More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1539 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  100 
 
 
639 aa  1298    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  43.99 
 
 
634 aa  521  1e-146  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  35.45 
 
 
633 aa  341  2e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  29.78 
 
 
613 aa  220  5e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  27.86 
 
 
635 aa  209  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  28.06 
 
 
653 aa  206  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1559  TonB-dependent receptor plug  27.23 
 
 
706 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000264695  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2030  TonB-dependent receptor, plug  28.22 
 
 
668 aa  187  5e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  27.67 
 
 
634 aa  183  7e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 
653 aa  183  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0668  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 
757 aa  182  2e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217902 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  28.9 
 
 
653 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  28.42 
 
 
656 aa  181  4e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 
648 aa  181  4.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  28.22 
 
 
659 aa  180  7e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  27.51 
 
 
650 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 
649 aa  179  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  28.03 
 
 
663 aa  179  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  27.51 
 
 
650 aa  179  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  28.03 
 
 
663 aa  178  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  28.03 
 
 
663 aa  179  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  28.03 
 
 
663 aa  179  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2686  TonB-dependent receptor plug  28.96 
 
 
650 aa  178  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.262602  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  28.01 
 
 
641 aa  178  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  27.34 
 
 
650 aa  178  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  27.34 
 
 
650 aa  178  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  27.34 
 
 
650 aa  177  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  27.85 
 
 
663 aa  177  5e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  27.85 
 
 
663 aa  177  5e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  26.13 
 
 
661 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0449  hypothetical protein  54.36 
 
 
234 aa  174  5.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  27.78 
 
 
646 aa  173  7.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  29.25 
 
 
628 aa  173  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4773  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 
624 aa  168  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.386912  normal  0.53176 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  28.57 
 
 
695 aa  168  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 
649 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  28.11 
 
 
663 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  29.78 
 
 
666 aa  167  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  30.06 
 
 
666 aa  167  6.9999999999999995e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  29.78 
 
 
666 aa  166  8e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  29.78 
 
 
666 aa  166  9e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  30 
 
 
666 aa  166  9e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 
702 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  26.78 
 
 
652 aa  165  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  28.87 
 
 
726 aa  166  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1262  TonB-dependent receptor  28.9 
 
 
651 aa  164  3e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.612585  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  26.64 
 
 
640 aa  165  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 
681 aa  164  4.0000000000000004e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 
652 aa  164  4.0000000000000004e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  28.64 
 
 
663 aa  160  5e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  26.89 
 
 
656 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1506  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 
707 aa  157  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1928  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 
676 aa  157  8e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00435524  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1004  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 
618 aa  156  9e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0684927  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  28.62 
 
 
696 aa  156  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  28.62 
 
 
696 aa  156  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 
698 aa  156  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0249  TonB-dependent receptor  23.72 
 
 
688 aa  155  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 
698 aa  154  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 
698 aa  154  2.9999999999999998e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1115  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 
649 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.95294  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 
698 aa  154  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1142  TonB-dependent receptor-related protein  27.22 
 
 
650 aa  154  4e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.22175  normal  0.0805488 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  26.48 
 
 
616 aa  154  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.22 
 
 
623 aa  154  5.9999999999999996e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 
626 aa  154  5.9999999999999996e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1014  TonB-dependent receptor-related protein  28.03 
 
 
647 aa  153  8e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 
626 aa  152  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  24.55 
 
 
653 aa  151  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  25.38 
 
 
638 aa  151  4e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0123  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.2 
 
 
631 aa  148  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105264  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1826  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 
621 aa  148  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568285  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  26.6 
 
 
665 aa  146  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6535  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 
694 aa  146  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.822423  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  26.6 
 
 
665 aa  146  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  26.44 
 
 
665 aa  145  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1537  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 
593 aa  145  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00891985  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  27.9 
 
 
618 aa  145  3e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1648  ferric receptor CfrA  26.82 
 
 
696 aa  145  3e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1522  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1803  ribosome-binding factor A  26.7 
 
 
656 aa  144  6e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002156  outer membrane vitamin B12 receptor BtuB  27.72 
 
 
611 aa  144  6e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122091  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4119  TonB-dependent vitamin B12 receptor  26.41 
 
 
616 aa  144  7e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0969  outer membrane receptor for transport of vitamin B  25.79 
 
 
645 aa  143  8e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.01117 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2815  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 
619 aa  142  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.186668  normal  0.478128 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4073  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.42 
 
 
630 aa  142  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000943492  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  27.05 
 
 
623 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0142  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.42 
 
 
630 aa  142  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000593825  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3294  TonB-dependent receptor, plug  27.46 
 
 
676 aa  142  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  25.6 
 
 
655 aa  141  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0469  iron-regulated outer membrane virulence protein, TonB receptor CfrA  25.08 
 
 
698 aa  141  3e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.442515  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2342  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 
611 aa  141  3.9999999999999997e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.499314  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1186  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 
634 aa  140  6e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.874956  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0790  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 
614 aa  140  7e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.270148  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 
709 aa  140  7.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0847  ferric receptor CfrA  24.53 
 
 
696 aa  139  1e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1347  iron compound TonB-dependent receptor, putative  26.68 
 
 
620 aa  139  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0122  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 
624 aa  140  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5290  TonB-dependent receptor plug  25.77 
 
 
673 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4029  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 
719 aa  138  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1445  TonB-dependent receptor, putative  27.39 
 
 
593 aa  137  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>