More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2628 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2628  ABC transporter  100 
 
 		 230 aa  455  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.166504  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2875  ABC transporter, ATP-binding protein  86.52 
 
 		 230 aa  370  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0026509  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4235  ABC transporter related  55.02 
 
 		 228 aa  234  1.0000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52030  ATP binding component of ABC transporter  55.7 
 
 		 238 aa  228  8e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.90584  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0466  ABC transporter related protein  50.91 
 
 		 222 aa  219  3e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1841  ABC transporter, ATP-binding protein  47.32 
 
 		 238 aa  171  6.999999999999999e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.551478  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1669  ABC transporter related  45.5 
 
 		 251 aa  159  4e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.764744  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2312  ABC transporter related  45.93 
 
 		 234 aa  152  5e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.248823  hitchhiker  0.0000468431 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00860  putative ATP-binding component of ABC transporter  47.8 
 
 		 239 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000878092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0144  ABC transporter ATP-binding protein  47.32 
 
 		 239 aa  145  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.47583  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1701  ATPase  40 
 
 		 240 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.620814 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1317  ABC transporter related  38.36 
 
 		 270 aa  132  6e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0308  ABC transporter ATP-binding protein  41.67 
 
 		 237 aa  129  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0332817 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3501  ABC transporter related  37.8 
 
 		 241 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.667044 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2018  ABC transporter related  38.97 
 
 		 238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1251  ABC transporter related  41.85 
 
 		 228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.799033  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3341  ABC transporter related  38.39 
 
 		 247 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3692  ABC transporter, ATP-binding protein  38.39 
 
 		 246 aa  126  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2864  ABC transporter related  39.23 
 
 		 230 aa  126  3e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1019  ABC transporter related  38.39 
 
 		 247 aa  126  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0998  ABC transporter related  38.39 
 
 		 247 aa  126  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1031  ABC transporter related  38.39 
 
 		 246 aa  126  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3364  ABC transporter related  39.29 
 
 		 243 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0863  ABC transporter related  38.39 
 
 		 246 aa  125  7e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3159  ABC transporter related  38.39 
 
 		 246 aa  125  7e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3260  ABC transporter related  38.39 
 
 		 246 aa  125  7e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  40.76 
 
 		 277 aa  124  9e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_002950  PG0685  ABC transporter, ATP-binding protein  40.21 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246956 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  40.11 
 
 		 242 aa  124  1e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2991  ABC transporter related  38.39 
 
 		 246 aa  124  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  36.71 
 
 		 228 aa  124  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3722  ABC transporter related  36.84 
 
 		 263 aa  123  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.323053 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  39.78 
 
 		 642 aa  122  4e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3150  ABC transporter component  40.91 
 
 		 240 aa  122  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0898  ABC transporter related  36.84 
 
 		 232 aa  122  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3220  ABC transporter related  40.67 
 
 		 213 aa  122  4e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.724202  normal  0.630522 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4072  ABC transporter related  37.44 
 
 		 253 aa  122  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2850  ABC transporter related  36.97 
 
 		 240 aa  121  7e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  37.93 
 
 		 230 aa  121  8e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3186  ABC transporter related  37.86 
 
 		 252 aa  121  9e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1760  ABC transporter related  36.41 
 
 		 250 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0299  ABC transporter related  34.76 
 
 		 225 aa  120  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0268  ABC transporter related  42.93 
 
 		 277 aa  120  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000875319 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3266  ABC transporter related  38.16 
 
 		 259 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2214  ABC transporter, ATPase subunit  37.98 
 
 		 230 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6890  ABC transporter related  40.72 
 
 		 226 aa  120  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  36.19 
 
 		 224 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0292  ABC transporter related  34.76 
 
 		 225 aa  120  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0198  ABC transporter related  35.78 
 
 		 251 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0231  ABC transporter related  39.68 
 
 		 244 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  38.16 
 
 		 239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  35.71 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0481  ABC transporter related  36.92 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1972  ABC transporter related  43.58 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0191  ABC transporter related  36.41 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00111007  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  36.62 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4659  ABC transporter related  36.45 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2439  ABC transporter related  40.84 
 
 		 280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.110449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2586  peptide ABC transporter ATPase  39.57 
 
 		 223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0380  ABC transporter, ATP-binding protein  36.95 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4867  ABC transporter, ATP-binding protein  36.95 
 
 		 253 aa  119  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4576  ABC transporter related  36.95 
 
 		 253 aa  119  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1333  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  41.08 
 
 		 229 aa  119  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0369942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6611  ABC transporter related  45.16 
 
 		 660 aa  119  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.961968 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4643  ABC transporter ATP-binding protein  36.95 
 
 		 253 aa  119  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4478  ABC transporter, ATP-binding protein  36.95 
 
 		 253 aa  119  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1755  ABC transporter related  34.27 
 
 		 224 aa  119  3e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0195851  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4496  ABC transporter, ATP-binding protein  36.95 
 
 		 253 aa  119  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3418  ABC transporter-related protein  36.95 
 
 		 266 aa  120  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0483067  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4997  ABC transporter ATP-binding protein  36.95 
 
 		 253 aa  119  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2239  ABC transporter related  38.14 
 
 		 233 aa  120  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  39.46 
 
 		 642 aa  119  3e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4881  ABC transporter, ATP-binding protein  36.45 
 
 		 253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4888  ABC transporter, ATP-binding protein  36.45 
 
 		 253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2023  ABC transporter, ATP-binding protein  37.17 
 
 		 253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0759  ABC transporter ATP-binding protein  36.19 
 
 		 224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  39.06 
 
 		 228 aa  119  3.9999999999999996e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3406  ABC transporter related  38.95 
 
 		 240 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.225311  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  41.9 
 
 		 224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2310  ABC transporter related  36.95 
 
 		 253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00369124  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5251  bacitracin export ATP-binding protein BceA  37.37 
 
 		 253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  36.79 
 
 		 224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3314  ABC transporter related protein  38.5 
 
 		 643 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0095  ABC transporter related  38.54 
 
 		 235 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  36.79 
 
 		 224 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  36.79 
 
 		 224 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  36.79 
 
 		 224 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  36.79 
 
 		 224 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  36.79 
 
 		 224 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  36.79 
 
 		 224 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1694  peptide ABC transporter ATPase  35.91 
 
 		 248 aa  119  4.9999999999999996e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000011753  unclonable  4.03836e-28 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  33.65 
 
 		 226 aa  118  6e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0321  ABC transporter related  42.46 
 
 		 271 aa  119  6e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0586621 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0573  ABC transporter, ATP-binding protein  35.44 
 
 		 253 aa  119  6e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3868  ABC transporter related  38.31 
 
 		 239 aa  118  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0461389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0264  ATPase  37.5 
 
 		 246 aa  118  6e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  37.84 
 
 		 231 aa  118  6e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3469  ABC transporter related  41.21 
 
 		 216 aa  118  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.297333  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3710  ABC transporter related  37.91 
 
 		 255 aa  118  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  36.32 
 
 		 224 aa  118  7e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>