136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2515 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2515  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  594  1e-169  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00069207  normal  0.734956 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0037  phosphoesterase, PA-phosphatase related  42.59 
 
 		 272 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4761  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.75 
 
 		 280 aa  105  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000159664 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4760  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.33 
 
 		 279 aa  103  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000169741 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0036  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.99 
 
 		 273 aa  94  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3550  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.43 
 
 		 278 aa  88.6  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.62844 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0148  hypothetical protein  34.5 
 
 		 266 aa  82  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1412  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.52 
 
 		 263 aa  79  0.00000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.98368  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1770  glycosyltransferase  38 
 
 		 812 aa  74.7  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0547  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.54 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0347407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1042  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  43.88 
 
 		 282 aa  73.2  0.000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0465  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.55 
 
 		 199 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.451199  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3620  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.81 
 
 		 311 aa  70.5  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000326063 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4447  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.33 
 
 		 274 aa  69.7  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.626562  hitchhiker  0.00229166 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3046  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.64 
 
 		 299 aa  68.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.560501  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0479  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.67 
 
 		 170 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1131  phosphoesterase, PA-phosphatase related  42.71 
 
 		 198 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0918  PAP2 family protein  43.82 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.791764  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1037  phosphoesterase PA-phosphatase related  43.82 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000361007  hitchhiker  0.00000179156 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0634  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.92 
 
 		 178 aa  65.5  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000602311  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11150  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.41 
 
 		 176 aa  65.1  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3788  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.52 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3773  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.33 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0882252 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3885  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.33 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0313  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.12 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.512715  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3097  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.7 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1039  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.57 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2147  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.36 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.913624  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1778  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.05 
 
 		 182 aa  55.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5948  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase /lipoprotein signal peptidase involved in Pb(II) resistance PbrB/C  39.76 
 
 		 358 aa  54.7  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1969  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.47 
 
 		 253 aa  54.7  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175709  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0878  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.18 
 
 		 182 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.749948  hitchhiker  0.002123 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6959  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  31.47 
 
 		 244 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.190723  normal  0.122006 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0111  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.21 
 
 		 174 aa  54.3  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1491  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.07 
 
 		 157 aa  53.5  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0940557  normal  0.0672657 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4017  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.09 
 
 		 290 aa  52.8  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  0.169945 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3806  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.73 
 
 		 438 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2329  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.94 
 
 		 182 aa  51.6  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4071  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.33 
 
 		 169 aa  51.2  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4138  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.24 
 
 		 499 aa  51.2  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3198  PAP2 family protein  40.79 
 
 		 170 aa  51.6  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0463  Undecaprenyl-diphosphatase  36.36 
 
 		 219 aa  50.4  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.282936  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5776  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.66 
 
 		 194 aa  50.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00125534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1243  signal peptidase II  40.74 
 
 		 364 aa  50.4  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1504  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.87 
 
 		 174 aa  50.4  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0219  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.5 
 
 		 219 aa  50.1  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237278 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4580  phosphoesterase, PA-phosphatase related protein  36.72 
 
 		 197 aa  50.1  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.715745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1814  lipoprotein signal peptidase  36.67 
 
 		 358 aa  50.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.344803 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00209  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.78 
 
 		 172 aa  49.7  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0354  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.17 
 
 		 250 aa  49.7  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2288  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.3 
 
 		 205 aa  49.7  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0931  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.75 
 
 		 189 aa  49.3  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0786  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.08 
 
 		 179 aa  48.9  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000027355 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5970  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  26.26 
 
 		 212 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0639  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.58 
 
 		 185 aa  48.9  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.198264  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4831  PAP2 superfamily protein/DedA family protein  32.96 
 
 		 438 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0735581  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3463  lipoprotein signal peptidase  34.02 
 
 		 359 aa  48.1  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4320  signal peptidase II  34.02 
 
 		 359 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3219  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  44.12 
 
 		 230 aa  48.1  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4469  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.31 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0038  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.76 
 
 		 203 aa  48.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013736  Slin_7049  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  27.07 
 
 		 287 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5285  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.35 
 
 		 201 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.965621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1644  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.35 
 
 		 201 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.126989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5353  lipoprotein signal peptidase  33.1 
 
 		 357 aa  47  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00779044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2905  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.37 
 
 		 255 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0983  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  37.5 
 
 		 227 aa  46.6  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2185  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.88 
 
 		 257 aa  46.2  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.303622  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0430  phosphoesterase, PA-phosphatase related  41.67 
 
 		 497 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.647388  normal  0.580984 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0532  phosphoesterase PA-phosphatase related  45.07 
 
 		 187 aa  46.6  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2194  PAP2 family phosphatase  29.34 
 
 		 183 aa  46.2  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000351549  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0891  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  38.89 
 
 		 199 aa  46.2  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.467652  normal  0.655955 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3095  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.04 
 
 		 255 aa  45.8  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2523  PAP2 family protein  27.85 
 
 		 181 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000225597 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0773  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.29 
 
 		 360 aa  45.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3857  PAP2 family protein  36.36 
 
 		 175 aa  45.8  0.0009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2990  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.04 
 
 		 255 aa  45.8  0.0009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2329  PAP2 family protein  27.85 
 
 		 211 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.401849  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2292  phosphatase, PAP2 family protein  27.85 
 
 		 194 aa  45.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000588398  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6735  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  44.44 
 
 		 245 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.418259 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2508  PAP2 family protein  27.85 
 
 		 211 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0824  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.83 
 
 		 241 aa  45.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3371  membrane-associated phospholipid phosphatase  34.23 
 
 		 217 aa  45.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.067771 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3547  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.7 
 
 		 170 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0785734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1712  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.62 
 
 		 177 aa  45.4  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0174559  normal  0.195225 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3891  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.78 
 
 		 170 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.256491  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3290  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.54 
 
 		 171 aa  45.4  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.377201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1888  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  27.61 
 
 		 192 aa  45.4  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.871384  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0449  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.78 
 
 		 170 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4371  DedA:phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.84 
 
 		 438 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.447762 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0399  phosphatase  28.74 
 
 		 187 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.556092  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5027  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.71 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.223489  normal  0.43198 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0119  PA-phosphatase related phosphoesterase  30.23 
 
 		 256 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00406131  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0409  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.19 
 
 		 170 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3721  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.57 
 
 		 170 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.701868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0311  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40.28 
 
 		 497 aa  44.3  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.276922 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0423  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.57 
 
 		 170 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0435  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.63 
 
 		 170 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.3398  hitchhiker  0.00199052 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1103  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.21 
 
 		 175 aa  44.7  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0773  phosphoesterase PA-phosphatase related  35 
 
 		 252 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>