255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0465 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_0465  phosphoesterase, PA-phosphatase related  100 
 
 
199 aa  402  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.451199  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0479  phosphoesterase, PA-phosphatase related  58.39 
 
 
170 aa  168  4e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0449  phosphoesterase PA-phosphatase related  55.28 
 
 
170 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0423  phosphoesterase PA-phosphatase related  55 
 
 
170 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3891  phosphoesterase PA-phosphatase related  55.28 
 
 
170 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.256491  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0435  phosphoesterase PA-phosphatase related  55 
 
 
170 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.3398  hitchhiker  0.00199052 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3788  phosphoesterase PA-phosphatase related  50.96 
 
 
169 aa  165  5e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0510  phosphoesterase, PA-phosphatase related  52.56 
 
 
170 aa  156  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0532  phosphoesterase PA-phosphatase related  48.31 
 
 
187 aa  155  4e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3547  phosphoesterase, PA-phosphatase related  52.8 
 
 
170 aa  154  9e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0785734  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3721  phosphoesterase, PA-phosphatase related  52.17 
 
 
170 aa  153  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.701868  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0409  phosphoesterase, PA-phosphatase related  53.42 
 
 
170 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4195  PAP2 family protein  54.11 
 
 
170 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3368  phosphoesterase, PA-phosphatase related  50.91 
 
 
176 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3198  PAP2 family protein  49.69 
 
 
170 aa  135  4e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4071  phosphoesterase, PA-phosphatase related  50 
 
 
169 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00209  phosphoesterase, PA-phosphatase related  44.1 
 
 
172 aa  124  6e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00821  phospholipid phosphatase  44.44 
 
 
182 aa  105  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001653  membrane-associated phospholipid phosphatase  42.86 
 
 
182 aa  103  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2063  hypothetical protein  38.99 
 
 
178 aa  102  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3290  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.88 
 
 
171 aa  96.3  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.377201  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2985  PAP2 superfamily protein  36.71 
 
 
175 aa  94  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1657  PAP2 superfamily protein  32.93 
 
 
171 aa  91.3  9e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000234418  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4117  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.06 
 
 
201 aa  89.4  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4143  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.06 
 
 
201 aa  89.4  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1491  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.69 
 
 
157 aa  88.6  6e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0940557  normal  0.0672657 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1897  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  34.23 
 
 
176 aa  77  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4001  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.77 
 
 
200 aa  76.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.794332  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0979  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.03 
 
 
194 aa  75.9  0.0000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000896993 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5776  phosphoesterase PA-phosphatase related  42.86 
 
 
194 aa  73.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00125534  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2515  hypothetical protein  34.55 
 
 
296 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00069207  normal  0.734956 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2011  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  31.41 
 
 
222 aa  70.1  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.235686  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1816  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.13 
 
 
181 aa  70.1  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2304  hypothetical protein  38.41 
 
 
195 aa  68.9  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3773  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.94 
 
 
178 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0882252 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3885  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.94 
 
 
178 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02498  PAP2 superfamily, putative  37 
 
 
138 aa  67.8  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.617835  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1888  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  42.7 
 
 
192 aa  67  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.871384  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2366  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.37 
 
 
201 aa  65.9  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0167377 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3600  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.77 
 
 
171 aa  65.5  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000568068  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1102  phosphatase  36.96 
 
 
185 aa  65.1  0.0000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0240643  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2733  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.53 
 
 
172 aa  64.7  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0786  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.09 
 
 
179 aa  64.3  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000027355 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1280  PAP2 family protein  36.96 
 
 
185 aa  64.3  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0275929  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2288  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.23 
 
 
205 aa  62.8  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0835  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.06 
 
 
181 aa  62  0.000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.896282 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0139  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  35.77 
 
 
187 aa  62  0.000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11150  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.47 
 
 
176 aa  61.2  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4760  phosphoesterase PA-phosphatase related  40.23 
 
 
279 aa  60.8  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000169741 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0111  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.23 
 
 
174 aa  60.1  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09156  hypothetical protein  36.67 
 
 
187 aa  60.1  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.63816  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0817  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.43 
 
 
179 aa  60.5  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2029  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.62 
 
 
200 aa  58.9  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0425  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.23 
 
 
209 aa  58.9  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.41159  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0634  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.29 
 
 
178 aa  57.4  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000602311  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1712  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30 
 
 
177 aa  57.4  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0174559  normal  0.195225 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2329  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.09 
 
 
182 aa  57.8  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0037  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.59 
 
 
272 aa  56.6  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4656  PAP2 family protein  28.66 
 
 
177 aa  56.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5011  PAP2 family protein  28.66 
 
 
177 aa  56.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4880  PAP2 family protein  28.66 
 
 
177 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4588  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.82 
 
 
176 aa  56.2  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4906  PAP2 family protein  28.66 
 
 
177 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4871  PAP2 family protein  28.82 
 
 
177 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0369  PAP2 family protein  28.82 
 
 
177 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.636888  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4494  phosphatidylglycerophosphatase B  28.66 
 
 
177 aa  55.5  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4512  phosphatidylglycerophosphatase B  28.82 
 
 
177 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.113665  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4897  PAP2 family protein  28.66 
 
 
177 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1037  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.24 
 
 
200 aa  54.7  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000361007  hitchhiker  0.00000179156 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0918  PAP2 family protein  29.24 
 
 
200 aa  54.7  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.791764  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1555  phosphoesterase PA-phosphatase related  40.66 
 
 
176 aa  54.7  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2918  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  27.87 
 
 
191 aa  54.7  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.547296  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0001  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.59 
 
 
283 aa  53.9  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0637  phosphoesterase PA-phosphatase related  43.75 
 
 
208 aa  54.3  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0463  Undecaprenyl-diphosphatase  30.97 
 
 
219 aa  53.1  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.282936  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0816  membrane-associated phospholipid phosphatase  31.13 
 
 
189 aa  53.5  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0247749 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0831  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.08 
 
 
189 aa  53.9  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5948  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase /lipoprotein signal peptidase involved in Pb(II) resistance PbrB/C  32.74 
 
 
358 aa  53.1  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07455  hypothetical protein  32.2 
 
 
187 aa  52.8  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2178  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  37.23 
 
 
197 aa  52.4  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.893732  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1775  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.09 
 
 
187 aa  52.8  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1306  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.09 
 
 
225 aa  52  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.420289  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2178  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.78 
 
 
166 aa  52  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0393  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.96 
 
 
219 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0315  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  40.91 
 
 
378 aa  52  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0402  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.96 
 
 
219 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.743036 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0381  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.96 
 
 
219 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.257956  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0036  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.04 
 
 
273 aa  51.6  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1814  lipoprotein signal peptidase  34.4 
 
 
358 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.344803 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3348  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.09 
 
 
186 aa  50.8  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.31592  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2128  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.61 
 
 
199 aa  50.8  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.167938  normal  0.900368 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4138  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.24 
 
 
499 aa  50.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5571  phosphoesterase PA-phosphatase related  43.68 
 
 
194 aa  50.1  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0212028  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1644  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.47 
 
 
201 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.126989  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3387  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.33 
 
 
168 aa  50.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000111833  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0466  phosphoesterase, PA-phosphatase related  42.19 
 
 
207 aa  50.1  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5285  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.47 
 
 
201 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.965621  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1353  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.58 
 
 
201 aa  50.1  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0931  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.23 
 
 
189 aa  50.1  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1669  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.21 
 
 
202 aa  50.1  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000273408  normal  0.218841 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>