192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4195 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4195  PAP2 family protein  100 
 
 		 170 aa  343  8.999999999999999e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3547  phosphoesterase, PA-phosphatase related  90.59 
 
 		 170 aa  293  7e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0785734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0409  phosphoesterase, PA-phosphatase related  90 
 
 		 170 aa  291  2e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3721  phosphoesterase, PA-phosphatase related  87.65 
 
 		 170 aa  287  4e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.701868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0435  phosphoesterase PA-phosphatase related  85.29 
 
 		 170 aa  276  8e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.3398  hitchhiker  0.00199052 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0423  phosphoesterase PA-phosphatase related  84.71 
 
 		 170 aa  275  2e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3891  phosphoesterase PA-phosphatase related  84.71 
 
 		 170 aa  274  3e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.256491  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0449  phosphoesterase PA-phosphatase related  84.71 
 
 		 170 aa  274  3e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0510  phosphoesterase, PA-phosphatase related  80 
 
 		 170 aa  260  6e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0479  phosphoesterase, PA-phosphatase related  64.24 
 
 		 170 aa  195  3e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3788  phosphoesterase PA-phosphatase related  53.25 
 
 		 169 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0532  phosphoesterase PA-phosphatase related  50.28 
 
 		 187 aa  173  9e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3198  PAP2 family protein  57.65 
 
 		 170 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0465  phosphoesterase, PA-phosphatase related  53.12 
 
 		 199 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.451199  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3368  phosphoesterase, PA-phosphatase related  55.75 
 
 		 176 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4071  phosphoesterase, PA-phosphatase related  47.13 
 
 		 169 aa  131  5e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00209  phosphoesterase, PA-phosphatase related  43.03 
 
 		 172 aa  126  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1657  PAP2 superfamily protein  40.25 
 
 		 171 aa  115  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000234418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00821  phospholipid phosphatase  51.49 
 
 		 182 aa  114  6.9999999999999995e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2063  hypothetical protein  47.41 
 
 		 178 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001653  membrane-associated phospholipid phosphatase  47.37 
 
 		 182 aa  106  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2985  PAP2 superfamily protein  41.3 
 
 		 175 aa  99.8  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3290  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.99 
 
 		 171 aa  99.4  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.377201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1491  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.32 
 
 		 157 aa  96.3  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0940557  normal  0.0672657 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4117  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.11 
 
 		 201 aa  84  9e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4143  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.11 
 
 		 201 aa  84  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1897  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  38.69 
 
 		 176 aa  76.6  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2366  phosphoesterase PA-phosphatase related  45.1 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0167377 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3600  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.75 
 
 		 171 aa  73.6  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000568068  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0425  phosphoesterase PA-phosphatase related  41.67 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.41159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4001  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.48 
 
 		 200 aa  72  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.794332  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5776  phosphoesterase PA-phosphatase related  41.94 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00125534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0786  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.52 
 
 		 179 aa  67.8  0.00000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000027355 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0979  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.33 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000896993 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2011  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  24.84 
 
 		 222 aa  65.1  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.235686  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2733  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.85 
 
 		 172 aa  65.1  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2304  hypothetical protein  36.59 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1816  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.91 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2288  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.11 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0111  phosphoesterase, PA-phosphatase related  41.94 
 
 		 174 aa  62  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02498  PAP2 superfamily, putative  36.46 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.617835  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2329  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.12 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1280  PAP2 family protein  38.04 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0275929  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3885  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.3 
 
 		 178 aa  57.8  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3773  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.3 
 
 		 178 aa  57.8  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0882252 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2178  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  41.67 
 
 		 197 aa  57  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.893732  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09156  hypothetical protein  36.56 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.63816  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2128  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.58 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.167938  normal  0.900368 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1102  phosphatase  28.48 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0240643  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1888  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  38.64 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.871384  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0634  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.33 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000602311  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0607  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.44 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00776566  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1410  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.07 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.163391 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3404  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.43 
 
 		 228 aa  54.3  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0466  phosphoesterase, PA-phosphatase related  46.15 
 
 		 207 aa  53.9  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2029  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32 
 
 		 200 aa  53.5  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11150  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.29 
 
 		 176 aa  53.1  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0639  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.09 
 
 		 185 aa  53.1  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.198264  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0139  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  28.57 
 
 		 187 aa  52.8  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1555  phosphoesterase PA-phosphatase related  44.44 
 
 		 176 aa  52.4  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0817  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.96 
 
 		 179 aa  52  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0037  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.31 
 
 		 272 aa  51.2  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1791  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.25 
 
 		 225 aa  51.2  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.824897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0637  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.32 
 
 		 208 aa  50.8  0.000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2317  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  30.94 
 
 		 187 aa  50.8  0.000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0891  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  36.94 
 
 		 199 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.467652  normal  0.655955 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1565  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.76 
 
 		 225 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4371  DedA:phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.63 
 
 		 438 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.447762 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3059  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.14 
 
 		 533 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0835  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.33 
 
 		 181 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.896282 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2554  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.29 
 
 		 280 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1504  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.35 
 
 		 174 aa  48.9  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0430  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.91 
 
 		 497 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.647388  normal  0.580984 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0422  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.97 
 
 		 192 aa  48.5  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0315  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  39.08 
 
 		 378 aa  48.5  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2515  hypothetical protein  30 
 
 		 296 aa  48.5  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00069207  normal  0.734956 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2382  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  31.58 
 
 		 221 aa  48.5  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000279179  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3490  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.86 
 
 		 197 aa  48.5  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4760  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.74 
 
 		 279 aa  48.1  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000169741 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2147  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.93 
 
 		 178 aa  47.8  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.913624  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00801  phosphatidylglycerophosphatase B  39.53 
 
 		 243 aa  47.8  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00840146  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2178  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.91 
 
 		 166 aa  47.8  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11960  hypothetical protein  38.04 
 
 		 437 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0023163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1775  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.07 
 
 		 187 aa  47.4  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4831  PAP2 superfamily protein/DedA family protein  35.48 
 
 		 438 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0735581  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5863  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  36.9 
 
 		 168 aa  47  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1098  hypothetical protein  38.04 
 
 		 437 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000441733  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1015  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.64 
 
 		 265 aa  47.4  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0983  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  41.54 
 
 		 227 aa  46.6  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3158  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.4 
 
 		 203 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.873511  normal  0.780516 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3348  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.67 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.31592  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2444  hypothetical protein  36.17 
 
 		 216 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0113795  normal  0.0207864 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0219  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.35 
 
 		 219 aa  46.2  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237278 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0036  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.95 
 
 		 273 aa  46.2  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07455  hypothetical protein  31.43 
 
 		 187 aa  46.2  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3806  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.23 
 
 		 438 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2932  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.23 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal  0.0854276 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0024  membrane-associated phospholipid phosphatase  45 
 
 		 510 aa  45.8  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0001  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.33 
 
 		 283 aa  45.8  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2785  bacitracin transport permease  44.83 
 
 		 199 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0349348  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>