More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3885 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010678  Rpic_3773  phosphoesterase PA-phosphatase related  100 
 
 
178 aa  358  2e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0882252 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3885  phosphoesterase PA-phosphatase related  100 
 
 
178 aa  358  2e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2733  phosphoesterase PA-phosphatase related  48.21 
 
 
172 aa  147  7e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0786  phosphoesterase, PA-phosphatase related  49.06 
 
 
179 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000027355 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2329  phosphoesterase, PA-phosphatase related  49.08 
 
 
182 aa  142  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02498  PAP2 superfamily, putative  57.25 
 
 
138 aa  136  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.617835  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0979  phosphoesterase, PA-phosphatase related  44.1 
 
 
194 aa  128  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000896993 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0817  phosphoesterase PA-phosphatase related  53.42 
 
 
179 aa  125  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0139  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  41.67 
 
 
187 aa  124  8.000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1897  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  42.94 
 
 
176 aa  117  6e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1816  phosphoesterase, PA-phosphatase related  43.66 
 
 
181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00209  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.32 
 
 
172 aa  83.2  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0634  phosphoesterase, PA-phosphatase related  26.06 
 
 
178 aa  82  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000602311  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3290  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.17 
 
 
171 aa  80.1  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.377201  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1491  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.57 
 
 
157 aa  80.1  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0940557  normal  0.0672657 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2985  PAP2 superfamily protein  37.24 
 
 
175 aa  78.2  0.00000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4071  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.77 
 
 
169 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11150  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.1 
 
 
176 aa  75.5  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2011  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  29.76 
 
 
222 aa  74.3  0.0000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.235686  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4656  PAP2 family protein  31.41 
 
 
177 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5011  PAP2 family protein  31.41 
 
 
177 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4880  PAP2 family protein  31.41 
 
 
177 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4494  phosphatidylglycerophosphatase B  32.05 
 
 
177 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4897  PAP2 family protein  32.05 
 
 
177 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4906  PAP2 family protein  32.05 
 
 
177 aa  72  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4143  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.62 
 
 
201 aa  72  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4117  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.62 
 
 
201 aa  72  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4871  PAP2 family protein  31.41 
 
 
177 aa  72  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0369  PAP2 family protein  31.41 
 
 
177 aa  72  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.636888  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4512  phosphatidylglycerophosphatase B  31.41 
 
 
177 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.113665  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2304  hypothetical protein  36.29 
 
 
195 aa  68.9  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0111  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.7 
 
 
174 aa  69.3  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4001  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.62 
 
 
200 aa  68.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.794332  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0639  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.01 
 
 
185 aa  68.6  0.00000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.198264  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4588  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.52 
 
 
176 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3600  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.61 
 
 
171 aa  67  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000568068  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0465  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.94 
 
 
199 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.451199  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4138  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.55 
 
 
499 aa  67  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001653  membrane-associated phospholipid phosphatase  32.26 
 
 
182 aa  67.4  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1555  phosphoesterase PA-phosphatase related  43.02 
 
 
176 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0425  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.29 
 
 
209 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.41159  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0219  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.17 
 
 
219 aa  64.7  0.0000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237278 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0532  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.25 
 
 
187 aa  64.3  0.0000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0313  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.09 
 
 
305 aa  63.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.512715  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1102  phosphatase  31.01 
 
 
185 aa  63.9  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0240643  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3788  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.27 
 
 
169 aa  63.5  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1280  PAP2 family protein  34.55 
 
 
185 aa  63.2  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0275929  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0479  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.29 
 
 
170 aa  63.2  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3368  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.78 
 
 
176 aa  63.2  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3198  PAP2 family protein  36.48 
 
 
170 aa  63.5  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0037  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.56 
 
 
272 aa  62.8  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0891  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  34.17 
 
 
199 aa  61.6  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.467652  normal  0.655955 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0983  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  35.71 
 
 
227 aa  61.6  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5776  phosphoesterase PA-phosphatase related  42.71 
 
 
194 aa  61.2  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00125534  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1657  PAP2 superfamily protein  32.74 
 
 
171 aa  60.8  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000234418  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0878  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.53 
 
 
182 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.749948  hitchhiker  0.002123 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2515  hypothetical protein  33.33 
 
 
296 aa  59.3  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00069207  normal  0.734956 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1037  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.49 
 
 
200 aa  59.3  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000361007  hitchhiker  0.00000179156 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0918  PAP2 family protein  27.49 
 
 
200 aa  59.3  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.791764  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2063  hypothetical protein  33.33 
 
 
178 aa  58.9  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4760  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.71 
 
 
279 aa  58.9  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000169741 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22000  sphingosine/diacylglycerol kinase-like enzyme  31.82 
 
 
480 aa  58.5  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00559373  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0206  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  35.48 
 
 
239 aa  58.5  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.456858  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0036  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.11 
 
 
273 aa  58.2  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1525  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.72 
 
 
249 aa  57.8  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5948  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase /lipoprotein signal peptidase involved in Pb(II) resistance PbrB/C  35.35 
 
 
358 aa  57.8  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3806  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.26 
 
 
438 aa  57  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2201  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.75 
 
 
208 aa  56.6  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2178  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.57 
 
 
166 aa  56.6  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3657  phosphatidylglycerophosphatase  44.59 
 
 
271 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0364  phosphatidylglycerophosphatase  44.59 
 
 
265 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1243  signal peptidase II  35.42 
 
 
364 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3997  phosphoesterase PA-phosphatase related  43.24 
 
 
285 aa  55.8  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3920  phosphoesterase PA-phosphatase related  43.24 
 
 
260 aa  55.8  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4113  phosphoesterase PA-phosphatase related  43.24 
 
 
285 aa  55.8  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0501  phosphoesterase PA-phosphatase related  25.56 
 
 
222 aa  55.8  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0369  phosphatidylglycerophosphatase  44.59 
 
 
274 aa  55.8  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1778  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.7 
 
 
182 aa  56.2  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0510  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.82 
 
 
170 aa  55.8  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00821  phospholipid phosphatase  29.03 
 
 
182 aa  55.5  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1098  hypothetical protein  36.54 
 
 
437 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000441733  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1669  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.7 
 
 
202 aa  55.1  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000273408  normal  0.218841 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3550  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.46 
 
 
278 aa  55.1  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.62844 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11960  hypothetical protein  36.19 
 
 
437 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0023163  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3721  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.68 
 
 
170 aa  54.7  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.701868  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3147  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  35.81 
 
 
218 aa  54.3  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.225101  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4335  phosphatidylglycerophosphatase B, putative  41.89 
 
 
260 aa  54.3  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2554  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.08 
 
 
280 aa  54.3  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163921  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4020  phosphoesterase PA-phosphatase related  41.89 
 
 
285 aa  54.3  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2366  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.08 
 
 
201 aa  53.9  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0167377 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1412  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.45 
 
 
263 aa  53.5  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.98368  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2317  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  30.46 
 
 
187 aa  53.1  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3547  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.1 
 
 
170 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0785734  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0409  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.1 
 
 
170 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3215  Sphingosine kinase-like protein  34.52 
 
 
506 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1131  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.61 
 
 
198 aa  52.4  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0382  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.92 
 
 
496 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.464112 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0394  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.92 
 
 
496 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3348  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.19 
 
 
186 aa  52.8  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.31592  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0403  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.92 
 
 
496 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.443044 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>