237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0479 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_0479  phosphoesterase, PA-phosphatase related  100 
 
 
170 aa  345  1e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0435  phosphoesterase PA-phosphatase related  67.9 
 
 
170 aa  198  3e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.3398  hitchhiker  0.00199052 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0423  phosphoesterase PA-phosphatase related  67.28 
 
 
170 aa  197  7e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0449  phosphoesterase PA-phosphatase related  67.28 
 
 
170 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0409  phosphoesterase, PA-phosphatase related  65.43 
 
 
170 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3891  phosphoesterase PA-phosphatase related  67.28 
 
 
170 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.256491  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3547  phosphoesterase, PA-phosphatase related  65.43 
 
 
170 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0785734  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3721  phosphoesterase, PA-phosphatase related  64.81 
 
 
170 aa  192  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.701868  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0510  phosphoesterase, PA-phosphatase related  63.86 
 
 
170 aa  191  6e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3788  phosphoesterase PA-phosphatase related  54.44 
 
 
169 aa  184  4e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0465  phosphoesterase, PA-phosphatase related  58.39 
 
 
199 aa  184  6e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.451199  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4195  PAP2 family protein  64.86 
 
 
170 aa  179  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3198  PAP2 family protein  52.35 
 
 
170 aa  160  9e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0532  phosphoesterase PA-phosphatase related  46.33 
 
 
187 aa  154  8e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3368  phosphoesterase, PA-phosphatase related  52.69 
 
 
176 aa  152  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4071  phosphoesterase, PA-phosphatase related  42.24 
 
 
169 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00209  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40.88 
 
 
172 aa  126  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2063  hypothetical protein  40.12 
 
 
178 aa  123  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1657  PAP2 superfamily protein  39.24 
 
 
171 aa  115  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000234418  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00821  phospholipid phosphatase  41.51 
 
 
182 aa  115  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001653  membrane-associated phospholipid phosphatase  43.94 
 
 
182 aa  108  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2985  PAP2 superfamily protein  36.9 
 
 
175 aa  104  5e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3290  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.61 
 
 
171 aa  103  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.377201  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1491  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.81 
 
 
157 aa  95.5  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0940557  normal  0.0672657 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3600  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.13 
 
 
171 aa  82  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000568068  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4143  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.75 
 
 
201 aa  80.9  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4117  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.75 
 
 
201 aa  80.9  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2733  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.17 
 
 
172 aa  79.3  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0979  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.88 
 
 
194 aa  79  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000896993 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4001  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.75 
 
 
200 aa  75.1  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.794332  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1897  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  34.27 
 
 
176 aa  74.3  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0634  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.07 
 
 
178 aa  73.6  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000602311  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3773  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.86 
 
 
178 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0882252 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3885  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.86 
 
 
178 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5776  phosphoesterase PA-phosphatase related  43.62 
 
 
194 aa  72.4  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00125534  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0111  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.12 
 
 
174 aa  71.6  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2515  hypothetical protein  36.94 
 
 
296 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00069207  normal  0.734956 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0425  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.84 
 
 
209 aa  71.2  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.41159  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02498  PAP2 superfamily, putative  39.36 
 
 
138 aa  67.8  0.00000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.617835  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0786  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.59 
 
 
179 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000027355 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2329  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.82 
 
 
182 aa  67  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0139  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  31.93 
 
 
187 aa  63.5  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0037  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.35 
 
 
272 aa  63.9  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1816  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.8 
 
 
181 aa  62.8  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2366  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.83 
 
 
201 aa  62  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0167377 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2304  hypothetical protein  34.75 
 
 
195 aa  61.2  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4760  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.63 
 
 
279 aa  60.5  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000169741 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11150  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.21 
 
 
176 aa  59.3  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2011  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  26.71 
 
 
222 aa  59.7  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.235686  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1555  phosphoesterase PA-phosphatase related  43.18 
 
