More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2966 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 254 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.437274  normal  0.59964 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1150  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.13 
 
 		 253 aa  291  5e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.718772 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.47 
 
 		 253 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3076  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.45 
 
 		 254 aa  264  8.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.575838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3213  short chain dehydrogenase  49.6 
 
 		 254 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2906  short chain dehydrogenase  49.6 
 
 		 257 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.01573  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2971  short chain dehydrogenase  49.2 
 
 		 257 aa  231  6e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3195  short chain dehydrogenase  48.4 
 
 		 254 aa  230  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.961383  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2979  short chain dehydrogenase  48.8 
 
 		 257 aa  229  3e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000666637  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3493  short chain dehydrogenase  48.21 
 
 		 252 aa  229  3e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3204  short chain dehydrogenase  48.8 
 
 		 257 aa  229  3e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00024474  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1849  short chain dehydrogenase  48.61 
 
 		 252 aa  229  3e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1932  short chain dehydrogenase  48.21 
 
 		 252 aa  229  4e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.362835  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2927  short chain dehydrogenase  48.8 
 
 		 254 aa  229  4e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.75 
 
 		 255 aa  228  7e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1664  short chain dehydrogenase  47.81 
 
 		 252 aa  227  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316007  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3239  short chain dehydrogenase  48.4 
 
 		 254 aa  227  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304035  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1705  short chain dehydrogenase  47.81 
 
 		 252 aa  226  3e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.957083  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1712  short chain dehydrogenase  47.41 
 
 		 252 aa  226  4e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1847  short chain dehydrogenase  47.41 
 
 		 252 aa  226  4e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2870  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  47.01 
 
 		 254 aa  226  4e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2043  short chain dehydrogenase  48 
 
 		 254 aa  226  4e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.179832  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1689  short chain dehydrogenase  47.41 
 
 		 252 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1886  short chain dehydrogenase  47.01 
 
 		 252 aa  223  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6424  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.36 
 
 		 255 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.19 
 
 		 255 aa  216  4e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00687705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49 
 
 		 254 aa  209  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.293604  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5749  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.91 
 
 		 257 aa  202  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0613473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.48 
 
 		 255 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5176  short-chain dehydrogenase  49.8 
 
 		 254 aa  198  7e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0340709  hitchhiker  0.00401231 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.06 
 
 		 265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4321  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.18 
 
 		 251 aa  196  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3215  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.96 
 
 		 251 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.707751 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0590  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.97 
 
 		 256 aa  195  6e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2591  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.59 
 
 		 250 aa  195  6e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.573259 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49 
 
 		 254 aa  195  6e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.260797 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1224  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  46.43 
 
 		 255 aa  194  8.000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0621066  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0549  putative short-chain type dehydrogenase/reductase  48.02 
 
 		 248 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.613292 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.18 
 
 		 256 aa  194  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.382546 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1452  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.82 
 
 		 259 aa  193  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.85 
 
 		 263 aa  193  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204744  normal  0.374158 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.38 
 
 		 252 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.281349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5170  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.08 
 
 		 257 aa  192  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 		 246 aa  190  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.58 
 
 		 254 aa  190  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.199031 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3110  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.31 
 
 		 246 aa  189  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.9 
 
 		 259 aa  189  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.508764  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2778  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.01 
 
 		 252 aa  189  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2597  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  45.24 
 
 		 252 aa  189  5e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.83 
 
 		 262 aa  188  7e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.469065 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.82 
 
 		 254 aa  187  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.247602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.8 
 
 		 248 aa  187  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.56 
 
 		 253 aa  187  2e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.192995  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1378  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.23 
 
 		 247 aa  186  3e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4328  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.26 
 
 		 250 aa  185  7e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0215528 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0580  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.53 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1951  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.97 
 
 		 247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262535 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2886  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.29 
 
 		 254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.808973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5653  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.64 
 
 		 252 aa  182  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.203943 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.37 
 
 		 251 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0969  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.63 
 
 		 256 aa  182  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.03 
 
 		 248 aa  181  7e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.34 
 
 		 251 aa  181  7e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102183 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.77 
 
 		 254 aa  181  8.000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1053  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.9 
 
 		 253 aa  180  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.355972  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.14 
 
 		 254 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0490038  normal  0.520511 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.08 
 
 		 254 aa  179  4e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.43 
 
 		 252 aa  178  9e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.58328  normal  0.46661 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.34 
 
 		 254 aa  177  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.91487  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1091  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  41.63 
 
 		 246 aa  177  1e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0983747 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 		 246 aa  177  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.606354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.6 
 
 		 277 aa  176  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.17 
 
 		 246 aa  176  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.38 
 
 		 263 aa  176  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.15 
 
 		 246 aa  176  3e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.740498  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.58 
 
 		 250 aa  176  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.38 
 
 		 243 aa  175  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151121  normal  0.0260274 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.13 
 
 		 249 aa  175  5e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2232  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.06 
 
 		 253 aa  175  6e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.38 
 
 		 243 aa  175  6e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.57 
 
 		 247 aa  175  7e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.332896 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 		 261 aa  175  7e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.25 
 
 		 247 aa  175  7e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.83 
 
 		 253 aa  174  8e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.83 
 
 		 253 aa  174  9e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0806  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.87 
 
 		 248 aa  174  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2023  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.92 
 
 		 275 aa  174  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.759613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1573  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  41 
 
 		 266 aa  174  9.999999999999999e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.647658  normal  0.48808 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0336  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.43 
 
 		 248 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0250  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.83 
 
 		 253 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.19 
 
 		 253 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.92 
 
 		 251 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 		 248 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.83 
 
 		 248 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.05 
 
 		 248 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.997672 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2692  short chain dehydrogenase  42.68 
 
 		 246 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.843441 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.15 
 
 		 251 aa  172  5.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1990  oxidoreductase  41.3 
 
 		 254 aa  171  7.999999999999999e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3123  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.48 
 
 		 251 aa  171  7.999999999999999e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0932491  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.43 
 
 		 247 aa  171  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>