29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1221 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1221  phosphoesterase PA-phosphatase related  100 
 
 		 218 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3030  phosphoesterase PA-phosphatase related  93.12 
 
 		 218 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.452629  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0968  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40.64 
 
 		 216 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.133557  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3671  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.73 
 
 		 213 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3118  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.59 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0981  hypothetical protein  27.09 
 
 		 215 aa  62  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3447  phosphoesterase, PA-phosphatase related  26.97 
 
 		 218 aa  62  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.513701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0637  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.25 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0951  hypothetical protein  25.84 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0607  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.66 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00776566  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0466  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.6 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2901  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.3 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0866647  normal  0.913295 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1387  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.32 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0399  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.02 
 
 		 245 aa  53.1  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149101  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0122  PAP2 family protein  27.54 
 
 		 325 aa  52  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1669  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.07 
 
 		 202 aa  52  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000273408  normal  0.218841 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0131  PAP2 family protein  27.54 
 
 		 325 aa  52  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.200996  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1791  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.21 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.824897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2201  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.95 
 
 		 208 aa  50.1  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0691  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.27 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.46674  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4017  phosphoesterase PA-phosphatase related  40.28 
 
 		 290 aa  45.4  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  0.169945 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2932  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.71 
 
 		 203 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal  0.0854276 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3158  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.71 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.873511  normal  0.780516 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0835  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.34 
 
 		 181 aa  42.7  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.896282 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4360  lipid A 1-phosphatase protein  33.67 
 
 		 268 aa  42.4  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0381  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.73 
 
 		 220 aa  42.4  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4320  signal peptidase II  34.57 
 
 		 359 aa  42.4  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3463  lipoprotein signal peptidase  34.57 
 
 		 359 aa  42.4  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2558  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.78 
 
 		 255 aa  41.6  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0088777  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>