More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0605 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008835  BMA10229_0034  OMP85 family outer membrane protein  49.93 
 
 		 945 aa  680    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.987848  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0818  OMP85 family outer membrane protein  49.93 
 
 		 933 aa  680    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2193  patatin-like phospholipase  50.14 
 
 		 920 aa  684    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193867  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  49.66 
 
 		 798 aa  664    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  49.6 
 
 		 804 aa  665    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1781  OMP85 family outer membrane protein  49.86 
 
 		 852 aa  676    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0838  Patatin  61.19 
 
 		 667 aa  749    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  100 
 
 		 767 aa  1555    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  49.6 
 
 		 803 aa  659    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1589  OMP85 family outer membrane protein  49.93 
 
 		 728 aa  680    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0846  Outer membrane protein  50.14 
 
 		 930 aa  684    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558607  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  49.2 
 
 		 813 aa  660    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  49.66 
 
 		 796 aa  665    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  49.87 
 
 		 803 aa  666    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0939  patatin family phospholipase  49.79 
 
 		 714 aa  670    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  49.87 
 
 		 803 aa  666    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0391  patatin  37.53 
 
 		 790 aa  451  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0374937 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5258  patatin  37.69 
 
 		 777 aa  436  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  38.36 
 
 		 753 aa  436  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5919  hypothetical protein  36.16 
 
 		 750 aa  398  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.502789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  32.85 
 
 		 741 aa  381  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  35.44 
 
 		 727 aa  382  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  34.21 
 
 		 748 aa  379  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  34.46 
 
 		 751 aa  362  2e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1473  Patatin  33.51 
 
 		 745 aa  358  9.999999999999999e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  34.29 
 
 		 728 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  34.1 
 
 		 728 aa  356  1e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  35.21 
 
 		 728 aa  355  1e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  34.01 
 
 		 728 aa  353  7e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  34.32 
 
 		 733 aa  345  2e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0430  patatin  32.08 
 
 		 739 aa  342  1e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.2569  normal  0.405948 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3595  patatin  32.35 
 
 		 738 aa  341  4e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0117026  normal  0.37392 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0432  patatin  32.62 
 
 		 738 aa  340  5e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00104069  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0428  hypothetical protein  31.73 
 
 		 736 aa  335  2e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  32.19 
 
 		 728 aa  335  3e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0323  patatin  33.02 
 
 		 735 aa  334  4e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000755516  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  31.91 
 
 		 738 aa  330  8e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3909  patatin  31.06 
 
 		 738 aa  327  7e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000966561  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3852  Patatin  31.23 
 
 		 738 aa  326  9e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00970151  unclonable  0.00000000000304178 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3379  patatin  31.58 
 
 		 737 aa  325  3e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3929  patatin  30.78 
 
 		 737 aa  324  4e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000709115  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4050  patatin  30.65 
 
 		 738 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.129924  normal  0.182704 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3413  patatin  31.15 
 
 		 738 aa  319  1e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.016604  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0379  hypothetical protein  31.28 
 
 		 734 aa  319  1e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101428  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3773  patatin  32.22 
 
 		 754 aa  317  7e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0435  patatin  31.86 
 
 		 751 aa  312  1e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00139608  decreased coverage  0.00000000672418 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3427  patatin  31.79 
 
 		 737 aa  310  6.999999999999999e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000209875  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3628  patatin-like phospholipase family protein  30.57 
 
 		 735 aa  303  1e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0465  patatin  33.74 
 
 		 729 aa  296  1e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0132  hypothetical protein  29.22 
 
 		 764 aa  293  8e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.948806  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03442  hypothetical protein  29.65 
 
 		 771 aa  291  4e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1334  patatin-like protein of phospholipase family protein  30.35 
 
 		 745 aa  279  1e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002569  hypothetical protein  28.99 
 
 		 776 aa  273  1e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.765659  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4068  patatin  29.63 
 
 		 733 aa  266  7e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.288798 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  29.55 
 
 		 760 aa  223  9e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  27.5 
 
 		 740 aa  221  3e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  30.67 
 
 		 740 aa  211  4e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0461  Patatin  36.39 
 
 		 707 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3685  Patatin  31.41 
 
 		 720 aa  185  3e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000342926  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2996  Patatin  33.53 
 
 		 746 aa  170  8e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000124103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2385  Patatin  37.5 
 
 		 894 aa  169  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  35.17 
 
 		 256 aa  168  4e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0402  surface antigen (D15)  36.9 
 
 		 950 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.858509  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0290  hypothetical protein  36.96 
 
 		 981 aa  166  2.0000000000000002e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  35.29 
 
 		 333 aa  163  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  34.97 
 
 		 320 aa  161  4e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  35.43 
 
 		 320 aa  161  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2040  surface antigen (D15)  31.35 
 
 		 909 aa  160  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.813925 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  34.45 
 
 		 311 aa  159  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  32.65 
 
 		 260 aa  158  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0362  hypothetical protein  38.01 
 
 		 875 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0207415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  34.42 
 
 		 253 aa  157  8e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2033  patatin  36.75 
 
 		 923 aa  157  8e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0624212  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1840  Patatin  35.54 
 
 		 900 aa  155  2e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  34.28 
 
 		 272 aa  154  7e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  34.07 
 
 		 320 aa  152  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  33.21 
 
 		 263 aa  151  4e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4900  phospholipase, putative  34.77 
 
 		 259 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0840  patatin  60 
 
 		 135 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.73599 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  34.94 
 
 		 302 aa  149  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  36.36 
 
 		 323 aa  148  4.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  37.21 
 
 		 293 aa  147  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  35.37 
 
 		 273 aa  146  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  33.1 
 
 		 330 aa  147  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  33.99 
 
 		 305 aa  146  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  33.99 
 
 		 306 aa  146  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  33.99 
 
 		 305 aa  146  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  34.84 
 
 		 347 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1174  patatin  30.45 
 
 		 287 aa  145  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  33.55 
 
 		 302 aa  145  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1271  Patatin  24.13 
 
 		 775 aa  145  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  34.67 
 
 		 349 aa  145  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  34.49 
 
 		 306 aa  144  5e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  34.49 
 
 		 474 aa  144  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  34.49 
 
 		 347 aa  144  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  32.67 
 
 		 263 aa  144  7e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  32.89 
 
 		 263 aa  144  7e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  32.67 
 
 		 263 aa  144  7e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  32.67 
 
 		 263 aa  144  7e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  32.89 
 
 		 263 aa  144  7e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>