 
176 aa  60.1  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0817  phosphoesterase PA-phosphatase related  41.25 
 
 
179 aa  58.9  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2288  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.33 
 
 
205 aa  59.3  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1280  PAP2 family protein  34.78 
 
 
185 aa  58.5  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0275929  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2029  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.71 
 
 
200 aa  57.8  0.00000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0430  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.62 
 
 
497 aa  57.4  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.647388  normal  0.580984 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0466  phosphoesterase, PA-phosphatase related  45.31 
 
 
207 aa  57.4  0.00000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0835  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.04 
 
 
181 aa  57.4  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.896282 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1102  phosphatase  32.61 
 
 
185 aa  55.5  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0240643  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0637  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.07 
 
 
208 aa  55.5  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09156  hypothetical protein  33.7 
 
 
187 aa  54.7  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.63816  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0639  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.03 
 
 
185 aa  54.7  0.0000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.198264  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1410  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.36 
 
 
187 aa  54.7  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.163391 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3490  phosphoesterase PA-phosphatase related  45.83 
 
 
197 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139784  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0311  phosphoesterase, PA-phosphatase related  49.21 
 
 
497 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.276922 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2382  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  38.82 
 
 
221 aa  53.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000279179  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2178  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  38.54 
 
 
197 aa  53.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.893732  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0607  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.61 
 
 
179 aa  52.8  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00776566  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0315  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  33.05 
 
 
378 aa  52  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1791  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.21 
 
 
225 aa  52  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.824897  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0024  membrane-associated phospholipid phosphatase  45.28 
 
 
510 aa  51.6  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1888  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  34.09 
 
 
192 aa  51.2  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.871384  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0983  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  40 
 
 
227 aa  51.2  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1840  PAP2 family protein  37.08 
 
 
272 aa  50.8  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2128  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.83 
 
 
199 aa  50.8  0.000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.167938  normal  0.900368 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0036  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30 
 
 
273 aa  50.8  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0463  Undecaprenyl-diphosphatase  27.65 
 
 
219 aa  50.1  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.282936  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00801  phosphatidylglycerophosphatase B  40 
 
 
243 aa  50.1  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00840146  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3387  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.18 
 
 
168 aa  50.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000111833  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4138  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40.91 
 
 
499 aa  50.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0891  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  46.55 
 
 
199 aa  50.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.467652  normal  0.655955 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0816  membrane-associated phospholipid phosphatase  32.46 
 
 
189 aa  49.7  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0247749 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2570  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  35.58 
 
 
209 aa  49.7  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.501729  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2918  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  30.43 
 
 
191 aa  49.7  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.547296  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3059  phosphoesterase, PA-phosphatase related  41.67 
 
 
533 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2554  phosphoesterase, PA-phosphatase related  47.37 
 
 
280 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163921  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0831  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.66 
 
 
189 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1669  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.69 
 
 
202 aa  49.7  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000273408  normal  0.218841 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3348  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.98 
 
 
186 aa  49.7  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.31592  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0001  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.28 
 
 
283 aa  49.3  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1775  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.33 
 
 
187 aa  49.3  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1353  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.89 
 
 
201 aa  48.9  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2317  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  28.24 
 
 
187 aa  49.3  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0394  phosphoesterase, PA-phosphatase related  52.63 
 
 
496 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0231  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.41 
 
 
238 aa  48.9  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0403  phosphoesterase, PA-phosphatase related  52.63 
 
 
496 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0382  phosphoesterase, PA-phosphatase related  52.63 
 
 
496 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.464112 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07455  hypothetical protein  32.04 
 
 
187 aa  49.3  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1125  phosphoesterase, PA-phosphatase related  48.33 
 
 
245 aa  48.5  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.223896  hitchhiker  0.00699955 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0243  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  27.33 
 
 
237 aa  47.8  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0354  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.41 
 
 
250 aa  47.8  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>