35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3447 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3447  phosphoesterase, PA-phosphatase related  100 
 
 		 218 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.513701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3671  phosphoesterase PA-phosphatase related  62.38 
 
 		 213 aa  278  4e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2901  phosphoesterase, PA-phosphatase related  51.05 
 
 		 224 aa  205  5e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0866647  normal  0.913295 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3118  phosphoesterase PA-phosphatase related  45.62 
 
 		 235 aa  191  8e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0968  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.47 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.133557  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1221  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.97 
 
 		 218 aa  62  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0607  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.23 
 
 		 179 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00776566  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2558  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.77 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0088777  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3030  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.59 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.452629  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0735  PAP2 family protein  30.18 
 
 		 255 aa  55.5  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0637  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.11 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0740  PAP2 family protein  29.59 
 
 		 255 aa  53.1  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0891  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  28.79 
 
 		 199 aa  52.4  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.467652  normal  0.655955 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0981  hypothetical protein  29.28 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2554  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.26 
 
 		 280 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163921  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0951  hypothetical protein  28.73 
 
 		 215 aa  49.7  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1669  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.91 
 
 		 202 aa  48.9  0.00006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000273408  normal  0.218841 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0399  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.84 
 
 		 245 aa  48.1  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149101  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0216  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.97 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1160  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.04 
 
 		 205 aa  46.2  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1387  phosphoesterase PA-phosphatase related  25 
 
 		 196 aa  46.2  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2672  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  25.9 
 
 		 191 aa  45.8  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0466  phosphoesterase, PA-phosphatase related  24.77 
 
 		 207 aa  45.1  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3901  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.54 
 
 		 232 aa  45.1  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.221269 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1517  phosphoesterase PA-phosphatase related  23.67 
 
 		 281 aa  44.7  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000561151  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0936  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.75 
 
 		 286 aa  44.3  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2201  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.37 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1791  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.21 
 
 		 225 aa  43.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.824897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0547  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.49 
 
 		 261 aa  43.5  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0347407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4017  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.23 
 
 		 290 aa  43.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  0.169945 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0381  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.64 
 
 		 220 aa  43.1  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0634  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.62 
 
 		 178 aa  43.1  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000602311  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3219  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  30.1 
 
 		 230 aa  42  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3348  phosphoesterase PA-phosphatase related  25 
 
 		 186 aa  42  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.31592  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2785  bacitracin transport permease  24.39 
 
 		 199 aa  41.6  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0349348  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>