33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2901 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2901  phosphoesterase, PA-phosphatase related  100 
 
 		 224 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0866647  normal  0.913295 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3671  phosphoesterase PA-phosphatase related  53.5 
 
 		 213 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3447  phosphoesterase, PA-phosphatase related  48.79 
 
 		 218 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.513701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3118  phosphoesterase PA-phosphatase related  45.5 
 
 		 235 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3030  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.21 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.452629  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1221  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.3 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1340  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.94 
 
 		 249 aa  53.1  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.130328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4017  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.94 
 
 		 290 aa  49.3  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  0.169945 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2545  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.14 
 
 		 242 aa  48.1  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2554  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.56 
 
 		 280 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163921  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1178  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.14 
 
 		 294 aa  47  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.2963e-23 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3500  hypothetical protein  28.44 
 
 		 333 aa  46.2  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.925053  normal  0.117636 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3083  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.8 
 
 		 294 aa  45.8  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.227102  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2185  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.11 
 
 		 257 aa  45.4  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.303622  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2558  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.94 
 
 		 255 aa  45.4  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0088777  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1387  phosphoesterase PA-phosphatase related  24.38 
 
 		 196 aa  44.7  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0983  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  40.58 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0735  PAP2 family protein  26.03 
 
 		 255 aa  44.7  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0740  PAP2 family protein  26.03 
 
 		 255 aa  44.7  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0968  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.18 
 
 		 216 aa  43.5  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.133557  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3725  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.73 
 
 		 158 aa  44.3  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2462  bacitracin transport permease, PAP2 family protein  35.48 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0841769  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2497  bacitracin transport permease  35.48 
 
 		 199 aa  44.3  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202307  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0634  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.14 
 
 		 178 aa  42.7  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000602311  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1362  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.97 
 
 		 212 aa  42.7  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000155567  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2053  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.87 
 
 		 199 aa  42.4  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.400178  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0607  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.57 
 
 		 179 aa  42.4  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00776566  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1517  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.08 
 
 		 281 aa  42  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000561151  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1969  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.67 
 
 		 253 aa  41.6  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175709  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2415  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.96 
 
 		 265 aa  41.6  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0206905  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2759  bacitracin transport permease protein bcrc  30.77 
 
 		 199 aa  41.6  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0828321  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0399  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.89 
 
 		 245 aa  41.6  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149101  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0466  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.52 
 
 		 207 aa  41.6  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>