More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5919 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5258  patatin  75.81 
 
 		 777 aa  1110    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5919  hypothetical protein  100 
 
 		 750 aa  1515    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.502789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  41.31 
 
 		 753 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0391  patatin  37.99 
 
 		 790 aa  454  1.0000000000000001e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0374937 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  39.64 
 
 		 727 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  38.78 
 
 		 728 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1473  Patatin  38.58 
 
 		 745 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  39.33 
 
 		 751 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  38.85 
 
 		 728 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  38.87 
 
 		 728 aa  438  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  38.49 
 
 		 733 aa  434  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  38.32 
 
 		 728 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  37.97 
 
 		 728 aa  426  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3929  patatin  35.41 
 
 		 737 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000709115  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3413  patatin  36.04 
 
 		 738 aa  411  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.016604  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3852  Patatin  35.09 
 
 		 738 aa  411  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00970151  unclonable  0.00000000000304178 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4050  patatin  35.55 
 
 		 738 aa  412  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.129924  normal  0.182704 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3909  patatin  35.55 
 
 		 738 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000966561  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0465  patatin  37.45 
 
 		 729 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0428  hypothetical protein  34.61 
 
 		 736 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  37.06 
 
 		 798 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  37.11 
 
 		 796 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0034  OMP85 family outer membrane protein  36.65 
 
 		 945 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.987848  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0818  OMP85 family outer membrane protein  36.65 
 
 		 933 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0846  Outer membrane protein  35.81 
 
 		 930 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558607  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2193  patatin-like phospholipase  35.81 
 
 		 920 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193867  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1589  OMP85 family outer membrane protein  36.65 
 
 		 728 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  35.58 
 
 		 738 aa  397  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  37.01 
 
 		 813 aa  393  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  36.54 
 
 		 803 aa  392  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  36.54 
 
 		 804 aa  392  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  35.92 
 
 		 767 aa  390  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  35.07 
 
 		 748 aa  392  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0432  patatin  33.79 
 
 		 738 aa  391  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00104069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3595  patatin  33.79 
 
 		 738 aa  391  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0117026  normal  0.37392 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  36.54 
 
 		 803 aa  392  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0430  patatin  34.35 
 
 		 739 aa  392  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.2569  normal  0.405948 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0323  patatin  34.99 
 
 		 735 aa  387  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000755516  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  36.4 
 
 		 803 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1781  OMP85 family outer membrane protein  35.24 
 
 		 852 aa  385  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0939  patatin family phospholipase  36.45 
 
 		 714 aa  385  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0379  hypothetical protein  34.53 
 
 		 734 aa  383  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101428  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3427  patatin  33.02 
 
 		 737 aa  377  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000209875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0435  patatin  34.34 
 
 		 751 aa  379  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00139608  decreased coverage  0.00000000672418 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3379  patatin  33.65 
 
 		 737 aa  374  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3773  patatin  32.68 
 
 		 754 aa  358  2.9999999999999997e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0838  Patatin  38.46 
 
 		 667 aa  350  5e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002569  hypothetical protein  33.64 
 
 		 776 aa  350  6e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.765659  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  31.7 
 
 		 741 aa  345  1e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3628  patatin-like phospholipase family protein  32.74 
 
 		 735 aa  343  7e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03442  hypothetical protein  32.99 
 
 		 771 aa  340  7e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0132  hypothetical protein  31.98 
 
 		 764 aa  332  1e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.948806  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1334  patatin-like protein of phospholipase family protein  31.66 
 
 		 745 aa  305  2.0000000000000002e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4068  patatin  29.95 
 
 		 733 aa  278  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.288798 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3685  Patatin  26.95 
 
 		 720 aa  210  6e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000342926  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  29.4 
 
 		 760 aa  206  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0461  Patatin  38.05 
 
 		 707 aa  186  2.0000000000000003e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  27 
 
 		 740 aa  184  5.0000000000000004e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  29.24 
 
 		 740 aa  174  5.999999999999999e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2996  Patatin  27.44 
 
 		 746 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000124103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  37.41 
 
 		 256 aa  164  8.000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0290  hypothetical protein  31.57 
 
 		 981 aa  160  7e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  33.33 
 
 		 272 aa  160  9e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  38.57 
 
 		 273 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  32.98 
 
 		 263 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  33.33 
 
 		 263 aa  157  6e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  33.33 
 
 		 263 aa  157  6e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  33.33 
 
 		 263 aa  157  6e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  33.33 
 
 		 263 aa  157  6e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  32.99 
 
 		 263 aa  157  9e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  32.98 
 
 		 263 aa  157  9e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  32.98 
 
 		 263 aa  157  9e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  33.45 
 
 		 263 aa  157  9e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  33.91 
 
 		 263 aa  156  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  33.91 
 
 		 263 aa  156  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  33.99 
 
 		 333 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  33.89 
 
 		 311 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0402  surface antigen (D15)  36.75 
 
 		 950 aa  155  2.9999999999999998e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.858509  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0958  patatin family protein  40.6 
 
 		 303 aa  151  4e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  33.33 
 
 		 320 aa  151  4e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  35.71 
 
 		 253 aa  151  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  33.33 
 
 		 320 aa  151  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4900  phospholipase, putative  35.07 
 
 		 259 aa  150  9e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  34.6 
 
 		 320 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1874  Lysophospholipase  37.37 
 
 		 262 aa  148  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2385  Patatin  35.49 
 
 		 894 aa  144  4e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0362  hypothetical protein  36.97 
 
 		 875 aa  143  9.999999999999999e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0207415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2033  patatin  36.88 
 
 		 923 aa  143  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0624212  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2040  surface antigen (D15)  33.33 
 
 		 909 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.813925 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  33.92 
 
 		 323 aa  141  6e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  32.49 
 
 		 260 aa  140  7.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1840  Patatin  34.82 
 
 		 900 aa  139  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  35.4 
 
 		 311 aa  138  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  33.04 
 
 		 323 aa  138  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  32.44 
 
 		 275 aa  137  8e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0664  patatin  32.59 
 
 		 299 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  35.21 
 
 		 293 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1271  Patatin  32.25 
 
 		 775 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190834  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1014  hypothetical protein  31.65 
 
 		 292 aa  135  3e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  32.65 
 
 		 275 aa  134  6e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>