215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0918 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_1037  phosphoesterase PA-phosphatase related  100 
 
 
200 aa  393  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000361007  hitchhiker  0.00000179156 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0918  PAP2 family protein  100 
 
 
200 aa  393  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.791764  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1131  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.36 
 
 
198 aa  87  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3463  lipoprotein signal peptidase  34.12 
 
 
359 aa  81.3  0.000000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4320  signal peptidase II  34.12 
 
 
359 aa  81.3  0.000000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5948  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase /lipoprotein signal peptidase involved in Pb(II) resistance PbrB/C  36.13 
 
 
358 aa  78.2  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1644  phosphoesterase PA-phosphatase related  48.45 
 
 
201 aa  75.9  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.126989  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5353  lipoprotein signal peptidase  37.17 
 
 
357 aa  75.9  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00779044  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5285  phosphoesterase PA-phosphatase related  48.45 
 
 
201 aa  75.9  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.965621  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0037  phosphoesterase, PA-phosphatase related  43.56 
 
 
272 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0983  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  33.52 
 
 
227 aa  72.4  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0036  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.39 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2515  hypothetical protein  43 
 
 
296 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00069207  normal  0.734956 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1814  lipoprotein signal peptidase  34.64 
 
 
358 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.344803 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1504  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.69 
 
 
174 aa  67.8  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4760  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.6 
 
 
279 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000169741 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3550  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.64 
 
 
278 aa  65.5  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.62844 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1243  signal peptidase II  41.67 
 
 
364 aa  64.3  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4761  phosphoesterase PA-phosphatase related  45.65 
 
 
280 aa  63.9  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000159664 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0931  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.12 
 
 
189 aa  63.2  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1042  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  42.16 
 
 
282 aa  63.5  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1412  phosphoesterase, PA-phosphatase related  41 
 
 
263 aa  62  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.98368  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3773  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.27 
 
 
178 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0882252 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3885  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.27 
 
 
178 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0465  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.31 
 
 
199 aa  57  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.451199  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0634  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.88 
 
 
178 aa  57  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000602311  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0878  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.86 
 
 
182 aa  56.6  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.749948  hitchhiker  0.002123 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2147  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.24 
 
 
178 aa  56.2  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.913624  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4071  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.35 
 
 
169 aa  52.8  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0148  hypothetical protein  29.71 
 
 
266 aa  53.1  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1491  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.56 
 
 
157 aa  53.1  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0940557  normal  0.0672657 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3290  phosphoesterase PA-phosphatase related  37 
 
 
171 aa  52.8  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.377201  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0891  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  42.17 
 
 
199 aa  52  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.467652  normal  0.655955 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0466  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.65 
 
 
207 aa  52  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1778  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.89 
 
 
182 aa  52  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3097  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.12 
 
 
222 aa  51.6  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2226  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  36.73 
 
 
198 aa  51.6  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2011  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  29.14 
 
 
222 aa  51.6  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.235686  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0547  phosphoesterase PA-phosphatase related  36 
 
 
261 aa  51.6  0.000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0347407  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0961  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.94 
 
 
166 aa  50.8  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2029  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.89 
 
 
200 aa  51.2  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0979  phosphoesterase PA-phosphatase-like protein  25.6 
 
 
253 aa  50.8  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.626703  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0111  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.71 
 
 
174 aa  51.2  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00209  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.35 
 
 
172 aa  51.2  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0463  Undecaprenyl-diphosphatase  30.17 
 
 
219 aa  50.1  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.282936  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02460  PAP2 superfamily protein  30.82 
 
 
188 aa  50.1  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.457854  normal  0.122911 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5776  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.38 
 
 
194 aa  50.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00125534  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3620  phosphoesterase PA-phosphatase related  40.21 
 
 
311 aa  50.4  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000326063 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1375  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.63 
 
 
273 aa  50.1  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2635  bacitracin transport permease protein bcrc  34.23 
 
