233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2967 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2967  outer membrane signal peptide protein  100 
 
 		 224 aa  455  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2898  OmpW family protein  81.25 
 
 		 224 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3245  OmpW family protein  80.8 
 
 		 224 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5426  OmpW  53.6 
 
 		 216 aa  227  9e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73158  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0564  OmpW family protein  55.02 
 
 		 208 aa  216  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0567  OmpW family protein  54.07 
 
 		 208 aa  212  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.898209  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0535  outer membrane protein, OmpW  52.63 
 
 		 208 aa  209  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.173529  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1490  putative outer membrane signal peptide protein  53.37 
 
 		 228 aa  206  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.709079 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5886  OmpW family outer membrane protein  46.22 
 
 		 245 aa  190  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3290  putative outer membrane signal peptide protein  54.5 
 
 		 196 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.106393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4836  OmpW family protein  49.09 
 
 		 204 aa  187  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1585  OmpW family protein  49.05 
 
 		 195 aa  187  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2289  OmpW family protein  49.05 
 
 		 195 aa  187  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.473084  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0280  OmpW  46.46 
 
 		 227 aa  181  8.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0116  OmpW family protein  49.47 
 
 		 198 aa  174  8e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0772399 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3094  OmpW family protein  49.75 
 
 		 219 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000267766  normal  0.518029 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0220  OmpW family protein  46.84 
 
 		 198 aa  162  5.0000000000000005e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221002 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0627  OmpW  40 
 
 		 219 aa  160  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2313  OmpW family protein  41.07 
 
 		 222 aa  154  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.742705  normal  0.203031 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1946  OmpW family outer membrane porin  40.27 
 
 		 218 aa  152  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000112582  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1282  OmpW family protein  39.37 
 
 		 215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.851458 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1675  OmpW family protein  40.09 
 
 		 213 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0685141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1680  OmpW family protein  40.09 
 
 		 221 aa  145  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.163769  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1507  OmpW family protein  43.46 
 
 		 216 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5052  OmpW family protein  39.19 
 
 		 213 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.394999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6323  OmpW  39.9 
 
 		 212 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1756  OmpW family protein  39.9 
 
 		 212 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0976  OmpW family protein  42.13 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591363 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1769  OmpW family protein  39.9 
 
 		 212 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51453 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1304  OmpW family outer membrane protein  36.49 
 
 		 214 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.115603  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2273  OmpW family outer membrane protein  36.49 
 
 		 214 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155378  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0104  OmpW family outer membrane protein  36.49 
 
 		 214 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2182  OmpW family outer membrane protein  36.49 
 
 		 214 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.556  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1791  OmpW family outer membrane protein  36.49 
 
 		 214 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.363185  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2127  OmpW family outer membrane protein  36.04 
 
 		 214 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767621  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0946  putative outer membrane protein precursor of unknown function  38.08 
 
 		 243 aa  138  7.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0595  OmpW family protein  42.93 
 
 		 206 aa  138  8.999999999999999e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.761797  hitchhiker  0.00324214 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2313  outer membrane protein W precursor  37.93 
 
 		 194 aa  136  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1061  OmpW family outer membrane protein  37.93 
 
 		 194 aa  136  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1128  OmpW family protein  40.74 
 
 		 210 aa  135  6.0000000000000005e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.913908  normal  0.155825 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4394  OmpW  39.33 
 
 		 230 aa  131  9e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.140783 
 
 
-
 
NC_004310  BR1562  hypothetical protein  41.03 
 
 		 227 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1510  hypothetical protein  41.03 
 
 		 227 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1086  OmpW family protein  35.92 
 
 		 216 aa  128  7.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.832301 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4324  OmpW  40.31 
 
 		 229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.238365 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4994  OmpW family protein  39.18 
 
 		 229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0719  OmpW family protein  38.74 
 
 		 214 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0580  OmpW family protein  43.43 
 
 		 224 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2305  OmpW family protein  42.01 
 
 		 233 aa  126  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.535052  normal  0.101902 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1603  OmpW family protein  41.45 
 
 		 227 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3800  outer membrane protein  37.9 
 
 		 233 aa  125  5e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.550263  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1957  OmpW family protein  37.95 
 
 		 221 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1968  OmpW family protein  36.46 
 
