More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3198 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_3198  PAP2 family protein  100 
 
 
170 aa  337  4e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3788  phosphoesterase PA-phosphatase related  54.44 
 
 
169 aa  189  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0510  phosphoesterase, PA-phosphatase related  60.59 
 
 
170 aa  180  9.000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0449  phosphoesterase PA-phosphatase related  60 
 
 
170 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0435  phosphoesterase PA-phosphatase related  60 
 
 
170 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.3398  hitchhiker  0.00199052 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3891  phosphoesterase PA-phosphatase related  60 
 
 
170 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.256491  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0423  phosphoesterase PA-phosphatase related  59.41 
 
 
170 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3721  phosphoesterase, PA-phosphatase related  59.41 
 
 
170 aa  176  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.701868  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3368  phosphoesterase, PA-phosphatase related  59.04 
 
 
176 aa  173  9e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0409  phosphoesterase, PA-phosphatase related  56.47 
 
 
170 aa  169  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3547  phosphoesterase, PA-phosphatase related  57.06 
 
 
170 aa  168  3e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0785734  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0532  phosphoesterase PA-phosphatase related  51.69 
 
 
187 aa  167  9e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4195  PAP2 family protein  59.21 
 
 
170 aa  164  5e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0479  phosphoesterase, PA-phosphatase related  52.98 
 
 
170 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0465  phosphoesterase, PA-phosphatase related  49.69 
 
 
199 aa  151  5e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.451199  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4071  phosphoesterase, PA-phosphatase related  54.48 
 
 
169 aa  137  7e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00209  phosphoesterase, PA-phosphatase related  51.94 
 
 
172 aa  123  9e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2063  hypothetical protein  43.59 
 
 
178 aa  114  6e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00821  phospholipid phosphatase  42.24 
 
 
182 aa  114  6.9999999999999995e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001653  membrane-associated phospholipid phosphatase  42.24 
 
 
182 aa  112  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1657  PAP2 superfamily protein  34.59 
 
 
171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000234418  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1491  phosphoesterase, PA-phosphatase related  44.78 
 
 
157 aa  107  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0940557  normal  0.0672657 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3290  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.65 
 
 
171 aa  103  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.377201  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2985  PAP2 superfamily protein  39.74 
 
 
175 aa  101  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5776  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.12 
 
 
194 aa  82.4  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00125534  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2304  hypothetical protein  45.9 
 
 
195 aa  80.1  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0979  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.43 
 
 
194 aa  76.3  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000896993 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3773  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.48 
 
 
178 aa  75.5  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0882252 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3885  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.48 
 
 
178 aa  75.5  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2733  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.76 
 
 
172 aa  73.6  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2011  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  29.01 
 
 
222 aa  72.8  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.235686  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0786  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.31 
 
 
179 aa  71.6  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000027355 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1816  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.09 
 
 
181 aa  70.1  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2366  phosphoesterase PA-phosphatase related  44.94 
 
 
201 aa  69.7  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0167377 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0111  phosphoesterase, PA-phosphatase related  42.53 
 
 
174 aa  69.3  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3600  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.64 
 
 
171 aa  68.6  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000568068  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1897  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  37.41 
 
 
176 aa  68.2  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4117  phosphoesterase PA-phosphatase related  40.48 
 
 
201 aa  68.2  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4143  phosphoesterase PA-phosphatase related  40.48 
 
 
201 aa  68.2  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0634  phosphoesterase, PA-phosphatase related  26.79 
 
 
178 aa  64.7  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000602311  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1280  PAP2 family protein  40.22 
 
 
185 aa  64.3  0.0000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0275929  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0891  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  45.24 
 
 
199 aa  62.8  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.467652  normal  0.655955 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0139  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  34.67 
 
 
187 aa  62.4  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4001  phosphoesterase, PA-phosphatase related  42.06 
 
 
200 aa  61.6  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.794332  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02498  PAP2 superfamily, putative  40 
 
 
138 aa  61.2  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.617835  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0425  phosphoesterase PA-phosphatase related  42.06 
 
