More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2178 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2178  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  100 
 
 
197 aa  388  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.893732  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5776  phosphoesterase PA-phosphatase related  43.24 
 
 
194 aa  84.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00125534  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2366  phosphoesterase PA-phosphatase related  43.09 
 
 
201 aa  81.6  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0167377 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3788  phosphoesterase PA-phosphatase related  42.22 
 
 
169 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4071  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.46 
 
 
169 aa  72.8  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0510  phosphoesterase, PA-phosphatase related  45.36 
 
 
170 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3290  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.71 
 
 
171 aa  71.6  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.377201  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3600  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.53 
 
 
171 aa  69.3  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000568068  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2029  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.86 
 
 
200 aa  68.6  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1491  phosphoesterase, PA-phosphatase related  41.41 
 
 
157 aa  68.6  0.00000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0940557  normal  0.0672657 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11150  phosphoesterase PA-phosphatase related  30 
 
 
176 aa  67.4  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3387  phosphoesterase PA-phosphatase related  41.57 
 
 
168 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000111833  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0111  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.56 
 
 
174 aa  66.6  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1657  PAP2 superfamily protein  41.3 
 
 
171 aa  67  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000234418  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3198  PAP2 family protein  41.3 
 
 
170 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3721  phosphoesterase, PA-phosphatase related  41.05 
 
 
170 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.701868  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3547  phosphoesterase, PA-phosphatase related  42.11 
 
 
170 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0785734  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0878  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.84 
 
 
182 aa  65.5  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.749948  hitchhiker  0.002123 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1778  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.42 
 
 
182 aa  64.7  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0891  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  43.16 
 
 
199 aa  64.7  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.467652  normal  0.655955 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2011  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  33.33 
 
 
222 aa  64.3  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.235686  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0435  phosphoesterase PA-phosphatase related  40.86 
 
 
170 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.3398  hitchhiker  0.00199052 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1280  PAP2 family protein  35.23 
 
 
185 aa  63.5  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0275929  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0409  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.95 
 
 
170 aa  63.2  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0423  phosphoesterase PA-phosphatase related  40.86 
 
 
170 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1102  phosphatase  35.23 
 
 
185 aa  62.8  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0240643  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0449  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.78 
 
 
170 aa  62  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3891  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.78 
 
 
170 aa  62  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.256491  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00209  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.78 
 
 
172 aa  62  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1888  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  28.17 
 
 
192 aa  62  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.871384  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0634  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.74 
 
 
178 aa  61.2  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000602311  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3318  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.71 
 
 
208 aa  60.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0711194  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1565  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.83 
 
 
225 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0313  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.92 
 
 
305 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.512715  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1525  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.89 
 
 
249 aa  60.8  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3368  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.61 
 
 
176 aa  60.1  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0465  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.23 
 
 
199 aa  60.5  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.451199  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1598  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.67 
 
 
180 aa  60.1  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.970961  hitchhiker  0.00000195096 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0479  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.89 
 
 
170 aa  60.1  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0786  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.4 
 
 
179 aa  59.3  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000027355 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0835  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.68 
 
 
181 aa  58.9  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.896282 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1712  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.58 
 
 
177 aa  58.9  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0174559  normal  0.195225 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2063  hypothetical protein  38.89 
 
 
178 aa  58.5  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2985  PAP2 superfamily protein  39.58 
 
 
175 aa  58.5  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0532  phosphoesterase PA-phosphatase related  41.56 
 
 
187 aa  57.4  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3490  phosphoesterase PA-phosphatase related  46.46 
 
 
197 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139784  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0463  Undecaprenyl-diphosphatase  35.16 
 
 
219 aa  57  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.282936  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07455  hypothetical protein  31.01 
 
 
187 aa  57  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2329  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.59 
 
 
182 aa  56.6  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0637  phosphoesterase PA-phosphatase related  41.67 
 
 
208 aa  57  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1798  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  37.04 
 
 
290 aa  56.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000117501  normal  0.5376 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4760  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.51 
 
 
279 aa  56.2  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000169741 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4143  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.61 
 
 
201 aa  55.8  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4117  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.61 
 
 
201 aa  55.8  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2674  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  38.83 
 
 
184 aa  55.5  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0495  PAP2 superfamily protein  27.91 
 
 
195 aa  55.5  0.0000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02460  PAP2 superfamily protein  43.02 
 
 
188 aa  55.1  0.0000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.457854  normal  0.122911 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1039  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.42 
 
 
183 aa  54.7  0.0000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0154  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.43 
 
 
249 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2672  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  27.64 
 
 
191 aa  53.9  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4138  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36 
 
 
499 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2304  hypothetical protein  35.09 
 
 
195 aa  53.1  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0037  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.51 
 
 
272 aa  53.1  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1441  PAP2 family protein  33.33 
 
 
175 aa  52.8  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.24965  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0036  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.61 
 
 
273 aa  53.1  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1234  diacylglycerol kinase  44.87 
 
 
235 aa  52.8  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00801  phosphatidylglycerophosphatase B  37.37 
 
 
243 aa  52.8  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00840146  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0918  PAP2 family protein  38.54 
 
 
200 aa  52.8  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.791764  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3529  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.06 
 
 
361 aa  52.8  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.938289  normal  0.0139793 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0568  hypothetical protein  37.18 
 
 
187 aa  53.1  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.237091 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1037  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.54 
 
 
200 aa  52.8  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000361007  hitchhiker  0.00000179156 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0311  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.81 
 
 
497 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.276922 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4656  PAP2 family protein  25.32 
 
 
177 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5011  PAP2 family protein  25.32 
 
 
177 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4880  PAP2 family protein  25.32 
 
 
177 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001653  membrane-associated phospholipid phosphatase  35.63 
 
 
182 aa  52.4  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3885  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.69 
 
 
178 aa  52  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00821  phospholipid phosphatase  33.72 
 
 
182 aa  52.4  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3773  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.69 
 
 
178 aa  52  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0882252 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0119  PA-phosphatase related phosphoesterase  36.52 
 
 
256 aa  52.4  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00406131  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2794  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.93 
 
 
199 aa  52.4  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.755209  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0394  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.14 
 
 
496 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0382  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.14 
 
 
496 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.464112 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0403  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.14 
 
 
496 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0315  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.32 
 
 
320 aa  51.6  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1555  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.75 
 
 
176 aa  51.6  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08340  Acid phosphatase/vanadium-dependent haloperoxidase superfamily  34.69 
 
 
439 aa  51.6  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0139  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  35.16 
 
 
187 aa  50.8  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2759  bacitracin transport permease protein bcrc  31.71 
 
 
199 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0828321  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2288  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.23 
 
 
205 aa  50.8  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5915  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.89 
 
 
249 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.322864  normal  0.445191 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2555  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.34 
 
 
271 aa  50.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.729938  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0430  phosphoesterase, PA-phosphatase related  44.78 
 
 
497 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.647388  normal  0.580984 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0315  membrane-associated phospholipid phosphatase  31.48 
 
 
216 aa  50.4  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.770739  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2785  bacitracin transport permease  31.71 
 
 
199 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0349348  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2515  hypothetical protein  32.73 
 
 
296 aa  50.1  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00069207  normal  0.734956 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4104  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.32 
 
 
257 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2461  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.14 
 
 
254 aa  50.1  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0369  PAP2 family protein  24.68 
 
 
177 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.636888  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4588  phosphoesterase PA-phosphatase related  24.05 
 
 
176 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>