187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1171 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1171  Pap2  100 
 
 
207 aa  412  1e-114  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00573838  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1390  PAP2 family protein  92.75 
 
 
207 aa  381  1e-105  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.686909  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1199  phosphoesterase, PA-phosphatase related  78.26 
 
 
207 aa  311  2.9999999999999996e-84  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1379  PAP2 family protein  29.71 
 
 
215 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00207863 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1203  PAP2 family protein  29.71 
 
 
205 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1301  PAP2 family protein  29.71 
 
 
205 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1415  PAP2 domain-containing protein  37.25 
 
 
682 aa  79  0.00000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00547522  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1352  phosphatase  37.25 
 
 
682 aa  79.3  0.00000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.304549  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1181  PAP2 family protein; phosphatidylglycerophosphatase B  29.14 
 
 
205 aa  78.2  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1183  PAP2 family protein; phosphatidylglycerophosphatase B  29.14 
 
 
205 aa  78.2  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.200709  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1443  PAP2 family protein  30.89 
 
 
214 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.253975  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4813  PAP2 family protein/DedA family protein  28.86 
 
 
438 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.609495 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4866  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.24 
 
 
438 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.374239  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1502  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.83 
 
 
224 aa  73.6  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00788847  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0608  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.38 
 
 
438 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1402  PAP2 family protein  27.59 
 
 
205 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4003  PAP2 family protein  27.6 
 
 
215 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000398311 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0508  membrane-associated phospholipid phosphatase  31.71 
 
 
212 aa  72.4  0.000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1341  PAP2 family protein  27.08 
 
 
215 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4688  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.21 
 
 
438 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4831  PAP2 superfamily protein/DedA family protein  28.24 
 
 
438 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0735581  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1172  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.29 
 
 
676 aa  69.7  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.98006  normal  0.0665428 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2504  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.19 
 
 
331 aa  69.3  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.104215  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0315  membrane-associated phospholipid phosphatase  22.78 
 
 
216 aa  69.7  0.00000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.770739  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1205  phosphoesterase PA-phosphatase related  25.95 
 
 
215 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0231  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.57 
 
 
238 aa  68.9  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1011  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.33 
 
 
215 aa  68.2  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.43228  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1827  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  33.8 
 
 
282 aa  67.8  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.680362  normal  0.31058 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1306  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.37 
 
 
225 aa  65.1  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.420289  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4371  DedA:phosphoesterase, PA-phosphatase related  26.37 
 
 
438 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.447762 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1093  membrane-associated phospholipid phosphatase  32.98 
 
 
218 aa  62.4  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00170585  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1321  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.2 
 
 
238 aa  62.4  0.000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.175223  normal  0.0541289 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0315  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.76 
 
 
320 aa  62  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2162  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  27.96 
 
 
228 aa  60.1  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1075  phosphoesterase, PA-phosphatase related  24.86 
 
 
331 aa  60.5  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0423  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.74 
 
 
241 aa  60.1  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1672  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.14 
 
 
244 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2555  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.48 
 
 
271 aa  59.3  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.729938  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7845  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.16 
 
 
265 aa  58.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.359655 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3446  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.63 
 
 
267 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1429  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  31.09 
 
 
293 aa  58.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08340  Acid phosphatase/vanadium-dependent haloperoxidase superfamily  26.04 
 
 
439 aa  57.4  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3574  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.47 
 
 
267 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0634  membrane-associated phospholipid phosphatase  31.11 
 
 
217 aa  57.8  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1477  hypothetical protein  28.79 
 
 
204 aa  55.8  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769795  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1506  hypothetical protein  28.79 
 
 
204 aa  55.8  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3250  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.47 
 
 
267 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00807425 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0429  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.42 
 
 
221 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.402808  normal  0.651701 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2200  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.06 
 
 
248 aa  55.5  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2334  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.54 
 
 
242 aa  55.1  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.254017 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0828  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.22 
 
 
252 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238614 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4976  phosphoesterase, PA-phosphatase-like  30.11 
 
 
438 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.135729  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11960  hypothetical protein  30.91 
 
 
437 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0023163  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2226  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  34.92 
 
 
198 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3806  phosphoesterase, PA-phosphatase related  25.44 
 
 
438 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1098  hypothetical protein  30.91 
 
 
437 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000441733  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0678  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.88 
 
 
208 aa  54.3  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1888  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  28.49 
 
 
192 aa  53.9  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.871384  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4038  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.11 
 
 
662 aa  53.5  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1015  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.08 
 
 
265 aa  53.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2672  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  27.38 
 
 
191 aa  53.5  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0154  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.96 
 
 
249 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1883  phosphoesterase, PA-phosphatase related  24.6 
 
 
702 aa  53.5  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.379542  normal  0.0602268 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2181  hypothetical protein  28.41 
 
 
269 aa  53.5  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0466384  normal  0.124469 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0824  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.04 
 
 
241 aa  53.9  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4165  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  24.88 
 
 
307 aa  53.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.60471 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0646  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.65 
 
 
271 aa  52.8  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.8109  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1699  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.78 
 
 
211 aa  52.8  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0547  phosphoesterase PA-phosphatase related  37 
 
 
261 aa  52.8  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0347407  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1362  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.51 
 
 
212 aa  52.8  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000155567  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2038  PAP2 family protein  27.75 
 
 
204 aa  52.4  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.671658  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0407  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  34.25 
 
 
252 aa  52.4  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5027  phosphoesterase, PA-phosphatase related  25.58 
 
 
255 aa  52  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.223489  normal  0.43198 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4605  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.48 
 
 
249 aa  52  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0570906 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1019  DedA/PAP2 family phospholipid acid phosphatase  30 
 
 
502 aa  52  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1246  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.61 
 
 
331 aa  52  0.000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.656269 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3095  phosphoesterase PA-phosphatase related  25.7 
 
 
255 aa  52  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2434  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.63 
 
 
240 aa  51.6  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.535844 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11150  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.03 
 
 
176 aa  52  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2990  phosphoesterase PA-phosphatase related  25.7 
 
 
255 aa  51.6  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3685  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.78 
 
 
299 aa  51.6  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000286465  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0463  Undecaprenyl-diphosphatase  27.04 
 
 
219 aa  51.2  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.282936  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6732  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  33.67 
 
 
251 aa  50.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.322739 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2905  phosphoesterase, PA-phosphatase related  23.6 
 
 
255 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0835  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.76 
 
 
181 aa  50.8  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.896282 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0773  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.8 
 
 
252 aa  50.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1699  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  33.33 
 
 
521 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422307  normal  0.249913 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0037  PAP2 family protein  34.78 
 
 
245 aa  50.1  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0773  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.22 
 
 
360 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0089  PAP2 family protein  33.63 
 
 
223 aa  50.1  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2342  PAP2 family protein  27.32 
 
 
213 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.149302  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1513  secretion system protein Y  30.89 
 
 
678 aa  49.7  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0119  PA-phosphatase related phosphoesterase  32.95 
 
 
256 aa  50.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00406131  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3032  PAP2 family protein  26.49 
 
 
213 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1706  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.29 
 
 
256 aa  49.7  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1018  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.82 
 
 
220 aa  50.1  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000250416  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3147  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  34.33 
 
 
218 aa  49.7  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.225101  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1402  PAP2 family protein  24.26 
 
 
213 aa  49.3  0.00005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0611  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.5 
 
 
258 aa  48.9  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00458369 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4315  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.02 
 
 
251 aa  48.9  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.155315 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>