96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05882 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05882  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  222  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1441  PAP2 family protein  47.62 
 
 
175 aa  100  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.24965  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1712  phosphoesterase, PA-phosphatase related  45.1 
 
 
177 aa  98.6  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0174559  normal  0.195225 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1765  putative membrane-associated phosphoesterase  44.55 
 
 
187 aa  98.2  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.569407  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3857  PAP2 family protein  52.27 
 
 
175 aa  97.1  7e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3191  phosphoesterase PA-phosphatase related  45.37 
 
 
174 aa  96.7  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.353726  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0835  phosphoesterase, PA-phosphatase related  51.16 
 
 
181 aa  89.4  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.896282 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3521  PAP2 family protein  41.67 
 
 
174 aa  87.8  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.702348  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0961  phosphoesterase, PA-phosphatase related  44.95 
 
 
166 aa  84  6e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1027  phosphoesterase, PA-phosphatase related  41.58 
 
 
437 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.313073  normal  0.124762 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3190  phosphoesterase, PA-phosphatase related  53.41 
 
 
175 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.276417  hitchhiker  0.000061179 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0748  phosphoesterase, PA-phosphatase related  53.41 
 
 
175 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0445246 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0774  phosphoesterase, PA-phosphatase related  53.41 
 
 
175 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.120064  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1891  phosphoesterase, PA-phosphatase related  48.78 
 
 
182 aa  82  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.161028  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2784  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.61 
 
 
442 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.952787  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0674  phosphoesterase PA-phosphatase related  47.87 
 
 
174 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3636  phosphoesterase PA-phosphatase related  47.87 
 
 
174 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00129425  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3759  phosphoesterase PA-phosphatase related  47.87 
 
 
174 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.226695  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3568  phosphoesterase PA-phosphatase related  47.87 
 
 
174 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0831  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.83 
 
 
189 aa  77.4  0.00000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0816  membrane-associated phospholipid phosphatase  37.86 
 
 
189 aa  76.3  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0247749 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3641  phosphoesterase PA-phosphatase related  44.33 
 
 
186 aa  75.1  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.302085  normal  0.062133 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4366  phosphoesterase PA-phosphatase related  43.27 
 
 
218 aa  73.2  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0817815  normal  0.119091 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0572  PAP2 superfamily protein  40.59 
 
 
243 aa  67.8  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.194022 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2545  phosphoesterase PA-phosphatase related  45.56 
 
 
242 aa  67  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6959  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  37.04 
 
 
244 aa  63.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.190723  normal  0.122006 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3031  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.64 
 
 
460 aa  62.4  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0770809  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1969  phosphoesterase, PA-phosphatase related  43.42 
 
 
253 aa  62  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175709  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1773  PAP2 superfamily protein  38.54 
 
 
445 aa  62  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4469  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40.26 
 
 
251 aa  59.7  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2185  phosphoesterase PA-phosphatase related  43.24 
 
 
257 aa  58.5  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.303622  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1340  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.9 
 
 
249 aa  57  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.130328  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1517  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.79 
 
 
281 aa  56.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000561151  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1347  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.5 
 
 
392 aa  56.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.423681  hitchhiker  0.0000000949183 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4017  phosphoesterase PA-phosphatase related  41.77 
 
 
290 aa  55.5  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  0.169945 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1840  PAP2 family protein  36.46 
 
 
272 aa  53.9  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3912  phosphoesterase PA-phosphatase related  42.03 
 
 
230 aa  53.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.703578  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0891  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  36.27 
 
 
199 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.467652  normal  0.655955 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2234  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.46 
 
 
268 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2324  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.35 
 
 
182 aa  51.6  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.043169  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6735  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  39.51 
 
 
245 aa  51.2  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.418259 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2023  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.43 
 
 
317 aa  49.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000204588 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2672  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  38.27 
 
 
191 aa  50.1  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3219  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  41.1 
 
 
230 aa  48.1  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1899  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.33 
 
 
182 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3198  PAP2 family protein  46.27 
 
 
170 aa  47.4  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0532  phosphoesterase PA-phosphatase related  40 
 
 
187 aa  47  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0466  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.11 
 
 
207 aa  46.6  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1491  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.97 
 
 
157 aa  46.6  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0940557  normal  0.0672657 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1178  phosphoesterase PA-phosphatase related  41.79 
 
 
294 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.2963e-23 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0637  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.9 
 
 
208 aa  46.2  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3793  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  33.33 
 
 
1261 aa  45.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1102  phosphatase  33.33 
 
 
185 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0240643  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1888  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  27.91 
 
 
192 aa  45.4  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.871384  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2288  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.72 
 
 
205 aa  45.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1280  PAP2 family protein  33.33 
 
 
185 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0275929  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0111  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40.62 
 
 
174 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3368  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.36 
 
 
176 aa  45.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4760  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.94 
 
 
279 aa  44.7  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000169741 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07660  phospholipid metabolism-related protein, putative  35.37 
 
 
354 aa  45.1  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0037  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.88 
 
 
272 aa  44.7  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3387  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.62 
 
 
168 aa  44.3  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000111833  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3083  phosphoesterase PA-phosphatase related  40.3 
 
 
294 aa  44.3  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.227102  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2216  phosphoesterase, PA-phosphatase related  46.97 
 
 
245 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.322102 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3788  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.37 
 
 
169 aa  43.9  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5776  phosphoesterase PA-phosphatase related  42.03 
 
 
194 aa  43.9  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00125534  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1669  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.93 
 
 
202 aa  42.7  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000273408  normal  0.218841 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001653  membrane-associated phospholipid phosphatase  34.15 
 
 
182 aa  42.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0399  phosphatase  37.68 
 
 
187 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.556092  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2194  PAP2 family phosphatase  37.68 
 
 
183 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000351549  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3600  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.93 
 
 
171 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000568068  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3550  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.78 
 
 
278 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.62844 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07455  hypothetical protein  32.56 
 
 
187 aa  42  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0409  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.44 
 
 
170 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3620  phosphoesterase PA-phosphatase related  40 
 
 
311 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000326063 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0786  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.36 
 
 
179 aa  42  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000027355 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3721  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.44 
 
 
170 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.701868  normal 
 
 
-
 
NC_013736  Slin_7049  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  34.52 
 
 
287 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1015  phosphoesterase PA-phosphatase related  41.25 
 
 
265 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4071  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.71 
 
 
169 aa  41.6  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2143  phosphoesterase PA-phosphatase related  45 
 
 
202 aa  41.2  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.100346 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2415  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.78 
 
 
265 aa  41.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0206905  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1713  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.88 
 
 
176 aa  41.2  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.118972  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3725  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.4 
 
 
158 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2985  PAP2 superfamily protein  42.03 
 
 
175 aa  41.2  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2011  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  34.67 
 
 
222 aa  40.8  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.235686  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1791  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.89 
 
 
225 aa  40.8  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.824897  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6732  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  34.48 
 
 
251 aa  40.8  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.322739 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2317  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  28.57 
 
 
187 aa  40.8  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4143  phosphoesterase PA-phosphatase related  40 
 
 
201 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4117  phosphoesterase PA-phosphatase related  40 
 
 
201 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0270  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.57 
 
 
246 aa  40.4  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2462  bacitracin transport permease, PAP2 family protein  29.89 
 
 
199 aa  40  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0841769  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0547  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.1 
 
 
261 aa  40  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0347407  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0607  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.39 
 
 
179 aa  40  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00776566  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2570  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  39.73 
 
 
209 aa  40  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.501729  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>