82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2784 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_2784  phosphoesterase, PA-phosphatase related  100 
 
 
442 aa  902    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.952787  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1027  phosphoesterase, PA-phosphatase related  59.95 
 
 
437 aa  526  1e-148  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.313073  normal  0.124762 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3031  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.75 
 
 
460 aa  163  6e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0770809  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0835  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40.91 
 
 
181 aa  139  7.999999999999999e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.896282 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1441  PAP2 family protein  42.58 
 
 
175 aa  132  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.24965  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0816  membrane-associated phospholipid phosphatase  42.58 
 
 
189 aa  131  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0247749 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0831  phosphoesterase, PA-phosphatase related  42.58 
 
 
189 aa  129  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3191  phosphoesterase PA-phosphatase related  42.11 
 
 
174 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.353726  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3857  PAP2 family protein  48.03 
 
 
175 aa  126  7e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1712  phosphoesterase, PA-phosphatase related  41.14 
 
 
177 aa  124  4e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0174559  normal  0.195225 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3521  PAP2 family protein  40.79 
 
 
174 aa  122  9e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.702348  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1765  putative membrane-associated phosphoesterase  39.02 
 
 
187 aa  117  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.569407  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0748  phosphoesterase, PA-phosphatase related  47.01 
 
 
175 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0445246 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0774  phosphoesterase, PA-phosphatase related  47.01 
 
 
175 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.120064  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3190  phosphoesterase, PA-phosphatase related  47.01 
 
 
175 aa  117  6e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.276417  hitchhiker  0.000061179 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3641  phosphoesterase PA-phosphatase related  47.65 
 
 
186 aa  116  7.999999999999999e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.302085  normal  0.062133 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0674  phosphoesterase PA-phosphatase related  42.57 
 
 
174 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3636  phosphoesterase PA-phosphatase related  42.57 
 
 
174 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00129425  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3568  phosphoesterase PA-phosphatase related  42.57 
 
 
174 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3759  phosphoesterase PA-phosphatase related  42.57 
 
 
174 aa  113  5e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.226695  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1891  phosphoesterase, PA-phosphatase related  52.38 
 
 
182 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.161028  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4366  phosphoesterase PA-phosphatase related  45.22 
 
 
218 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0817815  normal  0.119091 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0961  phosphoesterase, PA-phosphatase related  42.96 
 
 
166 aa  104  4e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4017  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.75 
 
 
290 aa  82.8  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  0.169945 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05882  hypothetical protein  38.61 
 
 
108 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1969  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.07 
 
 
253 aa  80.1  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175709  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6959  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  36.81 
 
 
244 aa  77.8  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.190723  normal  0.122006 
 
 
-
 
NC_002950  PG1773  PAP2 superfamily protein  38.68 
 
 
445 aa  76.6  0.0000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2324  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.56 
 
 
182 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.043169  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2545  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.44 
 
 
242 aa  75.9  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1899  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.33 
 
 
182 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2185  phosphoesterase PA-phosphatase related  40.4 
 
 
257 aa  74.7  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.303622  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4469  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.66 
 
 
251 aa  73.2  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0572  PAP2 superfamily protein  35.37 
 
 
243 aa  70.5  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.194022 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1340  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.48 
 
 
249 aa  68.9  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.130328  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3912  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.34 
 
 
230 aa  67  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.703578  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5776  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.79 
 
 
194 aa  59.7  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00125534  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1347  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.4 
 
 
392 aa  58.9  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.423681  hitchhiker  0.0000000949183 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1517  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.03 
 
 
281 aa  58.9  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000561151  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6735  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  36.59 
 
 
245 aa  58.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.418259 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2415  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.31 
 
 
265 aa  57  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0206905  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1762  hypothetical protein  25.15 
 
 
244 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.566188 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1840  PAP2 family protein  37.62 
 
 
272 aa  55.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2023  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.95 
 
 
317 aa  52.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000204588 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3371  membrane-associated phospholipid phosphatase  26.75 
 
 
217 aa  52.4  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.067771 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001653  membrane-associated phospholipid phosphatase  34.86 
 
 
182 aa  51.6  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3940  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.64 
 
 
271 aa  50.8  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0010362 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1102  phosphatase  27.59 
 
 
185 aa  50.8  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0240643  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0466  phosphoesterase, PA-phosphatase related  42.86 
 
 
207 aa  50.8  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2063  hypothetical protein  30.99 
 
 
178 aa  50.1  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2178  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40.98 
 
 
166 aa  49.7  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11150  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.14 
 
 
176 aa  49.7  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0216  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.19 
 
 
218 aa  49.7  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1280  PAP2 family protein  32.29 
 
 
185 aa  49.7  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0275929  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1340  phosphoesterase, PA-phosphatase related  26.92 
 
 
204 aa  48.5  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2234  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.2 
 
 
268 aa  48.5  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2099  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.91 
 
 
283 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228285  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2288  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.2 
 
 
205 aa  47.8  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1858  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.21 
 
 
283 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1779  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.21 
 
 
283 aa  47  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00821  phospholipid phosphatase  31.15 
 
 
182 aa  46.6  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00209  phosphoesterase, PA-phosphatase related  43.1 
 
 
172 aa  46.2  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4071  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.97 
 
 
169 aa  46.2  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0983  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  40 
 
 
227 aa  45.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0637  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.84 
 
 
208 aa  45.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1669  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.33 
 
 
202 aa  45.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000273408  normal  0.218841 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2504  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.33 
 
 
331 aa  45.1  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.104215  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0399  phosphatase  35 
 
 
187 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.556092  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3793  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  30.32 
 
 
1261 aa  44.7  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1491  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.52 
 
 
157 aa  44.3  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0940557  normal  0.0672657 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3788  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.37 
 
 
169 aa  44.3  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0532  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.89 
 
 
187 aa  44.3  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2555  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.02 
 
 
271 aa  43.9  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.729938  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0981  hypothetical protein  28.23 
 
 
215 aa  43.9  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0111  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.1 
 
 
174 aa  43.5  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1997  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.93 
 
 
189 aa  43.5  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.34118  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1171  Pap2  30.77 
 
 
207 aa  43.5  0.007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00573838  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1285  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.04 
 
 
192 aa  43.5  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.469864  hitchhiker  0.00228345 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0951  hypothetical protein  28.23 
 
 
215 aa  43.5  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2194  PAP2 family phosphatase  33.75 
 
 
183 aa  43.5  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000351549  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3368  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35 
 
 
176 aa  43.5  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0634  phosphoesterase, PA-phosphatase related  25.68 
 
 
178 aa  43.5  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000602311  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>