More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0323 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0323  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 		 458 aa  931    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0112  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  69.7 
 
 		 739 aa  641    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2743  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  71.96 
 
 		 731 aa  634    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1103  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  63.42 
 
 		 726 aa  588  1e-167  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000432194  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0016  recombination factor protein RarA  64.24 
 
 		 441 aa  580  1e-164  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.901386  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02651  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  64.07 
 
 		 735 aa  555  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2304  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  65.01 
 
 		 721 aa  558  1e-157  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.320416 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0388  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  63.11 
 
 		 733 aa  549  1e-155  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.211044  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1441  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  60.52 
 
 		 734 aa  542  1e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.641024  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01421  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  60.52 
 
 		 734 aa  544  1e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.869861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  62.79 
 
 		 441 aa  543  1e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00871  recombination factor protein RarA  59.46 
 
 		 455 aa  538  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0752794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  56.91 
 
 		 450 aa  508  1e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  56.04 
 
 		 447 aa  503  1e-141  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3583  recombination factor protein RarA  59.71 
 
 		 437 aa  498  1e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000174356  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2041  recombination factor protein RarA  58.18 
 
 		 435 aa  484  1e-135  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  55.56 
 
 		 440 aa  479  1e-134  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  54.86 
 
 		 435 aa  480  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  55.94 
 
 		 441 aa  480  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  55.07 
 
 		 434 aa  473  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1429  recombination factor protein RarA  54.09 
 
 		 438 aa  474  1e-132  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.530617  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  54 
 
 		 457 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2590  recombination factor protein RarA  55.69 
 
 		 422 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000937072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  55.76 
 
 		 432 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  54.61 
 
 		 434 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  53.32 
 
 		 457 aa  466  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  53.15 
 
 		 457 aa  461  1e-129  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0502  recombination factor protein RarA  55.58 
 
 		 444 aa  464  1e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383176  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0027  AAA ATPase central domain protein  56.98 
 
 		 459 aa  460  9.999999999999999e-129  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.797145 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0463  recombination factor protein RarA  51.23 
 
 		 440 aa  455  1e-127  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000023762  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  55.27 
 
 		 448 aa  457  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  54.37 
 
 		 435 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1936  recombination factor protein RarA  53.07 
 
 		 432 aa  449  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3807  recombination factor protein RarA  54.71 
 
 		 505 aa  446  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.921575 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  50.11 
 
 		 441 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0537  AAA ATPase central domain protein  52.48 
 
 		 432 aa  447  1.0000000000000001e-124  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  53.83 
 
 		 432 aa  444  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00871  recombination factor protein RarA  49.42 
 
 		 428 aa  440  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3401  AAA ATPase central domain protein  50.78 
 
 		 463 aa  437  1e-121  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0792  AAA ATPase central domain protein  51.06 
 
 		 431 aa  435  1e-121  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  52.06 
 
 		 485 aa  435  1e-121  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0080  recombination factor protein RarA  48 
 
 		 429 aa  435  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00891  recombination factor protein RarA  47.44 
 
 		 429 aa  436  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00901  recombination factor protein RarA  47.76 
 
 		 429 aa  432  1e-120  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2133  recombination factor protein RarA  48.92 
 
 		 459 aa  426  1e-118  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  51.08 
 
 		 443 aa  427  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1974  AAA ATPase central domain protein  52.36 
 
 		 456 aa  422  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.381905  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  52.36 
 
 		 447 aa  416  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1076  recombination factor protein RarA  47.95 
 
 		 544 aa  417  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0730  recombination factor protein RarA  53.43 
 
 		 437 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.44453  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2031  AAA ATPase central domain protein  51.17 
 
 		 447 aa  409  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.039319  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0855  recombination factor protein RarA  48.94 
 
 		 451 aa  409  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2635  recombination factor protein RarA  50.35 
 
 		 429 aa  409  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3121  recombination factor protein RarA  52.06 
 
 		 459 aa  411  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0192623  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0767  recombination factor protein RarA  52.96 
 
 		 437 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.764171  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0767  recombination factor protein RarA  52.72 
 
 		 437 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3766  recombination factor protein RarA  49.77 
 
