97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1027 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_1027  phosphoesterase, PA-phosphatase related  100 
 
 
437 aa  885    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.313073  normal  0.124762 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2784  phosphoesterase, PA-phosphatase related  59.95 
 
 
442 aa  526  1e-148  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.952787  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3031  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.05 
 
 
460 aa  153  5e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0770809  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0835  phosphoesterase, PA-phosphatase related  43.65 
 
 
181 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.896282 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3191  phosphoesterase PA-phosphatase related  45.95 
 
 
174 aa  139  7e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.353726  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1441  PAP2 family protein  43.5 
 
 
175 aa  139  7e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.24965  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1712  phosphoesterase, PA-phosphatase related  44.16 
 
 
177 aa  134  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0174559  normal  0.195225 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3521  PAP2 family protein  40.35 
 
 
174 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.702348  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3857  PAP2 family protein  43.29 
 
 
175 aa  130  6e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0816  membrane-associated phospholipid phosphatase  39.87 
 
 
189 aa  124  5e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0247749 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0831  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.62 
 
 
189 aa  120  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0748  phosphoesterase, PA-phosphatase related  44.23 
 
 
175 aa  120  6e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0445246 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0774  phosphoesterase, PA-phosphatase related  44.23 
 
 
175 aa  119  7e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.120064  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3190  phosphoesterase, PA-phosphatase related  44.23 
 
 
175 aa  119  9e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.276417  hitchhiker  0.000061179 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3568  phosphoesterase PA-phosphatase related  42.33 
 
 
174 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3636  phosphoesterase PA-phosphatase related  42.33 
 
 
174 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00129425  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0674  phosphoesterase PA-phosphatase related  42.33 
 
 
174 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3759  phosphoesterase PA-phosphatase related  42.33 
 
 
174 aa  118  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.226695  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1891  phosphoesterase, PA-phosphatase related  45.67 
 
 
182 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.161028  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1765  putative membrane-associated phosphoesterase  39.36 
 
 
187 aa  109  9.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.569407  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0961  phosphoesterase, PA-phosphatase related  47.66 
 
 
166 aa  108  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3641  phosphoesterase PA-phosphatase related  51.35 
 
 
186 aa  106  7e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.302085  normal  0.062133 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4366  phosphoesterase PA-phosphatase related  43.71 
 
 
218 aa  100  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0817815  normal  0.119091 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6959  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  36.08 
 
 
244 aa  87.4  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.190723  normal  0.122006 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2185  phosphoesterase PA-phosphatase related  45 
 
 
257 aa  86.3  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.303622  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05882  hypothetical protein  41.58 
 
 
108 aa  82.8  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1969  phosphoesterase, PA-phosphatase related  42.31 
 
 
253 aa  82.8  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175709  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4017  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.93 
 
 
290 aa  79.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  0.169945 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4469  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.12 
 
 
251 aa  78.2  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0572  PAP2 superfamily protein  40.37 
 
 
243 aa  75.5  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.194022 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2545  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.61 
 
 
242 aa  73.6  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1773  PAP2 superfamily protein  38.89 
 
 
445 aa  73.6  0.000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3912  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.08 
 
 
230 aa  70.1  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.703578  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1340  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.23 
 
 
249 aa  68.2  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.130328  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2415  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.66 
 
 
265 aa  63.9  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0206905  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2324  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.2 
 
 
182 aa  63.9  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.043169  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1899  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.13 
 
 
182 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6735  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  37.89 
 
 
245 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.418259 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5776  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.39 
 
 
194 aa  53.5  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00125534  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001653  membrane-associated phospholipid phosphatase  35.59 
 
 
182 aa  53.5  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0981  hypothetical protein  34.23 
 
 
215 aa  53.1  0.000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1347  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.33 
 
 
392 aa  52.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.423681  hitchhiker  0.0000000949183 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0466  phosphoesterase, PA-phosphatase related  45.31 
 
 
207 aa  51.6  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0951  hypothetical protein  34.23 
 
 
215 aa  51.6  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2063  hypothetical protein  33.9 
 
 
178 aa  51.6  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3940  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.09 
 
 
271 aa  51.6  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0010362 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3371  membrane-associated phospholipid phosphatase  32.58 
 
 
217 aa  51.6  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.067771 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2099  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.04 
 
 
283 aa  51.2  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228285  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1517  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.07 
 
 
281 aa  50.4  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000561151  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0216  phosphoesterase PA-phosphatase related  25.58 
 
 
218 aa  50.4  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2178  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.36 
 
 
166 aa  50.1  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1858  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.33 
 
 
283 aa  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2023  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.53 
 
 
317 aa  49.7  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000204588 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1779  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.33 
 
 
283 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1762  hypothetical protein  24.36 
 
 
244 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.566188 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00821  phospholipid phosphatase  31.15 
 
 
182 aa  49.3  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1340  phosphoesterase, PA-phosphatase related  25.56 
 
 
204 aa  48.9  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1840  PAP2 family protein  32.67 
 
 
272 aa  48.5  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2504  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.56 
 
 
331 aa  48.1  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.104215  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00209  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.13 
 
 
172 aa  48.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0891  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  39.6 
 
 
199 aa  47.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.467652  normal  0.655955 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2672  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  32.99 
 
 
191 aa  47.8  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4143  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.63 
 
 
201 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4117  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.63 
 
 
201 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2181  hypothetical protein  33.58 
 
 
269 aa  46.6  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0466384  normal  0.124469 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3198  PAP2 family protein  38.1 
 
 
170 aa  46.6  0.0009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2794  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.71 
 
 
199 aa  46.6  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.755209  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0313  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.68 
 
 
305 aa  46.6  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.512715  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1280  PAP2 family protein  34.12 
 
 
185 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0275929  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1102  phosphatase  35.29 
 
 
185 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0240643  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11150  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.63 
 
 
176 aa  46.6  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3793  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  30.07 
 
 
1261 aa  46.6  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1172  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.71 
 
 
676 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.98006  normal  0.0665428 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0983  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  43.28 
 
 
227 aa  46.2  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2785  bacitracin transport permease  35.44 
 
 
199 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0349348  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2288  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.85 
 
 
205 aa  45.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1491  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.71 
 
 
157 aa  45.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0940557  normal  0.0672657 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1672  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.41 
 
 
244 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2201  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.91 
 
 
208 aa  45.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2366  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.32 
 
 
201 aa  45.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0167377 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0154  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.66 
 
 
249 aa  44.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2053  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.05 
 
 
199 aa  45.1  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.400178  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4071  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.68 
 
 
169 aa  44.7  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0465  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.23 
 
 
199 aa  44.7  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.451199  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3097  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.29 
 
 
222 aa  44.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1669  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.51 
 
 
202 aa  44.3  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000273408  normal  0.218841 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3600  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.76 
 
 
171 aa  44.3  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000568068  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1657  PAP2 superfamily protein  33.01 
 
 
171 aa  43.9  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000234418  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1285  phosphoesterase PA-phosphatase related  40.74 
 
 
192 aa  44.3  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.469864  hitchhiker  0.00228345 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3368  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.65 
 
 
176 aa  43.9  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3788  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.97 
 
 
169 aa  43.9  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0532  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.44 
 
 
187 aa  43.9  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0637  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.78 
 
 
208 aa  43.9  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1699  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.37 
 
 
211 aa  43.5  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2985  PAP2 superfamily protein  44.93 
 
 
175 aa  43.1  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2234  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.35 
 
 
268 aa  43.1  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0399  phosphatase  32.88 
 
 
187 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.556092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>