More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3356 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3356  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 300 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0553918 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  74.4 
 
 		 297 aa  448  1e-125  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.335118 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5812  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  72.39 
 
 		 299 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.613812  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71.72 
 
 		 299 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.337193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71.62 
 
 		 299 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71.14 
 
 		 299 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71.62 
 
 		 299 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1705  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.37 
 
 		 297 aa  402  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2693  putative short chain oxidoreductase  63.18 
 
 		 299 aa  396  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.233392  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.88 
 
 		 301 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.194706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4664  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.12 
 
 		 308 aa  353  1e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.49 
 
 		 299 aa  353  2e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3311  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.48 
 
 		 308 aa  343  2e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000847254  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.09 
 
 		 302 aa  320  1.9999999999999998e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3013  putative oxidoreductase, short- chain dehydrogenase/reductase  53.36 
 
 		 321 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2372  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.51 
 
 		 201 aa  192  5e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.67309 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6416  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 		 307 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.46 
 
 		 307 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.958738  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.46 
 
 		 307 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.18 
 
 		 296 aa  161  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0965696 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2933  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 297 aa  159  7e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000449491  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.93 
 
 		 285 aa  158  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0085  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 		 287 aa  152  8e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 		 291 aa  144  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.387596  hitchhiker  0.000782233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2894  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.54 
 
 		 287 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5455  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.72 
 
 		 292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.980475  normal  0.163061 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.33 
 
 		 276 aa  124  1e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000224332 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.31 
 
 		 329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.821163 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2590  short chain dehydrogenase  30.23 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2778  short chain dehydrogenase  30.23 
 
 		 281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5364  short chain dehydrogenase  38.43 
 
 		 270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2507  short chain dehydrogenase  30.23 
 
 		 291 aa  114  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.56 
 
 		 268 aa  112  5e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2541  short chain dehydrogenase  30.23 
 
 		 291 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000142979  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2783  short chain dehydrogenase  29.77 
 
 		 291 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0502462 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2506  short chain dehydrogenase  29.3 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2827  short chain dehydrogenase  29.77 
 
 		 291 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.199916  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2787  short chain dehydrogenase  28.84 
 
 		 291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2582  short chain dehydrogenase  29.3 
 
 		 291 aa  110  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0166341  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.26 
 
 		 271 aa  108  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl173  dehydrogenase  29.47 
 
 		 278 aa  107  3e-22  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4702  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.27 
 
 		 272 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315563  normal  0.0714958 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3545  short chain dehydrogenase  36.28 
 
 		 268 aa  105  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.351676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1249  short chain dehydrogenase  35.42 
 
 		 279 aa  105  8e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1905  short chain dehydrogenase  31.48 
 
 		 280 aa  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0945301  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1586  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.58 
 
 		 271 aa  105  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2393  short chain dehydrogenase  32.64 
 
 		 344 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.47 
 
 		 338 aa  105  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2806  short chain dehydrogenase  28.37 
 
 		 291 aa  103  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.928497  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4067  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  35.32 
 
 		 298 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.122191  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.22 
 
 		 268 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3218  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.22 
 
 		 268 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.77 
 
 		 273 aa  103  4e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000406118  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.23 
 
 		 268 aa  101  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.710903  normal  0.301955 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4835  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.04 
 
 		 273 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000227026 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0040  short chain dehydrogenase  32.98 
 
 		 283 aa  100  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2479  short chain dehydrogenase  33.85 
 
 		 279 aa  100  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.02 
 
 		 271 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0362247 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0942  short chain dehydrogenase  36.13 
 
 		 268 aa  99.8  5e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46600  short chain dehydrogenase  33.93 
 
 		 268 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000918039  hitchhiker  0.00000172259 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2175  short chain dehydrogenase  34.62 
 
 		 272 aa  99.4  6e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.328635  hitchhiker  0.00607004 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.76 
 
 		 291 aa  99  8e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1567  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.57 
 
 		 284 aa  99  8e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.02 
 
 		 266 aa  99  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal  0.665507 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.57 
 
 		 265 aa  99  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4153  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.33 
 
 		 273 aa  98.6  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.82 
 
 		 286 aa  98.2  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1861  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  33.33 
 
 		 270 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0952097  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3541  short chain dehydrogenase  34.04 
 
 		 270 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100637  normal  0.0669938 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.28 
 
 		 317 aa  97.4  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.38 
 
 		 296 aa  97.1  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0558  short chain dehydrogenase  34.92 
 
 		 272 aa  96.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.449424 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0037  short chain dehydrogenase  32.68 
 
 		 283 aa  96.3  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.97 
 
 		 280 aa  96.7  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4288  short chain dehydrogenase  34.39 
 
 		 287 aa  96.7  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.04 
 
 		 273 aa  96.7  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.180623  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0715  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.8 
 
 		 269 aa  96.3  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2049  short chain dehydrogenase  37.17 
 
 		 286 aa  95.9  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000200632 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0106  short chain dehydrogenase  32.26 
 
 		 284 aa  95.9  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.417565  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2279  short chain dehydrogenase  36.28 
 
 		 272 aa  95.9  8e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.15727 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.45 
 
 		 279 aa  95.5  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000868521 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1733  short chain dehydrogenase  33.86 
 
 		 286 aa  95.5  9e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3107  short-chain alcohol-related dehydrogenase  31.19 
 
 		 272 aa  95.5  9e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.98 
 
 		 267 aa  95.5  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0909607  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0947  gluconate 5-dehydrogenase oxidoreductase protein  33.51 
 
 		 258 aa  95.1  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.815693 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.83 
 
 		 286 aa  95.1  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.866601  normal  0.69464 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0029  short chain dehydrogenase  32.28 
 
 		 278 aa  95.1  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0736  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.28 
 
 		 272 aa  95.1  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2188  thiamine pyrophosphate protein central region  28.42 
 
 		 847 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.941679 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5810  short chain dehydrogenase  32.98 
 
 		 278 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930868  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3791  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.55 
 
 		 273 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0700292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.8 
 
 		 348 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0723  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.43 
 
 		 275 aa  94.4  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.158642  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2579  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.8 
 
 		 348 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.284218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2586  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.8 
 
 		 348 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.2 
 
 		 272 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 		 282 aa  94  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.599912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.62 
 
 		 283 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 		 281 aa  94  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299534  normal  0.313819 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 272 aa  93.6  4e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118258  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>