More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1502 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1502  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
390 aa  805    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  71.91 
 
 
388 aa  580  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  70.77 
 
 
391 aa  579  1e-164  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3805  acetyl-CoA acetyltransferase  69.33 
 
 
388 aa  567  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  70 
 
 
389 aa  566  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4152  acetyl-CoA acetyltransferase  69.23 
 
 
389 aa  560  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500938  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1757  acetyl-CoA acetyltransferase  67.27 
 
 
391 aa  554  1e-157  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439431  normal  0.143058 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4565  acetyl-CoA acetyltransferase  70.1 
 
 
388 aa  552  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153409  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  67.35 
 
 
382 aa  523  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3115  acetyl-CoA acetyltransferase  66.41 
 
 
382 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119662  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  65.9 
 
 
382 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2663  acetyl-CoA acetyltransferase  67.1 
 
 
385 aa  508  1e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4787  acetyl-CoA acetyltransferase  67.53 
 
 
387 aa  507  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0607631  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2350  acetyl-CoA acetyltransferase  66.15 
 
 
382 aa  502  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.731467  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5095  acetyl-CoA acetyltransferase  61.93 
 
 
395 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.926475 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7411  acetyl-CoA acetyltransferase  55.08 
 
 
383 aa  381  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  45.03 
 
 
385 aa  265  7e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  42.15 
 
 
390 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  42.89 
 
 
389 aa  258  9e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  44.7 
 
 
383 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  42.57 
 
 
381 aa  249  5e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  43.11 
 
 
390 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  40.26 
 
 
383 aa  242  7e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  41.94 
 
 
382 aa  242  7.999999999999999e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  40.11 
 
 
383 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1074  thiolase  43.5 
 
 
384 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  43.27 
 
 
402 aa  239  5e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  43.27 
 
 
402 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  40.59 
 
 
383 aa  239  9e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  41.6 
 
 
393 aa  237  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  42.94 
 
 
403 aa  236  4e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  39.14 
 
 
383 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  42.26 
 
 
381 aa  226  7e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  41.27 
 
 
383 aa  225  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  40.28 
 
 
379 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  40.61 
 
 
379 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  39.11 
 
 
380 aa  219  6e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  40.99 
 
 
390 aa  218  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  38.38 
 
 
385 aa  217  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  36.86 
 
 
388 aa  214  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0844  thiolase  42.12 
 
 
384 aa  212  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  39.78 
 
 
379 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  37.87 
 
 
384 aa  207  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  40.92 
 
 
382 aa  205  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  38.95 
 
 
379 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1686  Acetyl-CoA acetyltransferase-like  38.95 
 
 
379 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0569144  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  36.65 
 
 
388 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3401  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  37.53 
 
 
380 aa  177  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0771846 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2151  nonspecific lipid-transfer protein  32.92 
 
 
403 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  34.97 
 
 
388 aa  169  1e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4311  hypothetical protein  34.59 
 
 
389 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  34.99 
 
 
387 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2141  lipid-transfer protein  34.99 
 
 
392 aa  163  6e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4180  putative acetyl-CoA C-acetyltransferase  33.95 
 
 
394 aa  162  7e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785914  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2361  lipid-transfer protein  34.55 
 
 
394 aa  162  9e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0031  hypothetical protein  34.77 
 
 
402 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.761011  normal  0.262129 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0050  hypothetical protein  34.77 
 
 
402 aa  159  9e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0851197  normal  0.0510911 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0041  hypothetical protein  34.77 
 
 
402 aa  159  9e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  38.1 
 
 
389 aa  159  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.12 
 
 
389 aa  158  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.13 
 
 
385 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  33.33 
 
 
390 aa  157  3e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  34.31 
 
 
387 aa  157  3e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  35.42 
 
 
390 aa  156  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  33.96 
 
 
390 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0581  hypothetical protein  31.34 
 
 
395 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0835832  normal  0.505436 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1513  lipid-transfer protein  34.92 
 
 
385 aa  155  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.29 
 
 
388 aa  153  5e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  32.38 
 
 
394 aa  152  8.999999999999999e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6832  DitF protein  35.33 
 
 
396 aa  152  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3310  hypothetical protein  31.87 
 
 
393 aa  151  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4269  hypothetical protein  35.03 
 
 
402 aa  150  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.340919  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  33.06 
 
 
381 aa  149  9e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5057  lipid-transfer protein  34.39 
 
 
385 aa  149  9e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5253  lipid-transfer protein  34.39 
 
 
385 aa  149  9e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.509405 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3479  lipid-transfer protein  34.3 
 
 
391 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2103  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  31.69 
 
 
384 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655505  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0887  lipid-transfer protein  34.31 
 
 
390 aa  149  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5851  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.29 
 
 
388 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0314395  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5454  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.29 
 
 
388 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.839799  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8761  lipid-transfer protein  35.17 
 
 
385 aa  147  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4716  DitF protein  32.64 
 
 
453 aa  147  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3226  hypothetical protein  33.88 
 
 
388 aa  146  5e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3277  hypothetical protein  33.88 
 
 
388 aa  146  5e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3215  hypothetical protein  33.88 
 
 
388 aa  146  5e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4758  lipid-transfer protein  33.86 
 
 
385 aa  146  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5694  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4672  lipid-transfer protein  33.86 
 
 
385 aa  146  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.495157  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0859  thiolase  31.58 
 
 
389 aa  146  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.823302  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0636  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.29 
 
 
388 aa  145  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0554  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.29 
 
 
388 aa  145  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5643  putative nonspecific lipid-transfer protein  34.03 
 
 
388 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0511  lipid-transfer protein  33.72 
 
 
389 aa  144  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4055  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.78 
 
 
397 aa  143  5e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0205444  normal  0.64672 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0316  acetyl-CoA C-acetyltransferase (acetoacetyl-CoA thiolase) (AcaB-6)  31.02 
 
 
380 aa  142  7e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  31.13 
 
 
387 aa  142  7e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  31.97 
 
 
386 aa  142  8e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1902  hypothetical protein  31.32 
 
 
396 aa  142  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986081  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4021  putative nonspecific lipid-transfer protein  31.32 
 
 
378 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0899  lipid-transfer protein  34.82 
 
 
389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1643  putative nonspecific lipid-transfer protein  33.77 
 
 
388 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>