More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2494 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0129  dihydroxy-acid dehydratase  71.06 
 
 		 577 aa  835    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.256521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5056  dihydroxy-acid dehydratase  81.8 
 
 		 577 aa  955    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.644776  hitchhiker  0.0033961 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4456  dihydroxy-acid dehydratase  90.24 
 
 		 574 aa  1061    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.40325 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1909  dihydroxy-acid dehydratase  83.68 
 
 		 576 aa  997    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.832097 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1954  dihydroxy-acid dehydratase  83.33 
 
 		 576 aa  991    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0062  dihydroxy-acid dehydratase  69.85 
 
 		 587 aa  830    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2494  dihydroxy-acid dehydratase  100 
 
 		 574 aa  1182    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.000806623  normal  0.595086 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2806  dihydroxy-acid dehydratase  90.77 
 
 		 574 aa  1062    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.852293 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5368  dihydroxy-acid dehydratase  80.94 
 
 		 577 aa  951    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0341444  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1688  dihydroxy-acid dehydratase  78.75 
 
 		 575 aa  928    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3131  dihydroxy-acid dehydratase  70.37 
 
 		 576 aa  817    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.696259  normal  0.295178 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3010  dihydroxy-acid dehydratase  73.96 
 
 		 576 aa  892    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496774 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2924  dihydroxy-acid dehydratase  81.26 
 
 		 576 aa  963    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1984  dihydroxy-acid dehydratase  68.72 
 
 		 577 aa  785    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.9458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2230  dihydroxy-acid dehydratase  83.33 
 
 		 576 aa  991    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.941332 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2674  dihydroxy-acid dehydratase  55.68 
 
 		 568 aa  613  9.999999999999999e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.143289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3271  dihydroxy-acid dehydratase  55.8 
 
 		 561 aa  598  1e-169  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0753246 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0886  dihydroxy-acid dehydratase  53.61 
 
 		 558 aa  598  1e-169  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0711  dihydroxy-acid dehydratase  52.09 
 
 		 557 aa  587  1e-166  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3109  dihydroxy-acid dehydratase  51.25 
 
 		 573 aa  584  1.0000000000000001e-165  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0901  dihydroxy-acid dehydratase  53.46 
 
 		 588 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.356877 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4952  dihydroxy-acid dehydratase  53.97 
 
 		 567 aa  578  1.0000000000000001e-163  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1406  dihydroxy-acid dehydratase  52.3 
 
 		 569 aa  572  1.0000000000000001e-162  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1326  dihydroxy-acid dehydratase  53.16 
 
 		 566 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.303836  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1660  dihydroxy-acid dehydratase  53.5 
 
 		 568 aa  574  1.0000000000000001e-162  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.06554 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1134  dihydroxy-acid dehydratase  52.3 
 
 		 570 aa  569  1e-161  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0498657  hitchhiker  0.00011132 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10650  dihydroxyacid dehydratase  52.14 
 
 		 582 aa  566  1e-160  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0955511 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0486  dihydroxy-acid dehydratase  51.51 
 
 		 589 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.113463 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0136  dihydroxy-acid dehydratase  51.24 
 
 		 580 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0617591 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1711  dihydroxy-acid dehydratase  52.98 
 
 		 571 aa  563  1.0000000000000001e-159  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.835753  normal  0.93934 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0146  dihydroxy-acid dehydratase  51.24 
 
 		 580 aa  564  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2540  dihydroxy-acid dehydratase  52.14 
 
 		 573 aa  565  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0297342  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0705  dihydroxy-acid dehydratase  52.14 
 
 		 558 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0155  dihydroxy-acid dehydratase  51.24 
 
 		 580 aa  564  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.826193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0173  dihydroxy-acid dehydratase  51.68 
 
 		 565 aa  565  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2280  dihydroxy-acid dehydratase  51.6 
 
 		 572 aa  561  1e-158  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000860305 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10190  dihydroxy-acid dehydratase  51.69 
 
 		 575 aa  559  1e-158  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.539259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4076  dihydroxy-acid dehydratase  52.59 
 
 		 575 aa  558  1e-158  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1852  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5162  dihydroxy-acid dehydratase  52.04 
 
 		 588 aa  559  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0237  dihydroxy-acid dehydratase  52.46 
 
 		 578 aa  558  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1524  dihydroxy-acid dehydratase  51.69 
 
 		 588 aa  556  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00289701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2526  dihydroxy-acid dehydratase  51.78 
 
 		 573 aa  556  1e-157  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08500  dihydroxy-acid dehydratase  51.96 
 
 		 575 aa  555  1e-156  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0463604  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1240  dihydroxy-acid dehydratase  48.84 
 
 		 564 aa  552  1e-156  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.325015  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0848  dihydroxy-acid dehydratase  49.37 
 
 		 558 aa  550  1e-155  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0103963  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2389  dihydroxy-acid dehydratase  50.9 
 
 		 570 aa  549  1e-155  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1334  dihydroxy-acid dehydratase  52.41 
 
 		 563 aa  548  1e-154  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2450  dihydroxy-acid dehydratase  52.5 
 
 		 658 aa  548  1e-154  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3419  dihydroxy-acid dehydratase  50.89 
 
 		 567 aa  546  1e-154  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2979  dihydroxy-acid dehydratase  49.36 
 
 		 559 aa  542  1e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.633648  hitchhiker  0.000413857 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0196  dihydroxy-acid dehydratase  48.75 
 