 
209 aa  61.2  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.41159  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1102  phosphatase  38.04 
 
 
185 aa  61.2  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0240643  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2288  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.33 
 
 
205 aa  60.1  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0835  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.36 
 
 
181 aa  60.5  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.896282 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2329  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.33 
 
 
182 aa  60.5  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4760  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.04 
 
 
279 aa  59.7  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000169741 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0037  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.36 
 
 
272 aa  59.3  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2178  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  41.94 
 
 
197 aa  58.5  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.893732  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0639  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.32 
 
 
185 aa  56.6  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.198264  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3490  phosphoesterase PA-phosphatase related  44.79 
 
 
197 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139784  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1712  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.93 
 
 
177 aa  56.6  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0174559  normal  0.195225 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00801  phosphatidylglycerophosphatase B  43.75 
 
 
243 aa  55.8  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00840146  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0036  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.29 
 
 
273 aa  55.8  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0816  membrane-associated phospholipid phosphatase  30.51 
 
 
189 aa  55.1  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0247749 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09156  hypothetical protein  34.34 
 
 
187 aa  55.5  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.63816  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0637  phosphoesterase PA-phosphatase related  42.19 
 
 
208 aa  55.1  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1840  PAP2 family protein  38 
 
 
272 aa  55.1  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0206  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  40.62 
 
 
239 aa  54.7  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.456858  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2515  hypothetical protein  29.52 
 
 
296 aa  54.7  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00069207  normal  0.734956 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1888  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  34.09 
 
 
192 aa  54.3  0.0000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.871384  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0831  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.36 
 
 
189 aa  54.3  0.0000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08340  Acid phosphatase/vanadium-dependent haloperoxidase superfamily  36.78 
 
 
439 aa  53.9  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3147  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  48.05 
 
 
218 aa  53.9  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.225101  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3219  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  47.37 
 
 
230 aa  53.1  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2029  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.47 
 
 
200 aa  52.8  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0817  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.2 
 
 
179 aa  52.4  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0466  phosphoesterase, PA-phosphatase related  49.12 
 
 
207 aa  52.4  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2178  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.94 
 
 
166 aa  52.4  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013736  Slin_7049  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  34.69 
 
 
287 aa  52  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1410  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.84 
 
 
187 aa  52  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.163391 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3404  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.43 
 
 
228 aa  51.6  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11150  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.57 
 
 
176 aa  51.2  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2382  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  37.61 
 
 
221 aa  51.2  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000279179  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1555  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.54 
 
 
176 aa  50.8  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1669  phosphoesterase PA-phosphatase related  40 
 
 
202 aa  50.8  0.000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000273408  normal  0.218841 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1347  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.78 
 
 
392 aa  50.8  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.423681  hitchhiker  0.0000000949183 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1644  phosphoesterase PA-phosphatase related  42.25 
 
 
201 aa  50.8  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.126989  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5285  phosphoesterase PA-phosphatase related  42.25 
 
 
201 aa  50.8  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.965621  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1517  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.82 
 
 
281 aa  51.2  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000561151  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1441  PAP2 family protein  35.11 
 
 
175 aa  50.8  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.24965  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1775  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.7 
 
 
187 aa  50.8  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1037  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.68 
 
 
200 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000361007  hitchhiker  0.00000179156 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0983  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  41.67 
 
 
227 aa  50.4  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0219  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.72 
 
 
219 aa  50.4  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237278 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1565  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.21 
 
 
225 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3158  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.77 
 
 
203 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.873511  normal  0.780516 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0918  PAP2 family protein  31.68 
 
 
200 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.791764  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3806  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.58 
 
 
438 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2234  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.89 
 
 
268 aa  49.7  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2554  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.08 
 
 
280 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163921  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07455  hypothetical protein  29.77 
 
 
187 aa  49.7  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2932  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.96 
 
 
203 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal  0.0854276 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4831  PAP2 superfamily protein/DedA family protein  31.48 
 
 
438 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0735581  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1791  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.36 
 
 
225 aa  48.9  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.824897  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1178  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.89 
 
 
294 aa  48.9  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.2963e-23 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>