77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4301 on replicon NC_008757
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009670  Oant_4742  N-6 DNA methylase  32.91 
 
 		 1702 aa  749    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2730  helicase domain protein  33.77 
 
 		 1722 aa  642    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1824  helicase domain protein  34.63 
 
 		 2098 aa  818    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a002  DNA methylase/helicase  29.52 
 
 		 1934 aa  655    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0978124  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9541  helicase SNF2 family  34.27 
 
 		 1701 aa  721    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.398827  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9162  helicase SNF2 family  33.88 
 
 		 1697 aa  752    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3177  helicase domain protein  34.35 
 
 		 2077 aa  925    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4540  helicase domain protein  33.26 
 
 		 1606 aa  687    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3732  helicase domain-containing protein  32.65 
 
 		 1693 aa  735    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253895  normal  0.261793 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4973  helicase domain-containing protein  32.07 
 
 		 1697 aa  730    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.664795 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0264  hypothetical protein  32.44 
 
 		 1748 aa  755    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0010  cpp14  30.43 
 
 		 1932 aa  656    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0437256  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1578  helicase domain-containing protein  39.85 
 
 		 1642 aa  1030    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149983 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4301  helicase, C-terminal  100 
 
 		 1649 aa  3409    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.182147 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4173  helicase domain-containing protein  33.33 
 
 		 1575 aa  675    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4476  helicase-like  32.74 
 
 		 1703 aa  740    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2546  helicase, C-terminal  39.95 
 
 		 1669 aa  1033    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.26749 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2221  helicase, C-terminal  39.77 
 
 		 1669 aa  1019    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4295  helicase-like  36.9 
 
 		 1726 aa  871    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4316  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 1516 aa  721    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4914  helicase  36.87 
 
 		 1706 aa  961    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4656  N-6 DNA methylase  32.44 
 
 		 1700 aa  744    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4259  helicase domain-containing protein  30.9 
 
 		 2570 aa  636  1e-180  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4893  DEAD-like helicase  32.96 
 
 		 1417 aa  629  1e-178  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4747  helicase domain-containing protein  35.91 
 
 		 1925 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.099466  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1280  SNF2 family protein  33.27 
 
 		 2274 aa  555  1e-156  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.459246  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6722  Methyltransferase type 11  30.63 
 
 		 1674 aa  541  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0160  Cpp14  26.44 
 
 		 2117 aa  510  1e-143  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.296407  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8083  helicase  32.33 
 
 		 1211 aa  496  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0239915  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5280  methyltransferase type 11  34.05 
 
 		 1594 aa  449  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00107926  unclonable  0.0024977 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5796  helicase domain-containing protein  35.06 
 
 		 976 aa  442  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00607211  hitchhiker  2.23463e-19 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0870  SNF2-related protein  34.97 
 
 		 2005 aa  395  1e-108  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4933  helicase domain protein  30.83 
 
 		 1956 aa  389  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4475  helicase domain-containing protein  31.83 
 
 		 761 aa  285  4.0000000000000003e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1500  hypothetical protein  34.25 
 
 		 763 aa  273  2e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00538454 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0387  putative DNA methylase  31.21 
 
 		 766 aa  233  3e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8079  helicase SNF2 family  30.46 
 
 		 470 aa  163  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48311  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0847  hypothetical protein  29.09 
 
 		 526 aa  156  2.9999999999999998e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000203105 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5797  methyltransferase type 11  34.51 
 
 		 577 aa  122  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.295406  hitchhiker  4.23938e-17 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3075  DEAD-like helicase  28.46 
 
 		 1328 aa  93.2  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3018  helicase domain-containing protein  24.73 
 
 		 678 aa  85.5  0.000000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6184  helicase domain protein  29.1 
 
 		 284 aa  75.5  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0111751 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1466  SNF2 family helicase  24.88 
 
 		 1379 aa  68.9  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.942792  normal  0.0166873 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1468  adenine-specific DNA methylase  28.03 
 
 		 254 aa  67.4  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00771536 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0796  hypothetical protein  25.75 
 
 		 339 aa  67  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1826  hypothetical protein  25.5 
 
 		 442 aa  66.2  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3677  helicase, C-terminal:dead/deah box helicase, n-terminal  30.83 
 
 		 1043 aa  52.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2349  hypothetical protein  22.67 
 
 		 341 aa  52  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0743518  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1835  hypothetical protein  25 
 
 		 318 aa  51.6  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000176209  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1259  N-6 DNA methylase  24.32 
 
 		 490 aa  51.2  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.624489  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0329  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  28.43 
 
 		 557 aa  50.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1570  hypothetical protein  21.78 
 
 		 341 aa  51.2  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.447914  n/a   
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0072  RecQ helicase, putative  31.25 
 
 		 468 aa  51.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0610  restriction modification system DNA specificity subunit  26.61 
 
 		 730 aa  50.4  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  29.6 
 
 		 1065 aa  49.7  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2648  helicase domain protein  28.64 
 
 		 950 aa  50.1  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  29.6 
 
 		 1065 aa  49.7  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0730  N-6 DNA methylase  24.58 
 
 		 329 aa  48.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  31.3 
 
 		 894 aa  47.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3662  hypothetical protein  30.95 
 
 		 569 aa  47.8  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1133  N-6 DNA methylase  23.83 
 
 		 490 aa  47.8  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.813419  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  37.66 
 
 		 1116 aa  47.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2617  N-6 DNA methylase  26.79 
 
 		 673 aa  47  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  34.07 
 
 		 900 aa  46.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4881  type I restriction-modification system M subunit  25.35 
 
 		 489 aa  46.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.900731 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1303  helicase domain-containing protein  30.18 
 
 		 669 aa  46.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4612  N-6 DNA methylase  23.79 
 
 		 489 aa  46.2  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000590691 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3534  EcoEI R domain-containing protein  21.56 
 
 		 481 aa  46.2  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0122101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3226  N-6 DNA methylase  23.11 
 
 		 481 aa  46.2  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0106  helicase domain-containing protein  36.71 
 
 		 443 aa  45.8  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  28.38 
 
 		 962 aa  45.8  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02073  type I restriction enzyme EcoEI M protein  23.79 
 
 		 489 aa  45.4  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1282  N-6 DNA methylase  22.04 
 
 		 481 aa  45.4  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1345  helicase domain protein  35.21 
 
 		 953 aa  45.4  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5860  type I restriction-modification system, M subunit  22.51 
 
 		 493 aa  45.4  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.822857 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3271  putative RNA methylase  23.74 
 
 		 479 aa  45.4  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11081  normal  0.0311183 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2591  helicase domain protein  30.93 
 
 		 957 aa  45.4  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000604323 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>