 
199 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000183943 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1093  membrane-associated phospholipid phosphatase  35.29 
 
 
218 aa  50.4  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00170585  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0425  undecaprenyl-diphosphatase  42.47 
 
 
203 aa  50.1  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0037  PAP2 family protein  35.4 
 
 
245 aa  50.4  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3318  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.51 
 
 
208 aa  49.7  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0711194  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0021  PAP2 family protein  36.62 
 
 
220 aa  49.7  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.42598  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0639  phosphoesterase PA-phosphatase related  25.62 
 
 
185 aa  49.7  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.198264  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4447  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.46 
 
 
274 aa  49.7  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.626562  hitchhiker  0.00229166 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3788  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.58 
 
 
169 aa  48.9  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2676  bacitracin transport permease protein bcrc  35 
 
 
199 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1565  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.48 
 
 
225 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0450  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  30.86 
 
 
205 aa  48.5  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4462  phosphoesterase PA-phosphatase related  35 
 
 
224 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0262508  normal  0.313668 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3582  PAP2 superfamily protein  50 
 
 
355 aa  48.5  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.165219  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2844  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.33 
 
 
252 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.651448  normal  0.825053 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3198  PAP2 family protein  36.76 
 
 
170 aa  48.5  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2430  PAP2 family protein  35.06 
 
 
199 aa  48.1  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000481219  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2391  bacitracin transport permease, PAP2 family protein  32.35 
 
 
199 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.193299  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2665  bacitracin transport permease, PAP2 family protein  35.06 
 
 
199 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000160204 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2716  bacitracin transport permease, PAP2 family protein  32.35 
 
 
199 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.179676  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0979  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.14 
 
 
194 aa  48.1  0.00008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000896993 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5027  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.23 
 
 
255 aa  48.1  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.223489  normal  0.43198 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2678  Pap2 superfamily protein, putative  33.03 
 
 
199 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0129761  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2194  PAP2 family phosphatase  40 
 
 
183 aa  47.4  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000351549  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2366  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.99 
 
 
201 aa  48.1  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0167377 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5915  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.38 
 
 
249 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.322864  normal  0.445191 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0572  PAP2 superfamily protein  39.29 
 
 
243 aa  47.4  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.194022 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0315  membrane-associated phospholipid phosphatase  34.29 
 
 
216 aa  47.8  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.770739  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0637  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.02 
 
 
208 aa  47.8  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5571  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.63 
 
 
194 aa  47.4  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0212028  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1039  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.71 
 
 
183 aa  47.8  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1791  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.59 
 
 
225 aa  46.6  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.824897  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2520  phosphoesterase PA-phosphatase related  50 
 
 
197 aa  47.4  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.948455  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3490  phosphoesterase PA-phosphatase related  40.54 
 
 
197 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139784  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4117  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.95 
 
 
201 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4143  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.95 
 
 
201 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07455  hypothetical protein  34.09 
 
 
187 aa  47.4  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2794  phosphoesterase PA-phosphatase related  45.59 
 
 
199 aa  47  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.755209  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2918  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  37.78 
 
 
191 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.547296  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4813  PAP2 family protein/DedA family protein  37.08 
 
 
438 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.609495 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0484  hypothetical protein  37.65 
 
 
223 aa  46.6  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6892  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.59 
 
 
251 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.757531 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0786  phosphoesterase, PA-phosphatase related  41.11 
 
 
179 aa  46.2  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000027355 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5310  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.65 
 
 
193 aa  46.6  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0608  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.45 
 
 
438 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4866  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.08 
 
 
438 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.374239  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2329  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.87 
 
 
182 aa  46.2  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9017  phosphoesterase PA-phosphatase related  41.54 
 
 
232 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.191273 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3368  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.63 
 
 
176 aa  46.2  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4688  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.08 
 
 
438 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2759  bacitracin transport permease protein bcrc  41.18 
 
 
199 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0828321  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>