65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1369 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1369  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 416 aa  831    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.52788  normal  0.0165485 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1104  polysaccharide biosynthesis protein  39.65 
 
 		 429 aa  289  6e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1405  polysaccharide biosynthesis protein  29.66 
 
 		 418 aa  125  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000283826  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2253  lipopolysaccharide (O-antigen)exporter  27.44 
 
 		 444 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1081  polysaccharide biosynthesis protein  25.08 
 
 		 421 aa  103  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02920  O-antigen transporter  27.93 
 
 		 416 aa  103  8e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00862586  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0849  polysaccharide biosynthesis protein  28.04 
 
 		 419 aa  102  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4360  polysaccharide biosynthesis protein  25.33 
 
 		 429 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.86188 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6018  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 433 aa  102  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.203106 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0699  hypothetical protein  25.96 
 
 		 422 aa  102  2e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.786722 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1620  polysaccharide biosynthesis protein  26.27 
 
 		 415 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0681626  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2041  polysaccharide biosynthesis protein  24.51 
 
 		 415 aa  90.1  6e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0334353  normal  0.0804458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6400  polysaccharide biosynthesis protein  25.45 
 
 		 431 aa  84  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.247838 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1929  polysaccharide biosynthesis protein  26.55 
 
 		 424 aa  84  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.109004  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1606  polysaccharide biosynthesis protein  25.91 
 
 		 412 aa  84.3  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0714758  normal  0.23948 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4093  polysaccharide biosynthesis protein  24.05 
 
 		 419 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3618  polysaccharide biosynthesis protein  23.71 
 
 		 419 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.180964  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0582  polysaccharide biosynthesis protein  24.48 
 
 		 406 aa  80.9  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3697  polysaccharide biosynthesis protein  22.73 
 
 		 443 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2419  polysaccharide biosynthesis protein  25.47 
 
 		 431 aa  73.9  0.000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0814087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6729  polysaccharide biosynthesis protein  23 
 
 		 415 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2910  polysaccharide biosynthesis protein  26.1 
 
 		 485 aa  69.7  0.00000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1820  polysaccharide biosynthesis protein  24.07 
 
 		 418 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  20.83 
 
 		 471 aa  69.3  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2025  polysaccharide biosynthesis protein  25.6 
 
 		 424 aa  68.9  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.997214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1496  PST family polysaccharide transporter  20.88 
 
 		 484 aa  68.2  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.104259  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0027  polysaccharide biosynthesis family protein  24.85 
 
 		 422 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342295  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2497  polysaccharide transporter  24.85 
 
 		 422 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.547808  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0627  polysaccharide biosynthesis family protein  24.85 
 
 		 422 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0806  polysaccharide biosynthesis family protein  24.85 
 
 		 422 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2209  polysaccharide transporter  24.85 
 
 		 422 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0642  polysaccharide transporter  24.85 
 
 		 422 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.21935  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2875  polysaccharide transporter  24.85 
 
 		 422 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0520  polysaccharide biosynthesis family protein  24.7 
 
 		 422 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.203953  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1057  PST family polysaccharide transporter  20.94 
 
 		 471 aa  65.1  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140128  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2854  polysaccharide biosynthesis protein  25.2 
 
 		 423 aa  63.9  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.444695  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1197  Wzx  23.38 
 
 		 405 aa  63.9  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3458  polysaccharide biosynthesis protein  22.01 
 
 		 427 aa  63.2  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4200  polysaccharide biosynthesis protein  24.37 
 
 		 417 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.404926 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3316  polysaccharide biosynthesis protein  24.37 
 
 		 417 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0788043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4166  polysaccharide biosynthesis protein  24.37 
 
 		 417 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507145  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4403  polysaccharide biosynthesis protein  24.24 
 
 		 417 aa  62  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1353  polysaccharide biosynthesis protein  19.25 
 
 		 486 aa  61.6  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1142  PST family polysaccharide transporter  25.86 
 
 		 475 aa  57  0.0000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000134656  hitchhiker  0.0000175319 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1371  polysaccharide biosynthesis protein  22.35 
 
 		 472 aa  56.6  0.0000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1407  PST family polysaccharide transporter  20.25 
 
 		 481 aa  56.6  0.0000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1412  polysaccharide biosynthesis protein  20.19 
 
 		 474 aa  55.5  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0573  polysaccharide biosynthesis protein  20.39 
 
 		 477 aa  54.7  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000747167  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5060  polysaccharide biosynthesis protein  21.9 
 
 		 478 aa  53.5  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2745  polysaccharide biosynthesis protein  25.42 
 
 		 412 aa  52.8  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0118  polysaccharide biosynthesis protein  19.93 
 
 		 476 aa  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0224366  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0123  polysaccharide biosynthesis protein  19.93 
 
 		 476 aa  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.281108  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2652  polysaccharide biosynthesis protein  22.97 
 
 		 426 aa  50.8  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0561066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5222  polysaccharide biosynthesis protein  20 
 
 		 484 aa  50.1  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0590  polysaccharide biosynthesis protein, putative  22.56 
 
 		 483 aa  50.1  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000415804  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5560  polysaccharide biosynthesis protein, putative  19.63 
 
 		 484 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2535  polysaccharide biosynthesis protein  21.45 
 
 		 409 aa  47.4  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0604  polysaccharide biosynthesis protein  20.61 
 
 		 483 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000572815  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5522  polysaccharide synthase family protein  21.56 
 
 		 484 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0464  polysaccharide transporter protein, putative  20.61 
 
 		 486 aa  45.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000125112  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5676  polysaccharide biosynthesis protein  21.56 
 
 		 484 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5123  spore cortex biosynthesis protein  21.56 
 
 		 484 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151446  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5279  polysaccharide biosynthesis protein  21.56 
 
 		 484 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0394078  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5012  putative polysaccharide biosynthesis protein  23.36 
 
 		 499 aa  45.1  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5305  polysaccharide biosynthesis protein  28.17 
 
 		 502 aa  43.5  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>