225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1412 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1412  phosphoesterase, PA-phosphatase related  100 
 
 
263 aa  525  1e-148  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.98368  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0547  phosphoesterase PA-phosphatase related  68.09 
 
 
261 aa  329  2e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0347407  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4760  phosphoesterase PA-phosphatase related  40.88 
 
 
279 aa  99.4  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000169741 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0037  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.73 
 
 
272 aa  98.6  9e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0036  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.86 
 
 
273 aa  97.4  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0148  hypothetical protein  38.04 
 
 
266 aa  94.7  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1770  glycosyltransferase  30.68 
 
 
812 aa  93.6  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3550  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.97 
 
 
278 aa  86.3  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.62844 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2515  hypothetical protein  35.16 
 
 
296 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00069207  normal  0.734956 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4447  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.68 
 
 
274 aa  78.2  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.626562  hitchhiker  0.00229166 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1131  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.33 
 
 
198 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1042  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  35.37 
 
 
282 aa  77  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4761  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.82 
 
 
280 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000159664 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3046  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.46 
 
 
299 aa  67.4  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.560501  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3097  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.19 
 
 
222 aa  62.8  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3371  membrane-associated phospholipid phosphatase  33.33 
 
 
217 aa  62.8  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.067771 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5970  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  30.91 
 
 
212 aa  62  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3620  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.2 
 
 
311 aa  61.6  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000326063 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1504  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.91 
 
 
174 aa  61.2  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0423  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.81 
 
 
241 aa  60.5  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0646  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.39 
 
 
271 aa  59.7  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.8109  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1037  phosphoesterase PA-phosphatase related  41.76 
 
 
200 aa  58.5  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000361007  hitchhiker  0.00000179156 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0918  PAP2 family protein  41.76 
 
 
200 aa  58.5  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.791764  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00209  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.19 
 
 
172 aa  57.4  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1778  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.35 
 
 
182 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08340  Acid phosphatase/vanadium-dependent haloperoxidase superfamily  32.87 
 
 
439 aa  57  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4071  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.11 
 
 
169 aa  55.8  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3463  lipoprotein signal peptidase  39.22 
 
 
359 aa  55.8  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4320  signal peptidase II  39.22 
 
 
359 aa  55.8  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0315  membrane-associated phospholipid phosphatase  35.71 
 
 
216 aa  55.5  0.0000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.770739  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0608  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.53 
 
 
438 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3219  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  34.15 
 
 
230 aa  54.7  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1773  PAP2 superfamily protein  39.13 
 
 
445 aa  54.3  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4371  DedA:phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.56 
 
 
438 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.447762 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0878  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.06 
 
 
182 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.749948  hitchhiker  0.002123 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2147  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.26 
 
 
178 aa  53.5  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.913624  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2011  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  30.91 
 
 
222 aa  53.5  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.235686  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3773  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.45 
 
 
178 aa  52.8  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0882252 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1039  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.58 
 
 
183 aa  52.8  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3885  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.45 
 
 
178 aa  52.8  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0111  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.24 
 
 
174 aa  52.8  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0484  hypothetical protein  30 
 
 
223 aa  52.8  0.000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1477  hypothetical protein  29.33 
 
 
204 aa  52  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769795  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1506  hypothetical protein  29.33 
 
 
204 aa  52  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0992  PAP2 family protein  29.94 
 
 
204 aa  51.6  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3348  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.77 
 
 
186 aa  52  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.31592  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11150  phosphoesterase PA-phosphatase related  28 
 
 
176 aa  50.8  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1814  lipoprotein signal peptidase  35.51 
 
 
358 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.344803 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5915  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.71 
 
 
249 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.322864  normal  0.445191 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0559  phosphoesterase PA-phosphatase related  60.98 
 
 
199 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0983  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  43.84 
 
 
227 aa  50.4  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1969  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.4 
 
 
253 aa  50.4  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175709  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4906  PAP2 family protein  29.09 
 
 
177 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0399  phosphatase  39.06 
 
 
187 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.556092  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0979  phosphoesterase, PA-phosphatase related  26.6 
 
 
194 aa  50.1  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000896993 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4897  PAP2 family protein  29.09 
 
 
177 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4494  phosphatidylglycerophosphatase B  29.09 
 
 
177 aa  49.7  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0530  phosphoesterase, PA-phosphatase related  52.73 
 
 
199 aa  49.7  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.126296  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1102  phosphatase  32.08 
 
 
185 aa  49.7  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0240643  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1775  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.59 
 
 
187 aa  49.7  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0562  phosphoesterase PA-phosphatase related  60.98 
 
 
199 aa  49.3  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0152242  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4831  PAP2 superfamily protein/DedA family protein  29.86 
 
 
438 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0735581  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3788  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.42 
 
 
169 aa  49.3  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0639  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.02 
 
 
185 aa  49.3  0.00006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.198264  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2029  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.33 
 
 
200 aa  49.3  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1713  phosphoesterase PA-phosphatase related  41.27 
 
 
176 aa  49.3  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.118972  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4813  PAP2 family protein/DedA family protein  38.1 
 
 
438 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.609495 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2555  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.35 
 
 
271 aa  49.3  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.729938  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4866  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.1 
 
 
438 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.374239  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2918  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  29.59 
 
 
191 aa  49.3  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.547296  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3806  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.77 
 
 
438 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0931  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.46 
 
 
189 aa  49.3  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4688  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.1 
 
 
438 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4588  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.27 
 
 
176 aa  48.9  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2292  phosphatase, PAP2 family protein  43.48 
 
 
194 aa  48.9  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000588398  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4871  PAP2 family protein  28.48 
 
 
177 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0369  PAP2 family protein  28.48 
 
 
177 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.636888  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3318  phosphoesterase PA-phosphatase related  41.54 
 
 
208 aa  48.9  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0711194  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0634  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.78 
 
 
178 aa  48.9  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000602311  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4656  PAP2 family protein  29.09 
 
 
177 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2194  PAP2 family phosphatase  36.76 
 
 
183 aa  48.5  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000351549  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4512  phosphatidylglycerophosphatase B  29.27 
 
 
177 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.113665  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4880  PAP2 family protein  29.09 
 
 
177 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0773  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.33 
 
 
360 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5011  PAP2 family protein  29.09 
 
 
177 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0214  PAP2 superfamily domain-containing protein  31.46 
 
 
273 aa  48.5  0.0001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5776  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.88 
 
 
194 aa  48.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00125534  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2733  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.91 
 
 
172 aa  48.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1093  membrane-associated phospholipid phosphatase  34.74 
 
 
218 aa  48.5  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00170585  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2676  bacitracin transport permease protein bcrc  30.53 
 
 
199 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0568  hypothetical protein  27.75 
 
 
187 aa  48.5  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.237091 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4117  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.78 
 
 
201 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0637  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.85 
 
 
208 aa  47.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6892  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.26 
 
 
251 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.757531 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09156  hypothetical protein  27.91 
 
 
187 aa  47.8  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.63816  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5948  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase /lipoprotein signal peptidase involved in Pb(II) resistance PbrB/C  31.09 
 
 
358 aa  47.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1125  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.33 
 
 
245 aa  47.4  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.223896  hitchhiker  0.00699955 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11960  hypothetical protein  34.21 
 
 
437 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0023163  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3368  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.3 
 
 
176 aa  47.4  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4143  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.78 
 
 
201 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>