 		 446 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1199  AAA ATPase central domain protein  46.44 
 
 		 428 aa  402  1e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0774  recombination factor protein RarA  53.9 
 
 		 444 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0591315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2002  recombination factor protein RarA  50 
 
 		 447 aa  404  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2614  recombination factor protein RarA  50.23 
 
 		 447 aa  404  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0976  AAA ATPase central domain protein  52.21 
 
 		 423 aa  404  1e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5272  recombination factor protein RarA  51.76 
 
 		 448 aa  400  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24410  recombination factor protein RarA  48.1 
 
 		 439 aa  400  9.999999999999999e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0141  ATPase central domain-containing protein  49.05 
 
 		 416 aa  399  9.999999999999999e-111  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1040  recombination factor protein RarA  52.31 
 
 		 429 aa  396  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.405947  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1710  recombination factor protein RarA  50.8 
 
 		 461 aa  395  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0515171  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0627  recombination factor protein RarA  50.12 
 
 		 449 aa  394  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0620237  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2558  AAA ATPase central domain protein  50.12 
 
 		 446 aa  392  1e-108  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0626  recombination factor protein RarA  49.53 
 
 		 453 aa  393  1e-108  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432966  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1885  recombination factor protein RarA  48.82 
 
 		 447 aa  393  1e-108  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1824  recombination factor protein RarA  51.3 
 
 		 477 aa  394  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00142888  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2050  AAA ATPase central domain-containing protein  52.95 
 
 		 436 aa  389  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1691  recombination factor protein RarA  48.98 
 
 		 465 aa  391  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.297701 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1615  recombination factor protein RarA  47.45 
 
 		 444 aa  386  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.240713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2132  AAA ATPase central domain protein  51.07 
 
 		 463 aa  385  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000588224  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2683  recombination factor protein RarA  47.45 
 
 		 444 aa  386  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.826715  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2022  recombination factor protein RarA  46.99 
 
 		 443 aa  386  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000134258  hitchhiker  0.0000234257 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6097  recombination factor protein RarA  50.57 
 
 		 436 aa  385  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.159169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3035  recombination factor protein RarA  51.53 
 
 		 456 aa  388  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3882  AAA ATPase central domain-containing protein  51.06 
 
 		 448 aa  387  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.781323 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3217  recombination factor protein RarA  48.64 
 
 		 519 aa  387  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0809903  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2594  recombination factor protein RarA  47.45 
 
 		 447 aa  386  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.558915  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1721  recombination factor protein RarA  48.69 
 
 		 447 aa  387  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1815  recombination factor protein RarA  51.06 
 
 		 502 aa  388  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.233507  hitchhiker  0.0000173761 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0488  recombination factor protein RarA  48.29 
 
 		 434 aa  386  1e-106  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000395701  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07770  Recombination protein MgsA  48.97 
 
 		 446 aa  385  1e-106  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.138045 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2325  recombination factor protein RarA  49.88 
 
 		 445 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.90539  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0813  recombination factor protein RarA  48.04 
 
 		 446 aa  388  1e-106  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0334314  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1192  recombination factor protein RarA  44.9 
 
 		 445 aa  385  1e-106  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1704  ATPase central domain-containing protein  48.85 
 
 		 448 aa  385  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159074 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0953  recombination factor protein RarA  48.58 
 
 		 446 aa  387  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2372  recombination factor protein RarA  49.88 
 
 		 445 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1416  recombination factor protein RarA  47.69 
 
 		 447 aa  385  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.680205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2364  recombination factor protein RarA  49.88 
 
 		 445 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602751  normal  0.774501 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1965  recombination factor protein RarA  47.22 
 
 		 443 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00069227  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2011  recombination factor protein RarA  46.99 
 
 		 443 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00309542  hitchhiker  0.000363492 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2052  recombination factor protein RarA  47.45 
 
 		 443 aa  384  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00508723  hitchhiker  0.000142667 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2319  AAA ATPase central domain protein  51.29 
 
 		 460 aa  384  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.935324  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1989  recombination factor protein RarA  48.93 
 
 		 447 aa  385  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>