147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2545 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_2545  phosphoesterase, PA-phosphatase related  100 
 
 
281 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.121468  normal  0.780367 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2554  phosphoesterase, PA-phosphatase related  66.67 
 
 
280 aa  354  7.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163921  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2916  phosphoesterase, PA-phosphatase related  65.93 
 
 
274 aa  338  4e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503555  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2826  phosphoesterase PA-phosphatase related  65.8 
 
 
282 aa  295  5e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3918  putative phosphoesterase, PA-phosphatase related (membrane associated)  56.12 
 
 
263 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4552  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.37 
 
 
309 aa  80.1  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2201  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.72 
 
 
208 aa  75.9  0.0000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1791  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.11 
 
 
225 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.824897  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4225  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.5 
 
 
226 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113953 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4360  lipid A 1-phosphatase protein  43.33 
 
 
268 aa  72.4  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0735  PAP2 family protein  30.07 
 
 
255 aa  71.2  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0637  phosphoesterase PA-phosphatase related  30 
 
 
208 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0740  PAP2 family protein  30.07 
 
 
255 aa  69.7  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3901  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.78 
 
 
232 aa  69.3  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.221269 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0466  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.28 
 
 
207 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2558  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.38 
 
 
255 aa  67  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0088777  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0981  hypothetical protein  37.89 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0607  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.62 
 
 
179 aa  65.9  0.0000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00776566  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1669  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.04 
 
 
202 aa  65.5  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000273408  normal  0.218841 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1280  PAP2 family protein  39.62 
 
 
185 aa  64.3  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0275929  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0951  hypothetical protein  35.79 
 
 
215 aa  63.5  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1102  phosphatase  38.32 
 
 
185 aa  63.5  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0240643  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3179  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.29 
 
 
230 aa  61.6  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0131  PAP2 family protein  31.25 
 
 
325 aa  60.1  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.200996  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0122  PAP2 family protein  31.25 
 
 
325 aa  60.1  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3788  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.23 
 
 
169 aa  58.5  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3387  phosphoesterase PA-phosphatase related  47.76 
 
 
168 aa  58.5  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000111833  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1598  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.78 
 
 
180 aa  57.8  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.970961  hitchhiker  0.00000195096 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3368  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.18 
 
 
176 aa  57.4  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3721  phosphoesterase, PA-phosphatase related  52.63 
 
 
170 aa  56.2  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.701868  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2234  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.19 
 
 
268 aa  56.2  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2317  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  30.63 
 
 
187 aa  56.2  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2419  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.91 
 
 
222 aa  55.8  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.623876  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0409  phosphoesterase, PA-phosphatase related  50 
 
 
170 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0381  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.33 
 
 
220 aa  55.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0399  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32 
 
 
245 aa  54.7  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149101  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0639  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.53 
 
 
185 aa  54.3  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.198264  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0501  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.93 
 
 
222 aa  53.9  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0634  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.7 
 
 
178 aa  53.9  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000602311  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3547  phosphoesterase, PA-phosphatase related  48.28 
 
 
170 aa  53.5  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0785734  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4117  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.14 
 
 
201 aa  52.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4143  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.14 
 
 
201 aa  52.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0691  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.58 
 
 
207 aa  52.4  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.46674  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3290  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.17 
 
 
171 aa  52.4  0.000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.377201  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3773  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.57 
 
 
178 aa  52.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0882252 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3885  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.57 
 
 
178 aa  52.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1387  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.04 
 
 
196 aa  50.8  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0373  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.78 
 
 
202 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4138  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.35 
 
 
499 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2063  hypothetical protein  34.65 
 
 
178 aa  50.8  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3404  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.17 
 
 
228 aa  50.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1347  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.54 
 
 
392 aa  49.7  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.423681  hitchhiker  0.0000000949183 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0111  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.43 
 
 
174 aa  49.7  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0786  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.89 
 
 
179 aa  49.7  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000027355 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0936  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.73 
 
 
286 aa  49.7  0.00006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11150  phosphoesterase PA-phosphatase related  33 
 
 
176 aa  48.9  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3891  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.67 
 
 
170 aa  48.9  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.256491  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0449  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.67 
 
 
170 aa  48.9  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1842  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.26 
 
 
204 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1178  phosphoesterase PA-phosphatase related  40.2 
 
 
294 aa  48.9  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.2963e-23 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0282  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.04 
 
 
246 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0187484  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1840  PAP2 family protein  30.89 
 
 
272 aa  47.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5776  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.29 
 
 
194 aa  47.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00125534  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4071  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.44 
 
 
169 aa  47.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3219  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  38.71 
 
 
230 aa  47.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3083  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.22 
 
 
294 aa  48.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.227102  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2785  bacitracin transport permease  31.94 
 
 
199 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0349348  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2288  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.18 
 
 
205 aa  47.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4001  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.24 
 
 
200 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.794332  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3198  PAP2 family protein  36.78 
 
 
170 aa  47.4  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0423  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.67 
 
 
170 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0435  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.67 
 
 
170 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.3398  hitchhiker  0.00199052 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1011  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.58 
 
 
215 aa  47  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.43228  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2794  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.76 
 
 
199 aa  46.6  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.755209  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0465  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.22 
 
 
199 aa  46.6  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.451199  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0313  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.33 
 
 
305 aa  46.2  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.512715  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0510  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.56 
 
 
170 aa  46.6  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3806  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.91 
 
 
438 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00808  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34 
 
 
198 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2801  Undecaprenyl-diphosphatase  34 
 
 
198 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.185163  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0270  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.72 
 
 
246 aa  46.2  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1657  PAP2 superfamily protein  33.68 
 
 
171 aa  46.2  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000234418  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00825  hypothetical protein  34 
 
 
198 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0902  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34 
 
 
198 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0843231  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2801  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34 
 
 
198 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.907509 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0994  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  31.62 
 
 
198 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.485972  normal  0.103105 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4100  acid phosphatase  39.76 
 
 
295 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.122701 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2759  bacitracin transport permease protein bcrc  33.33 
 
 
199 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0828321  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1480  undecaprenyl-diphosphatase  30.85 
 
 
180 aa  46.2  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00409552  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1332  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.94 
 
 
202 aa  46.2  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.130415 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0912  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.7 
 
 
198 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0868  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.7 
 
 
198 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2504  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.7 
 
 
198 aa  45.8  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.8629  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2570  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  39.47 
 
 
209 aa  45.8  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.501729  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0532  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.41 
 
 
187 aa  45.8  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1517  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.38 
 
 
281 aa  45.8  0.0009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000561151  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3371  membrane-associated phospholipid phosphatase  30.26 
 
 
217 aa  45.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.067771 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0979  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.29 
 
 
194 aa  45.4  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000896993 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2366  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.64 
 
 
201 aa  45.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0167377 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3600  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.77 
 
 
171 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000568068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>