58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1570 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_1570  acid phosphatase  100 
 
 
292 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal  0.0585082 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1849  Acid phosphatase  98.97 
 
 
292 aa  569  1e-161  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35373  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1669  Acid phosphatase  87.5 
 
 
296 aa  474  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.206276  normal  0.6113 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4100  acid phosphatase  56.87 
 
 
295 aa  281  8.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.122701 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2550  acid phosphatase  49.24 
 
 
272 aa  242  6e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.232354  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3722  phosphoesterase PA-phosphatase related  50.6 
 
 
273 aa  222  7e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.805724  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03490  phosphatase  41.71 
 
 
265 aa  160  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0038  Acid phosphatase  42.79 
 
 
279 aa  159  7e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17079  hitchhiker  0.000164539 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0256  acid phosphatase  42.86 
 
 
253 aa  156  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.136313 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4538  acid phosphatase  39.11 
 
 
289 aa  152  7e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4695  acid phosphatase  39.23 
 
 
275 aa  152  7e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03461  acid phosphatase  36.75 
 
 
285 aa  149  5e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.355106 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2221  acid phosphatase  40.34 
 
 
283 aa  149  6e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.517778  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2405  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.93 
 
 
262 aa  142  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.449401 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0006  putative acid phosphatase  37.26 
 
 
246 aa  142  9e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2996  acid phosphatase  39.13 
 
 
582 aa  135  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0243  putative acid phosphatase  36.19 
 
 
249 aa  132  6e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1631  acid phosphatase  32.69 
 
 
253 aa  125  6e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4496  acid phosphatase  31.05 
 
 
287 aa  116  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.043425 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3182  Acid phosphatase  35.86 
 
 
248 aa  115  8.999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0651896  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4589  putative acid phosphatase  32.06 
 
 
250 aa  113  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.10693  normal  0.314355 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4680  putative acid phosphatase  32.06 
 
 
250 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4670  putative acid phosphatase  32.06 
 
 
250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4714  putative acid phosphatase  32.06 
 
 
250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.225628  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4585  putative acid phosphatase  31.53 
 
 
250 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0690  Acid phosphatase  34.62 
 
 
258 aa  109  6e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2143  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.5 
 
 
256 aa  102  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2395  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.94 
 
 
465 aa  77  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0282  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.15 
 
 
246 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0187484  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2222  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.66 
 
 
447 aa  76.3  0.0000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3969  putative phosphatase  35.38 
 
 
423 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2536  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  35.66 
 
 
431 aa  74.7  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3908  putative phosphatase  35.38 
 
 
423 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3788  putative phosphatase  34.62 
 
 
423 aa  73.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2001  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  37.5 
 
 
378 aa  72.8  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00690  acid phosphatase/vanadium-dependent haloperoxidase  29.44 
 
 
253 aa  70.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0269  putative acid phosphatase  32.19 
 
 
241 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2492  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.94 
 
 
425 aa  69.7  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02380  putative acid phosphatase  32.88 
 
 
241 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.382503  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0315  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  33.54 
 
 
378 aa  67.8  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2201  serine protease  33.03 
 
 
641 aa  65.9  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4861  phosphoesterase PA-phosphatase related  41.56 
 
 
472 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3763  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.36 
 
 
470 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.781051 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0024  membrane-associated phospholipid phosphatase  40.91 
 
 
510 aa  59.7  0.00000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28361  hypothetical protein  25.71 
 
 
245 aa  53.5  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3064  autotransporter-associated beta strand repeat protein  26.96 
 
 
634 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.782614 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1123  outer membrane autotransporter  33.33 
 
 
1062 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948475  normal  0.876639 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3319  autotransporter-associated beta strand repeat protein  27.88 
 
 
634 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.631506  normal  0.371955 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0634  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.67 
 
 
178 aa  47.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000602311  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0131  lipoprotein  31.45 
 
 
657 aa  47.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00821  phospholipid phosphatase  31.65 
 
 
182 aa  46.2  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0399  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.93 
 
 
245 aa  46.2  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149101  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1740  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.8 
 
 
431 aa  45.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.867472  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0027  autotransporter-associated beta strand repeat protein  28.78 
 
 
661 aa  43.9  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.66 
 
 
1011 aa  44.3  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2990  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.63 
 
 
255 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3095  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.63 
 
 
255 aa  42.7  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2905  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.63 
 
 
255 aa  42.7  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>