138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2916 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_2916  phosphoesterase, PA-phosphatase related  100 
 
 
274 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503555  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2554  phosphoesterase, PA-phosphatase related  80.15 
 
 
280 aa  428  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163921  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2826  phosphoesterase PA-phosphatase related  70.96 
 
 
282 aa  338  5e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2545  phosphoesterase, PA-phosphatase related  65.93 
 
 
281 aa  322  6e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.121468  normal  0.780367 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3918  putative phosphoesterase, PA-phosphatase related (membrane associated)  56.33 
 
 
263 aa  223  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4552  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.37 
 
 
309 aa  82  0.000000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2201  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.77 
 
 
208 aa  76.3  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4360  lipid A 1-phosphatase protein  38.76 
 
 
268 aa  75.5  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2558  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.75 
 
 
255 aa  73.9  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0088777  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0637  phosphoesterase PA-phosphatase related  32 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3901  phosphoesterase PA-phosphatase related  41.73 
 
 
232 aa  73.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.221269 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4225  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.1 
 
 
226 aa  73.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113953 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0735  PAP2 family protein  26.95 
 
 
255 aa  69.3  0.00000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1791  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.67 
 
 
225 aa  68.9  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.824897  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0981  hypothetical protein  31.88 
 
 
215 aa  68.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0740  PAP2 family protein  26.95 
 
 
255 aa  67.8  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0607  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.74 
 
 
179 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00776566  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1669  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.01 
 
 
202 aa  67.4  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000273408  normal  0.218841 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0951  hypothetical protein  30.43 
 
 
215 aa  65.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3290  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.78 
 
 
171 aa  63.9  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.377201  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2234  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.79 
 
 
268 aa  63.2  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0466  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.19 
 
 
207 aa  62.8  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3179  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.29 
 
 
230 aa  62.4  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3368  phosphoesterase, PA-phosphatase related  41.49 
 
 
176 aa  62  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0381  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.12 
 
 
220 aa  61.2  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3788  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.71 
 
 
169 aa  60.1  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3721  phosphoesterase, PA-phosphatase related  49.23 
 
 
170 aa  59.7  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.701868  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1657  PAP2 superfamily protein  42.7 
 
 
171 aa  59.7  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000234418  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4071  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.78 
 
 
169 aa  58.5  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1280  PAP2 family protein  38.26 
 
 
185 aa  58.2  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0275929  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1102  phosphatase  37.39 
 
 
185 aa  58.2  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0240643  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0501  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.36 
 
 
222 aa  57.8  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5776  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.02 
 
 
194 aa  57.4  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00125534  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4117  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.94 
 
 
201 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4143  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.94 
 
 
201 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0399  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.69 
 
 
245 aa  56.2  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149101  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0409  phosphoesterase, PA-phosphatase related  44.62 
 
 
170 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3198  PAP2 family protein  40.23 
 
 
170 aa  55.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3219  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  41.43 
 
 
230 aa  55.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0634  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.16 
 
 
178 aa  55.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000602311  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0465  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.47 
 
 
199 aa  54.3  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.451199  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3547  phosphoesterase, PA-phosphatase related  44.62 
 
 
170 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0785734  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0936  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.76 
 
 
286 aa  54.7  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0479  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.36 
 
 
170 aa  53.9  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2317  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  32.41 
 
 
187 aa  53.5  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1842  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.84 
 
 
204 aa  53.1  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2366  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.4 
 
 
201 aa  53.1  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0167377 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0786  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.73 
 
 
179 aa  52.8  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000027355 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0532  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.41 
 
 
187 aa  52.8  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1491  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.07 
 
 
157 aa  52.4  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0940557  normal  0.0672657 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1347  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.86 
 
 
392 aa  52  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.423681  hitchhiker  0.0000000949183 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3891  phosphoesterase PA-phosphatase related  41.38 
 
 
170 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.256491  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0449  phosphoesterase PA-phosphatase related  41.38 
 
 
170 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0423  phosphoesterase PA-phosphatase related  43.28 
 
 
170 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0435  phosphoesterase PA-phosphatase related  43.28 
 
 
170 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.3398  hitchhiker  0.00199052 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001653  membrane-associated phospholipid phosphatase  38.14 
 
 
182 aa  51.6  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0313  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.52 
 
 
305 aa  50.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.512715  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3773  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.99 
 
 
178 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0882252 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3885  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.99 
 
 
178 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0111  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.74 
 
 
174 aa  50.4  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11150  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.44 
 
 
176 aa  50.4  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0691  phosphoesterase, PA-phosphatase related  43.27 
 
 
207 aa  50.4  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.46674  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3387  phosphoesterase PA-phosphatase related  43.28 
 
 
168 aa  50.4  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000111833  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2288  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.48 
 
 
205 aa  50.4  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4001  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.32 
 
 
200 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.794332  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00821  phospholipid phosphatase  35.42 
 
 
182 aa  50.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00209  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.96 
 
 
172 aa  50.1  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1178  phosphoesterase PA-phosphatase related  35 
 
 
294 aa  49.7  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.2963e-23 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3083  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.62 
 
 
294 aa  48.9  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.227102  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2419  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.86 
 
 
222 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.623876  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0979  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.6 
 
 
194 aa  48.5  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000896993 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0131  PAP2 family protein  30.53 
 
 
325 aa  47.4  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.200996  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0122  PAP2 family protein  30.53 
 
 
325 aa  47.4  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5449  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.58 
 
 
284 aa  47.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.961923  normal  0.71434 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3671  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.49 
 
 
213 aa  47.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1387  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.55 
 
 
196 aa  48.1  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1840  PAP2 family protein  30.56 
 
 
272 aa  47.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11960  hypothetical protein  35.2 
 
 
437 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0023163  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2063  hypothetical protein  43.1 
 
 
178 aa  47.4  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3620  phosphoesterase PA-phosphatase related  41.67 
 
 
311 aa  47.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000326063 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1517  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.33 
 
 
281 aa  47  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000561151  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1221  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.56 
 
 
218 aa  47  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1897  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  35.71 
 
 
176 aa  47  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0399  phosphatase  37.5 
 
 
187 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.556092  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3447  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.08 
 
 
218 aa  46.6  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.513701  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3371  membrane-associated phospholipid phosphatase  36.23 
 
 
217 aa  46.2  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.067771 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1555  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.67 
 
 
176 aa  46.6  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0425  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.32 
 
 
209 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.41159  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4760  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.46 
 
 
279 aa  46.6  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000169741 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3600  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.1 
 
 
171 aa  46.2  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000568068  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1098  hypothetical protein  34.4 
 
 
437 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000441733  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0373  phosphoesterase, PA-phosphatase related  44.62 
 
 
202 aa  45.8  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3463  lipoprotein signal peptidase  35.51 
 
 
359 aa  45.8  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4320  signal peptidase II  35.51 
 
 
359 aa  45.8  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2329  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.91 
 
 
182 aa  45.8  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0510  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.93 
 
 
170 aa  45.4  0.0009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2029  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.78 
 
 
200 aa  45.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0425  undecaprenyl-diphosphatase  31.68 
 
 
203 aa  44.7  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1340  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34 
 
 
204 aa  45.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3147  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  37.04 
 
 
218 aa  45.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.225101  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>