  697    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1160  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.68 
 
 
205 aa  76.6  0.0000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1340  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.51 
 
 
204 aa  77  0.0000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3793  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  33.33 
 
 
1261 aa  68.9  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0216  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.49 
 
 
218 aa  60.5  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1773  PAP2 superfamily protein  40.4 
 
 
445 aa  55.5  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2023  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.21 
 
 
317 aa  52.4  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000204588 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1712  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.5 
 
 
177 aa  52  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0174559  normal  0.195225 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1891  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.43 
 
 
182 aa  52  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.161028  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4469  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.74 
 
 
251 aa  49.7  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3219  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  41.98 
 
 
230 aa  48.5  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0806  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40 
 
 
281 aa  48.5  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.343717  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1340  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.5 
 
 
249 aa  47.8  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.130328  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3521  PAP2 family protein  30.83 
 
 
174 aa  47  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.702348  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1347  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.75 
 
 
392 aa  47  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.423681  hitchhiker  0.0000000949183 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0313  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.8 
 
 
305 aa  46.2  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.512715  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0381  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.7 
 
 
220 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0409  phosphoesterase, PA-phosphatase related  48.28 
 
 
170 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5449  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.49 
 
 
284 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.961923  normal  0.71434 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4017  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.17 
 
 
290 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  0.169945 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0466  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.62 
 
 
207 aa  45.4  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2201  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.03 
 
 
208 aa  45.8  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0037  phosphoesterase, PA-phosphatase related  45.31 
 
 
272 aa  45.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6735  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  35 
 
 
245 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.418259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3404  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.62 
 
 
228 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3721  phosphoesterase, PA-phosphatase related  48.28 
 
 
170 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.701868  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0637  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.55 
 
 
208 aa  44.3  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3857  PAP2 family protein  30.25 
 
 
175 aa  44.3  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0547  phosphoesterase PA-phosphatase related  41.49 
 
 
261 aa  44.7  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0347407  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4760  phosphoesterase PA-phosphatase related  41.67 
 
 
279 aa  44.7  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000169741 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0835  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40 
 
 
181 aa  44.3  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.896282 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3083  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.48 
 
 
294 aa  43.9  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.227102  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1178  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.78 
 
 
294 aa  43.9  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.2963e-23 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3118  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.47 
 
 
235 aa  43.9  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1280  PAP2 family protein  29.25 
 
 
185 aa  43.5  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0275929  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3547  phosphoesterase, PA-phosphatase related  48.28 
 
 
170 aa  43.5  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0785734  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0961  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.73 
 
 
166 aa  43.1  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3191  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.66 
 
 
174 aa  43.5  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.353726  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0532  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.52 
 
 
187 aa  43.1  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1441  PAP2 family protein  31.09 
 
 
175 aa  43.1  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.24965  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2545  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.27 
 
 
242 aa  43.1  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1102  phosphatase  29.25 
 
 
185 aa  42.7  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0240643  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2672  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  42.62 
 
 
191 aa  42.7  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>