More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2643 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2903  oxidoreductase domain protein  95.14 
 
 		 352 aa  699    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2643  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 353 aa  738    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000421057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3401  oxidoreductase domain-containing protein  79.89 
 
 		 354 aa  589  1e-167  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2709  oxidoreductase-like  76.86 
 
 		 352 aa  570  1e-161  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3549  oxidoreductase domain-containing protein  74.93 
 
 		 356 aa  559  1e-158  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.933406  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0520  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  74.72 
 
 		 356 aa  555  1e-157  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.282074  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0453  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  74.72 
 
 		 356 aa  555  1e-157  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2957  oxidoreductase domain-containing protein  71.18 
 
 		 341 aa  511  1e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.677308  normal  0.529294 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3156  oxidoreductase-like  69.65 
 
 		 344 aa  489  1e-137  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.215033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1469  response regulator receiver domain-containing protein  68.19 
 
 		 337 aa  467  9.999999999999999e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1107  oxidoreductase domain protein  56.34 
 
 		 360 aa  417  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.49503  normal  0.561455 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4270  oxidoreductase domain protein  56.55 
 
 		 363 aa  416  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.340302 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2670  oxidoreductase domain protein  54.08 
 
 		 360 aa  398  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121169  normal  0.584465 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4569  oxidoreductase domain-containing protein  56.7 
 
 		 359 aa  393  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2081  oxidoreductase, NAD-binding  37.5 
 
 		 337 aa  88.2  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.57998  normal  0.0114237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3076  dehydrogenase-like protein  30.65 
 
 		 342 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2173  oxidoreductase, NAD-binding  36.76 
 
 		 337 aa  86.3  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.312886  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2281  oxidoreductase domain-containing protein  36.76 
 
 		 337 aa  86.3  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.991839  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  25.96 
 
 		 353 aa  84  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  30.05 
 
 		 353 aa  83.6  0.000000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  31.39 
 
 		 330 aa  83.6  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  26.01 
 
 		 369 aa  79.7  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  27.6 
 
 		 359 aa  79  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2307  oxidoreductase domain-containing protein  31.87 
 
 		 715 aa  79  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  27.6 
 
 		 359 aa  79  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  31.72 
 
 		 312 aa  77.4  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3330  oxidoreductase domain protein  25.56 
 
 		 339 aa  77.8  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0129274  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  27.89 
 
 		 364 aa  77  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4707  inositol 2-dehydrogenase  28.57 
 
 		 336 aa  76.6  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0994967  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2038  oxidoreductase domain protein  27.64 
 
 		 327 aa  76.6  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0899813  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02580  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  29.61 
 
 		 384 aa  76.3  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153048  normal  0.354075 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  25.09 
 
 		 347 aa  76.6  0.0000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  31.89 
 
 		 347 aa  75.9  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1332  putative oxidoreductase  29.15 
 
 		 347 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0232  oxidoreductase  26.94 
 
 		 346 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  30.93 
 
 		 362 aa  74.7  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3013  oxidoreductase domain protein  27.8 
 
 		 340 aa  74.7  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  25.88 
 
 		 342 aa  74.3  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  32.43 
 
 		 349 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  25.75 
 
 		 313 aa  73.9  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 344 aa  73.6  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 358 aa  73.6  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0613  oxidoreductase domain protein  27.75 
 
 		 360 aa  73.6  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  26.87 
 
 		 344 aa  72.4  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0901  oxidoreductase-like  34.07 
 
 		 302 aa  71.6  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.780576  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  26.27 
 
 		 332 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  33.53 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  30 
 
 		 351 aa  71.2  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  27.83 
 
 		 331 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  29.35 
 
 		 366 aa  70.1  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2641  myo-inositol dehydrogenase  28.37 
 
 		 345 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  25.32 
 
 		 332 aa  70.1  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  23.6 
 
 		 335 aa  70.1  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3684  oxidoreductase domain-containing protein  25.61 
 
 		 367 aa  70.1  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  27.03 
 
 		 340 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  25.11 
 
 		 353 aa  69.3  0.00000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0878  oxidoreductase domain-containing protein  23.85 
 
 		 310 aa  69.3  0.00000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  25.29 
 
 		 361 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24600  predicted dehydrogenase  29.17 
 
 		 366 aa  68.9  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178343  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3884  oxidoreductase-like  30.18 
 
 		 312 aa  68.9  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0430  myo-inositol dehydrogenase  28.29 
 
 		 345 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104754  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0732  oxidoreductase family protein  28.29 
 
 		 345 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01292  predicted oxidoreductase, NADH-binding  28.11 
 
 		 351 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2331  oxidoreductase domain protein  28.11 
 
 		 351 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.318532  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1430  gfo/idh/mocA family protein  28.11 
 
 		 351 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0656  oxidoreductase domain-containing protein  24.15 
 
 		 320 aa  68.6  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.174066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  23.88 
 
 		 326 aa  67.8  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1807  gfo/idh/mocA family protein  28.11 
 
 		 347 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01303  hypothetical protein  28.11 
 
 		 351 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0290  oxidoreductase-like  33.79 
 
 		 379 aa  68.2  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0348948  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2310  oxidoreductase domain-containing protein  28.11 
 
 		 351 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0970  oxidoreductase domain protein  34.34 
 
 		 385 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.688138  normal  0.0152041 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0785  oxidoreductase domain-containing protein  27.22 
 
 		 345 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.808497 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1960  gfo/idh/mocA family protein  28.11 
 
 		 351 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430175  normal  0.910454 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1838  homoserine dehydrogenase  28.29 
 
 		 345 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1905  oxidoreductase domain protein  26.64 
 
 		 347 aa  67.4  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2847  oxidoreductase  27.81 
 
 		 345 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2654  oxidoreductase domain protein  22.91 
 
 		 325 aa  67.8  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  24.9 
 
 		 361 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1661  oxidoreductase family protein  28.29 
 
 		 345 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1683  oxidoreductase family protein  28.29 
 
 		 345 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21020  predicted dehydrogenase  25.62 
 
 		 332 aa  67.8  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3487  oxidoreductase domain protein  26.9 
 
 		 458 aa  67  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0702  oxidoreductase domain protein  27.09 
 
 		 359 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519642 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4431  oxidoreductase domain-containing protein  27.57 
 
 		 334 aa  67  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326281 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  29.32 
 
 		 356 aa  66.6  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1137  oxidoreductase domain protein  33.81 
 
 		 371 aa  66.6  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.985714 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  31.88 
 
 		 667 aa  66.6  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0984  oxidoreductase domain protein  33.09 
 
 		 371 aa  66.2  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2086  oxidoreductase domain-containing protein  22.75 
 
 		 341 aa  66.2  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4563  oxidoreductase domain-containing protein  34.51 
 
 		 496 aa  66.2  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  27.32 
 
 		 355 aa  66.2  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2927  putative dehydrogenase  23.33 
 
 		 337 aa  66.2  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311728  hitchhiker  0.00000297483 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  31.34 
 
 		 387 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1525  gfo/idh/mocA family protein  27.57 
 
 		 351 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  25.3 
 
 		 387 aa  65.5  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  28.09 
 
 		 340 aa  65.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  24.79 
 
 		 310 aa  65.5  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  23.12 
 
 		 359 aa  65.1  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4260  oxidoreductase domain protein  29.52 
 
 		 384 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.399904 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>