78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3912 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3912  phosphoesterase PA-phosphatase related  100 
 
 
230 aa  474  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.703578  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6959  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  51.41 
 
 
244 aa  195  6e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.190723  normal  0.122006 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4017  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.7 
 
 
290 aa  138  7.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  0.169945 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1969  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.73 
 
 
253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175709  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2545  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.16 
 
 
242 aa  132  5e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6735  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  40.91 
 
 
245 aa  128  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.418259 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0572  PAP2 superfamily protein  35.15 
 
 
243 aa  122  5e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.194022 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4469  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.03 
 
 
251 aa  119  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1340  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.38 
 
 
249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.130328  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2185  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.78 
 
 
257 aa  112  6e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.303622  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2415  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.27 
 
 
265 aa  107  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0206905  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_002950  PG1773  PAP2 superfamily protein  36.41 
 
 
445 aa  98.2  9e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1712  phosphoesterase, PA-phosphatase related  43.48 
 
 
177 aa  75.1  0.0000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0174559  normal  0.195225 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0961  phosphoesterase, PA-phosphatase related  42.06 
 
 
166 aa  72.4  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0835  phosphoesterase, PA-phosphatase related  42.39 
 
 
181 aa  72  0.000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.896282 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1027  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.08 
 
 
437 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.313073  normal  0.124762 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2784  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.34 
 
 
442 aa  67  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.952787  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1765  putative membrane-associated phosphoesterase  40.66 
 
 
187 aa  64.3  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.569407  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2023  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.75 
 
 
317 aa  63.2  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000204588 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0816  membrane-associated phospholipid phosphatase  28.95 
 
 
189 aa  62.8  0.000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0247749 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3521  PAP2 family protein  35.96 
 
 
174 aa  62  0.000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.702348  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0831  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.82 
 
 
189 aa  62  0.000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1441  PAP2 family protein  37.08 
 
 
175 aa  62  0.000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.24965  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3191  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.08 
 
 
174 aa  61.6  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.353726  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3857  PAP2 family protein  35.87 
 
 
175 aa  60.5  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3641  phosphoesterase PA-phosphatase related  40.28 
 
 
186 aa  56.2  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.302085  normal  0.062133 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1160  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.8 
 
 
205 aa  55.1  0.0000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1891  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.08 
 
 
182 aa  55.1  0.0000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.161028  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3759  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.52 
 
 
174 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.226695  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0674  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.52 
 
 
174 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0748  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.71 
 
 
175 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0445246 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0774  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.71 
 
 
175 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.120064  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3636  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.52 
 
 
174 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00129425  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3568  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.52 
 
 
174 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3190  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.71 
 
 
175 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.276417  hitchhiker  0.000061179 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2216  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.17 
 
 
245 aa  53.9  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.322102 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05882  hypothetical protein  42.03 
 
 
108 aa  53.1  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1340  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.89 
 
 
204 aa  52.8  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0806  phosphoesterase, PA-phosphatase related  26.37 
 
 
281 aa  52.4  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.343717  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5449  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.09 
 
 
284 aa  52  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.961923  normal  0.71434 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1770  glycosyltransferase  37.63 
 
 
812 aa  51.6  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3031  phosphoesterase, PA-phosphatase related  44.59 
 
 
460 aa  51.2  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0770809  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4366  phosphoesterase PA-phosphatase related  42.62 
 
 
218 aa  50.4  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0817815  normal  0.119091 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2178  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.48 
 
 
166 aa  49.7  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1517  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.95 
 
 
281 aa  49.7  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000561151  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3550  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.28 
 
 
278 aa  48.9  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.62844 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0037  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.07 
 
 
272 aa  48.5  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0983  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  38.67 
 
 
227 aa  48.5  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1347  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.41 
 
 
392 aa  48.1  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.423681  hitchhiker  0.0000000949183 
 
 
-
 
NC_013736  Slin_7049  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  24.68 
 
 
287 aa  46.6  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0936  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.34 
 
 
286 aa  47  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1840  PAP2 family protein  37.18 
 
 
272 aa  45.8  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3940  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.73 
 
 
271 aa  45.8  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0010362 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0038  Acid phosphatase  28.18 
 
 
279 aa  45.4  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17079  hitchhiker  0.000164539 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11150  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.8 
 
 
176 aa  45.4  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0466  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.5 
 
 
207 aa  45.4  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0399  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.11 
 
 
245 aa  45.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149101  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3371  membrane-associated phospholipid phosphatase  25.51 
 
 
217 aa  44.7  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.067771 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0216  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.57 
 
 
218 aa  44.7  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0547  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.96 
 
 
261 aa  43.9  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0347407  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0313  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.52 
 
 
305 aa  43.1  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.512715  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1412  phosphoesterase, PA-phosphatase related  25.42 
 
 
263 aa  43.1  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.98368  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4351  phosphoesterase PA-phosphatase related  42.86 
 
 
277 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0110  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.11 
 
 
240 aa  43.1  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0931  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.39 
 
 
189 aa  42.7  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2063  hypothetical protein  36.36 
 
 
178 aa  42.7  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2515  hypothetical protein  28.57 
 
 
296 aa  42.7  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00069207  normal  0.734956 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0637  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.11 
 
 
208 aa  42.4  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0634  phosphoesterase, PA-phosphatase related  25.41 
 
 
178 aa  42.4  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000602311  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4760  phosphoesterase PA-phosphatase related  30 
 
 
279 aa  42  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000169741 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3620  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.71 
 
 
311 aa  42  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000326063 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5776  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.82 
 
 
194 aa  42  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00125534  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4374  phosphoesterase PA-phosphatase related  41.27 
 
 
277 aa  42  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.171887  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1669  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.88 
 
 
202 aa  42  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000273408  normal  0.218841 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3600  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.84 
 
 
171 aa  41.6  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000568068  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0036  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.19 
 
 
273 aa  42  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4003  PAP2 family protein  25.98 
 
 
215 aa  41.6  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000398311 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3793  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  28.57 
 
 
1261 aa  41.6  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>