 		 228 aa  118  7.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.135565 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4219  OmpW  38.22 
 
 		 229 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.922392 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0777  OmpW family protein  39 
 
 		 267 aa  115  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.262846 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1169  OmpW family protein  37.97 
 
 		 201 aa  106  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.122792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2507  outer membrane protein  37.97 
 
 		 203 aa  106  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0804612  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2534  outer membrane protein W  32.29 
 
 		 218 aa  104  9e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3636  OmpW family protein  28.95 
 
 		 211 aa  101  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.779637  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2180  outer membrane protein W  35.75 
 
 		 210 aa  101  8e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.41802  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00029  outer membrane protein OmpW  33.62 
 
 		 224 aa  100  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.25785  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1392  outer membrane protein W  33.78 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00591184  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2554  outer membrane protein W  33.79 
 
 		 213 aa  100  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.030228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2319  OmpW family protein  33.16 
 
 		 243 aa  99  5e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0284757 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2000  outer membrane protein W  33.49 
 
 		 210 aa  98.6  7e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1673  outer membrane protein W  33.64 
 
 		 214 aa  97.8  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2012  OmpW family protein  35.85 
 
 		 200 aa  97.1  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2601  outer membrane protein W  32.73 
 
 		 215 aa  97.4  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000011484  decreased coverage  0.0000000556975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2668  outer membrane protein W  32.73 
 
 		 215 aa  97.4  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000483878  normal  0.0120446 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0915  OmpW family protein  29.15 
 
 		 217 aa  97.4  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5385  OmpW family protein  33.67 
 
 		 211 aa  97.1  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3220  OmpW family protein  32.52 
 
 		 209 aa  97.1  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185502  normal  0.270879 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2322  outer membrane protein W  33.48 
 
 		 211 aa  96.7  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1940  outer membrane protein W  33.48 
 
 		 211 aa  96.7  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.218273  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000903  outer membrane protein W precursor  32.16 
 
 		 214 aa  96.3  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2049  outer membrane protein W  33.48 
 
 		 211 aa  95.9  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1485  outer membrane protein W  32.73 
 
 		 214 aa  95.5  6e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0850248  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1521  outer membrane protein W  32.73 
 
 		 214 aa  95.5  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00262855  normal  0.530215 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2299  outer membrane protein W  32.88 
 
 		 210 aa  95.1  8e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0734  OmpW  33.16 
 
 		 200 aa  95.1  8e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3005  OmpW family protein  34.95 
 
 		 202 aa  94.7  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.561754  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1985  OmpW family protein  31.19 
 
 		 264 aa  94.7  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.810927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1371  outer membrane protein W  35.32 
 
 		 213 aa  94.4  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0573693 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0679  outer membrane protein OmpW  36.65 
 
 		 228 aa  94  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2861  outer membrane protein W  32.73 
 
 		 214 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00340553  unclonable  0.0000000000012731 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1265  outer membrane protein precursor  33.7 
 
 		 209 aa  93.6  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000128049  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1299  OmpW family protein  28.05 
 
 		 202 aa  93.6  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0529248  normal  0.202577 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1490  outer membrane protein W  32.27 
 
 		 215 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000649255  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5029  OmpW  30.62 
 
 		 232 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411044 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06904  outer membrane protein W  30.97 
 
 		 213 aa  93.2  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1749  OmpW family protein  31.16 
 
 		 226 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2445  OmpW family protein  33.64 
 
 		 214 aa  92.8  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.334993  normal  0.396638 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0370  outer membrane protein W  30.22 
 
 		 217 aa  92.4  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4473  OmpW  36.02 
 
 		 228 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2085  OmpW family protein  30.21 
 
 		 226 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.350227  hitchhiker  0.00113092 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3207  outer membrane protein W  31.96 
 
 		 214 aa  90.5  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000387398  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1939  outer membrane protein W  32.27 
 
 		 210 aa  89.7  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.940404  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2787  outer membrane protein W  38.46 
 
 		 215 aa  89.4  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0424619  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0434  OmpW family protein  31.96 
 
 		 246 aa  88.2  8e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0587861  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2589  outer membrane protein W  32.73 
 
 		 214 aa  88.2  9e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000746821  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>