86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3031 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_3031  phosphoesterase, PA-phosphatase related  100 
 
 
460 aa  934    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0770809  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2784  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.75 
 
 
442 aa  163  6e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.952787  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1027  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.05 
 
 
437 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.313073  normal  0.124762 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0831  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.29 
 
 
189 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0816  membrane-associated phospholipid phosphatase  37.71 
 
 
189 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0247749 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3191  phosphoesterase PA-phosphatase related  43.26 
 
 
174 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.353726  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1441  PAP2 family protein  42.55 
 
 
175 aa  108  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.24965  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3521  PAP2 family protein  41.84 
 
 
174 aa  107  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.702348  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0835  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.13 
 
 
181 aa  105  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.896282 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3857  PAP2 family protein  36.65 
 
 
175 aa  103  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3641  phosphoesterase PA-phosphatase related  42.18 
 
 
186 aa  102  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.302085  normal  0.062133 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1712  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.75 
 
 
177 aa  102  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0174559  normal  0.195225 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4366  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.53 
 
 
218 aa  91.3  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0817815  normal  0.119091 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0674  phosphoesterase PA-phosphatase related  40 
 
 
174 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3568  phosphoesterase PA-phosphatase related  40 
 
 
174 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3636  phosphoesterase PA-phosphatase related  40 
 
 
174 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00129425  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0774  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.65 
 
 
175 aa  89  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.120064  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0748  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.65 
 
 
175 aa  89  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0445246 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1891  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.24 
 
 
182 aa  88.6  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.161028  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3759  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.29 
 
 
174 aa  88.2  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.226695  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3190  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.31 
 
 
175 aa  87.8  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.276417  hitchhiker  0.000061179 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1765  putative membrane-associated phosphoesterase  35 
 
 
187 aa  84  0.000000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.569407  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0961  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.13 
 
 
166 aa  81.3  0.00000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2324  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.93 
 
 
182 aa  73.6  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.043169  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0572  PAP2 superfamily protein  37.01 
 
 
243 aa  68.9  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.194022 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1899  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.29 
 
 
182 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1773  PAP2 superfamily protein  36.13 
 
 
445 aa  63.2  0.000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05882  hypothetical protein  38.64 
 
 
108 aa  62.4  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4469  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40.57 
 
 
251 aa  62.4  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2185  phosphoesterase PA-phosphatase related  42.22 
 
 
257 aa  61.2  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.303622  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4017  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.84 
 
 
290 aa  60.1  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  0.169945 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1340  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.58 
 
 
249 aa  58.9  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.130328  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1969  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.72 
 
 
253 aa  58.5  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175709  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6959  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  33.33 
 
 
244 aa  57.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.190723  normal  0.122006 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2545  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.21 
 
 
242 aa  57  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1347  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.4 
 
 
392 aa  56.2  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.423681  hitchhiker  0.0000000949183 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2201  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.75 
 
 
208 aa  54.7  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5776  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.58 
 
 
194 aa  53.1  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00125534  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1340  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.46 
 
 
204 aa  53.1  0.000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1840  PAP2 family protein  34.86 
 
 
272 aa  52.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0111  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.29 
 
 
174 aa  52.8  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1491  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.12 
 
 
157 aa  52.4  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0940557  normal  0.0672657 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07660  phospholipid metabolism-related protein, putative  26.87 
 
 
354 aa  52  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0637  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.61 
 
 
208 aa  52  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3912  phosphoesterase PA-phosphatase related  44.59 
 
 
230 aa  51.2  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.703578  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2023  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.48 
 
 
317 aa  51.2  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000204588 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0466  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40 
 
 
207 aa  51.2  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46976  diacylglycerol pyrophosphate phosphatase  25.44 
 
 
361 aa  50.4  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1160  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.34 
 
 
205 aa  50.4  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0607  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.08 
 
 
179 aa  50.1  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00776566  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0806  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.89 
 
 
281 aa  49.7  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.343717  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1441  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  34.44 
 
 
216 aa  48.9  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0216  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.47 
 
 
218 aa  48.9  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1015  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.83 
 
 
265 aa  48.9  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2178  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.56 
 
 
166 aa  48.9  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6735  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  36.26 
 
 
245 aa  48.5  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.418259 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1669  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.58 
 
 
202 aa  47.4  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000273408  normal  0.218841 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0270  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.5 
 
 
246 aa  47.4  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0878  phosphoesterase PA-phosphatase related  30 
 
 
182 aa  47.4  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.749948  hitchhiker  0.002123 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1285  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.68 
 
 
192 aa  47.4  0.0006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.469864  hitchhiker  0.00228345 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4071  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.7 
 
 
169 aa  47.4  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1525  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.28 
 
 
249 aa  46.6  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1011  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.82 
 
 
215 aa  45.8  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.43228  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0399  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.33 
 
 
245 aa  46.6  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149101  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl465  putative phosphatidylglycerophosphatase B  30.63 
 
 
299 aa  46.6  0.001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.330397  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3773  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.94 
 
 
178 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0882252 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3885  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.94 
 
 
178 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0837  membrane-associated phospholipid phosphatase  35.37 
 
 
194 aa  45.8  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000499413  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1778  phosphoesterase, PA-phosphatase related  26.51 
 
 
182 aa  45.1  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4462  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.64 
 
 
224 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0262508  normal  0.313668 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00801  phosphatidylglycerophosphatase B  32.35 
 
 
243 aa  44.7  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00840146  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0918  PAP2 family protein  40.21 
 
 
200 aa  44.7  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.791764  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1037  phosphoesterase PA-phosphatase related  40.21 
 
 
200 aa  44.7  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000361007  hitchhiker  0.00000179156 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1517  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.07 
 
 
281 aa  44.7  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000561151  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0951  hypothetical protein  34.58 
 
 
215 aa  44.3  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1131  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.71 
 
 
198 aa  44.7  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0981  hypothetical protein  34.58 
 
 
215 aa  44.3  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0983  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  41.25 
 
 
227 aa  43.9  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1183  PAP2 family protein; phosphatidylglycerophosphatase B  28.08 
 
 
205 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.200709  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0891  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  34.23 
 
 
199 aa  43.9  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.467652  normal  0.655955 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0568  hypothetical protein  31.91 
 
 
187 aa  43.5  0.008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.237091 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1018  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.33 
 
 
220 aa  43.5  0.008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000250416  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1280  PAP2 family protein  29.2 
 
 
185 aa  43.5  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0275929  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3097  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.53 
 
 
222 aa  43.1  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07455  hypothetical protein  30.36 
 
 
187 aa  43.5  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11150  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.33 
 
 
176 aa  43.1  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>