More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2330 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
394 aa  789  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2519  oxidoreductase, FAD-binding protein  89.59 
 
 
394 aa  649  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105812  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  76.29 
 
 
378 aa  561  1e-159  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  62.16 
 
 
385 aa  463  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  63.74 
 
 
377 aa  452  1e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0303  FAD dependent oxidoreductase  63.29 
 
 
376 aa  435  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0753  FAD dependent oxidoreductase  62.4 
 
 
384 aa  413  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6497  oxidoreductase  57.18 
 
 
380 aa  375  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  54.89 
 
 
383 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  54.89 
 
 
383 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4426  FAD dependent oxidoreductase  55.17 
 
 
375 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.767277 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  51.32 
 
 
383 aa  358  1e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0746  putative oxidoreductase  54.91 
 
 
375 aa  353  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3536  FAD dependent oxidoreductase  57.34 
 
 
382 aa  350  4e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13999  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4434  FAD dependent oxidoreductase  52.56 
 
 
378 aa  349  6e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862237  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5371  FAD dependent oxidoreductase  56.79 
 
 
382 aa  344  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5063  FAD dependent oxidoreductase  56.18 
 
 
383 aa  303  3e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.200843 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0048  FAD dependent oxidoreductase  44.71 
 
 
376 aa  298  1e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  44.38 
 
 
394 aa  298  1e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  45.97 
 
 
389 aa  292  7e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6585  FAD dependent oxidoreductase  45.6 
 
 
389 aa  285  1e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  43.98 
 
 
389 aa  280  4e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  44.89 
 
 
378 aa  279  8e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  43.34 
 
 
391 aa  266  5e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.740851 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  43.95 
 
 
394 aa  263  4e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  43.47 
 
 
384 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  43.4 
 
 
389 aa  252  8e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  37.03 
 
 
385 aa  232  9e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1830  SoxB protein  35.03 
 
 
377 aa  217  3e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.01775  normal  0.260331 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  36.61 
 
 
388 aa  217  3e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  36.19 
 
 
393 aa  216  6e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  36.14 
 
 
390 aa  212  7e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  34.6 
 
 
390 aa  209  8e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  35.19 
 
 
386 aa  206  4e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  31.71 
 
 
374 aa  184  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  28.72 
 
 
390 aa  174  2e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  30.87 
 
 
376 aa  167  3e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  27.46 
 
 
373 aa  159  8e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  31.61 
 
 
387 aa  149  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  31.03 
 
 
960 aa  146  7e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4894  FAD dependent oxidoreductase  33.51 
 
 
397 aa  144  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  27.58 
 
 
396 aa  143  5e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  27.51 
 
 
382 aa  142  1e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  25.4 
 
 
382 aa  138  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  28.07 
 
 
383 aa  132  1e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2371  FAD dependent oxidoreductase  32.89 
 
 
377 aa  131  2e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0928  FAD dependent oxidoreductase  30.79 
 
 
383 aa  130  5e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.559929 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2072  FAD dependent oxidoreductase  30.89 
 
 
392 aa  129  9e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  27.64 
 
 
381 aa  129  1e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0543  hypothetical protein  28.67 
 
 
442 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1294  hypothetical protein  28.67 
 
 
442 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1023  FAD-dependent oxidoreductase  28.67 
 
 
442 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1362  FAD-dependent oxidoreductase  28.67 
 
 
442 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0272  hypothetical protein  28.67 
 
 
442 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0655938  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1284  FAD-dependent oxidoreductase  28.03 
 
 
442 aa  127  4e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2539  agaE protein  28.67 
 
 
442 aa  127  4e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3709  FAD dependent oxidoreductase  29.09 
 
 
444 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.611519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4659  FAD dependent oxidoreductase  29.09 
 
 
444 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  26.87 
 
 
984 aa  126  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5640  FAD dependent oxidoreductase  29.09 
 
 
444 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738738  normal  0.548415 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  26.17 
 
 
983 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  30.89 
 
 
496 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 
492 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  30.62 
 
 
500 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  29.84 
 
 
392 aa  124  4e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  28.54 
 
 
428 aa  123  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  30.62 
 
 
500 aa  123  7e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  28.88 
 
 
385 aa  121  2e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6383  FAD dependent oxidoreductase  29.23 
 
 
389 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  27.44 
 
 
395 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  29.74 
 
 
816 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6616  FAD dependent oxidoreductase  29.23 
 
 
389 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.144379 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  27.92 
 
 
439 aa  120  5e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  30.91 
 
 
823 aa  119  8e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4833  FAD dependent oxidoreductase  27.53 
 
 
385 aa  119  8e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.866256 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4505  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 
444 aa  119  8e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6214  FAD dependent oxidoreductase  29.14 
 
 
389 aa  119  8e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0688  FAD dependent oxidoreductase  29.75 
 
 
382 aa  119  9e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.148887  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  29.18 
 
 
816 aa  118  2e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  28.42 
 
 
394 aa  118  2e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  27.91 
 
 
385 aa  117  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1161  FAD dependent oxidoreductase  27.95 
 
 
444 aa  115  9e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.309102 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1548  FAD dependent oxidoreductase  27.34 
 
 
441 aa  115  9e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.746039 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4047  FAD dependent oxidoreductase  28.37 
 
 
455 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.812767 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3866  FAD dependent oxidoreductase  30.79 
 
 
843 aa  112  8e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  28.42 
 
 
385 aa  112  9e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1461  putative lipoprotein  27.19 
 
 
436 aa  112  1e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  25.34 
 
 
385 aa  111  2e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  27.89 
 
 
385 aa  111  2e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  25.94 
 
 
395 aa  111  2e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  27.44 
 
 
394 aa  111  2e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31600  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  30.26 
 
 
389 aa  110  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3761  FAD dependent oxidoreductase  29.34 
 
 
431 aa  110  4e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  29.11 
 
 
385 aa  110  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5888  oxidoreductase  27.76 
 
 
445 aa  110  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4107  FAD dependent oxidoreductase  28.75 
 
 
393 aa  109  7e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0968917  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  26.51 
 
 
394 aa  109  7e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0935  FAD dependent oxidoreductase  28.88 
 
 
376 aa  109  8e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.311284  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2740  FAD dependent oxidoreductase  28.39 
 
 
401 aa  109  8e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0112073  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6548  FAD dependent oxidoreductase  27.89 
 
 
374 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490591  normal  0.300453 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>