 		 566 aa  541  1e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3155  dihydroxy-acid dehydratase  48.74 
 
 		 559 aa  542  1e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0346  dihydroxy-acid dehydratase  48.18 
 
 		 557 aa  539  9.999999999999999e-153  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11990  dihydroxy-acid dehydratase  51.6 
 
 		 579 aa  540  9.999999999999999e-153  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.885522  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0624  dihydroxy-acid dehydratase  49.03 
 
 		 580 aa  538  9.999999999999999e-153  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2082  dihydroxy-acid dehydratase  48.83 
 
 		 562 aa  536  1e-151  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3669  dihydroxy-acid dehydratase  48.21 
 
 		 562 aa  535  1e-151  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.281782 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2114  dihydroxy-acid dehydratase  49.55 
 
 		 578 aa  538  1e-151  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0847  dihydroxy-acid dehydratase  48.22 
 
 		 567 aa  535  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0511705 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0023  dihydroxy-acid dehydratase  46.74 
 
 		 563 aa  533  1e-150  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.393007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1548  dihydroxy-acid dehydratase  50.27 
 
 		 567 aa  532  1e-150  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0456866  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1758  dihydroxy-acid dehydratase  47.86 
 
 		 563 aa  533  1e-150  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.771853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2821  dihydroxy-acid dehydratase  47.64 
 
 		 561 aa  530  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00495915 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1347  dihydroxy-acid dehydratase  47.89 
 
 		 577 aa  528  1e-149  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0142863 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1221  dihydroxy-acid dehydratase  48.55 
 
 		 561 aa  530  1e-149  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.240035 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1593  dihydroxy-acid dehydratase  48.72 
 
 		 556 aa  527  1e-148  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0324  dihydroxy-acid dehydratase  49 
 
 		 571 aa  528  1e-148  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0368  dihydroxy-acid dehydratase  46.33 
 
 		 563 aa  525  1e-148  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2347  dihydroxy-acid dehydratase  47.26 
 
 		 579 aa  528  1e-148  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1387  dihydroxy-acid dehydratase  47.18 
 
 		 560 aa  525  1e-148  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.63064  normal  0.987031 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1370  dihydroxy-acid dehydratase  48 
 
 		 557 aa  528  1e-148  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08490  dihydroxy-acid dehydratase  50.44 
 
 		 571 aa  526  1e-148  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1673  dihydroxy-acid dehydratase  47.82 
 
 		 557 aa  528  1e-148  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.379644  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2530  dihydroxy-acid dehydratase  46.99 
 
 		 564 aa  523  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0680  dihydroxy-acid dehydratase  46.36 
 
 		 564 aa  518  1e-146  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.106773  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3121  dihydroxy-acid dehydratase  47.04 
 
 		 561 aa  519  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0782  dihydroxy-acid dehydratase  45.03 
 
 		 557 aa  518  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.729892  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2259  dihydroxyacid dehydratase  50.28 
 
 		 552 aa  520  1e-146  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08361  dihydroxy-acid dehydratase  45.03 
 
 		 557 aa  519  1e-146  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2999  dihydroxy-acid dehydratase  47.22 
 
 		 561 aa  520  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.398415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0019  dihydroxy-acid dehydratase  46.13 
 
 		 561 aa  521  1e-146  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1920  dihydroxy-acid dehydratase  47.56 
 
 		 559 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.316407 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0062  dihydroxy-acid dehydratase  46.29 
 
 		 562 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2052  dihydroxy-acid dehydratase  46.08 
 
 		 564 aa  515  1.0000000000000001e-145  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1490  dihydroxy-acid dehydratase  46.72 
 
 		 560 aa  515  1.0000000000000001e-145  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00950553 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08091  dihydroxy-acid dehydratase  45.03 
 
 		 559 aa  516  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.287074  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0987  dihydroxy-acid dehydratase  47.18 
 
 		 564 aa  517  1.0000000000000001e-145  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.831575  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1071  dihydroxy-acid dehydratase  47.18 
 
 		 564 aa  517  1.0000000000000001e-145  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1170  dihydroxy-acid dehydratase  46 
 
 		 563 aa  515  1e-144  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.385024 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1109  dihydroxy-acid dehydratase  48 
 
 		 564 aa  514  1e-144  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1553  dihydroxy-acid dehydratase  48.55 
 
 		 563 aa  514  1e-144  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143997  normal  0.944928 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08341  dihydroxy-acid dehydratase  44.67 
 
 		 557 aa  514  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.924218  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1222  dihydroxy-acid dehydratase  46.01 
 
 		 557 aa  510  1e-143  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.640338  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09881  dihydroxy-acid dehydratase  45.29 
 
 		 556 aa  507  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.457791  normal  0.235349 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1260  dihydroxy-acid dehydratase  46.01 
 
 		 557 aa  507  9.999999999999999e-143  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.77083  normal  0.952172 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0116  dihydroxy-acid dehydratase  48.64 
 
 		 555 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10820  dihydroxy-acid dehydratase  48.82 
 
 		 551 aa  505  9.999999999999999e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0302  dihydroxy-acid dehydratase  46.52 
 
 		 552 aa  504  1e-141  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2116  dihydroxy-acid dehydratase  47.47 
 
 		 558 aa  503  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.296352  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2877  dihydroxy-acid dehydratase  45.36 
 
 		 564 aa  503  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.420141 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>