83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4195 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4195  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 873 aa  1772    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2364  glycosyl transferase group 1  37.08 
 
 		 774 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.869085  normal  0.0140446 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0491  glycosyl transferase group 1  33.97 
 
 		 867 aa  181  4e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0057  glycosyl transferase group 1  35.42 
 
 		 791 aa  174  6.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169678  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00740  glycosyltransferase  38.24 
 
 		 787 aa  172  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.456388 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5190  glycosyl transferase group 1  30.86 
 
 		 671 aa  172  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00612346  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  30.75 
 
 		 3301 aa  169  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4941  glycosyl transferase group 1  33.61 
 
 		 414 aa  169  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2484  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 856 aa  165  3e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.672737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  30.05 
 
 		 1644 aa  161  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  30.05 
 
 		 1644 aa  161  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2908  glycosyl transferase, group 1  35.64 
 
 		 401 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4120  glycosyl transferase group 1  30.06 
 
 		 392 aa  148  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0763  glycosyl transferase group 1  32.22 
 
 		 725 aa  141  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3791  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 		 392 aa  139  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.242824  normal  0.21889 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2454  LpsE protein  29.08 
 
 		 383 aa  139  3.0000000000000003e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4003  glycosyl transferase group 1  28.73 
 
 		 545 aa  135  5e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.351709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4279  glycosyl transferase, group 1  30.98 
 
 		 389 aa  134  7.999999999999999e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00770  glycosyltransferase  32.79 
 
 		 916 aa  129  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2478  glycosyl transferase, group 1  28.31 
 
 		 379 aa  127  9e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1074  glycosyl transferase group 1  32.19 
 
 		 404 aa  119  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168382  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4009  glycosyl transferase, group 1  35.24 
 
 		 1386 aa  112  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2706  glycosyl transferase group 1  30.61 
 
 		 373 aa  103  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0324708 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3634  glycosyl transferase group 1  30.3 
 
 		 1044 aa  94.7  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.578618  normal  0.0749406 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 		 679 aa  93.2  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3884  glycosyl transferase group 1  27.37 
 
 		 359 aa  91.3  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.242445 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  29.27 
 
 		 616 aa  87.8  7e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  28.69 
 
 		 624 aa  86.3  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0855  glycosyl transferase, group 1  27.93 
 
 		 359 aa  84.7  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1988  glycosyl transferase group 1  26.5 
 
 		 374 aa  75.9  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.590311  normal  0.0366847 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1720  glycosyl transferase, group 1  26.09 
 
 		 377 aa  74.7  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588865 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2764  glycosyl transferase group 1  28.69 
 
 		 357 aa  70.9  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6932  glycosyl transferase group 1  27.35 
 
 		 1233 aa  70.1  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0899413 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  26.27 
 
 		 1635 aa  62.4  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1229  putative glycosyltransferase  22.75 
 
 		 1219 aa  60.8  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.197488  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2470  glycosyl transferase, group 1  31.5 
 
 		 345 aa  57.8  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2949  glycosyl transferase group 1  29.18 
 
 		 332 aa  57.4  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2351  hypothetical protein  26.04 
 
 		 376 aa  53.5  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0743287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2363  glycosyl transferase, group 1  27.6 
 
 		 371 aa  53.5  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629772  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  29.95 
 
 		 367 aa  52.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21071  hypothetical protein  22.34 
 
 		 1232 aa  52.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0432  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.46 
 
 		 459 aa  52.4  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.568874  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0375  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.46 
 
 		 462 aa  52  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0107  Methyltransferase type 11  29.71 
 
 		 995 aa  52.4  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0910  methyltransferase FkbM family  24.51 
 
 		 1364 aa  50.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1536  glycosyl transferase group 1  20.61 
 
 		 380 aa  49.3  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.465215  normal  0.248937 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0742  glycosyl transferase, group 1  24.01 
 
 		 369 aa  48.9  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.377387  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3410  glycosyl transferase group 1  27.41 
 
 		 366 aa  48.1  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  25.57 
 
 		 346 aa  47.8  0.0009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11690  glycogen synthase  26.92 
 
 		 398 aa  47.8  0.0009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328537  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2773  glycosyl transferase, group 1  24.78 
 
 		 348 aa  47.8  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0129  mannosyltransferase  27.32 
 
 		 374 aa  47  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00122575 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  25.11 
 
 		 391 aa  47.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  33.67 
 
 		 420 aa  47  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2958  glycosyl transferase group 1  27.48 
 
 		 366 aa  47.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.298871  hitchhiker  0.000213048 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3658  glycosyl transferase group 1  27.92 
 
 		 452 aa  47.8  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0710404  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3090  glycosyl transferase, group 1  32.14 
 
 		 440 aa  47.4  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  31.3 
 
 		 405 aa  47  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.91 
 
 		 373 aa  46.6  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2445  glycosyl transferase group 1  27.38 
 
 		 375 aa  46.6  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2341  glycosyl transferase group 1  26.77 
 
 		 345 aa  47  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.220594 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2494  glycosyl transferase group 1  27.7 
 
 		 452 aa  46.6  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.044708  normal  0.0808495 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2444  glycosyl transferase, group 1  25.13 
 
 		 345 aa  46.6  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1121  glycosyl transferase group 1  31.62 
 
 		 386 aa  45.8  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.606067  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0562  glycosyltransferase  25.85 
 
 		 416 aa  45.4  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.841887  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 378 aa  45.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  25.93 
 
 		 401 aa  45.4  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5094  glycosyl transferase group 1  25.17 
 
 		 382 aa  45.4  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2857  group 1 glycosyl transferase  28.07 
 
 		 391 aa  45.4  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2643  endo-1,4-beta-xylanase  25.79 
 
 		 770 aa  45.4  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1149  glycosyl transferase group 1  26.12 
 
 		 389 aa  45.4  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1068  glycosyl transferase group 1  27.97 
 
 		 658 aa  45.1  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114697  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  24.77 
 
 		 390 aa  45.1  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0991  glycosyl transferase group 1  29.46 
 
 		 346 aa  45.1  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00704021  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  39.73 
 
 		 406 aa  45.1  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4283  glycosyl transferase, group 1  29.17 
 
 		 1229 aa  45.1  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  30.4 
 
 		 384 aa  45.1  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  28.97 
 
 		 398 aa  44.7  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3119  group 1 glycosyl transferase  25.11 
 
 		 400 aa  44.7  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6256  hypothetical protein  26.62 
 
 		 497 aa  44.3  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3222  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 365 aa  44.3  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  22.67 
 
 		 424 aa  44.3  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1790  glycosyl transferase group 1  26.51 
 
 		 380 aa  44.3  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>