169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0910 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0910  beta-Ig-H3/fasciclin  100 
 
 
208 aa  406  1.0000000000000001e-112  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.884853  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06660  hypothetical protein  71.43 
 
 
187 aa  179  2.9999999999999997e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3576  beta-Ig-H3/fasciclin  70 
 
 
161 aa  178  4e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001125  fasciclin domain-containing protein  70.15 
 
 
166 aa  173  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0298812  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1108  beta-Ig-H3/fasciclin  67.81 
 
 
166 aa  171  7.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1043  beta-Ig-H3/fasciclin  64.08 
 
 
187 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.363938  hitchhiker  0.000000478309 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1014  beta-Ig-H3/fasciclin  63.38 
 
 
187 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2167  Beta-Ig-H3/fasciclin  69.7 
 
 
141 aa  168  5e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.277927 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0622  fasciclin domain protein  65.91 
 
 
163 aa  168  5e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.951207  normal  0.83741 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2325  beta-Ig-H3/fasciclin  60.69 
 
 
165 aa  164  6.9999999999999995e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1409  beta-Ig-H3/fasciclin  60.29 
 
 
156 aa  161  7e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5571  beta-Ig-H3/fasciclin  66.17 
 
 
134 aa  160  9e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0076  beta-Ig-H3/fasciclin  60.29 
 
 
156 aa  159  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.268608  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0621  fasciclin domain protein  58.99 
 
 
162 aa  155  4e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2326  beta-Ig-H3/fasciclin  59.09 
 
 
160 aa  154  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2816  beta-Ig-H3/fasciclin  61.65 
 
 
157 aa  150  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.651066  normal  0.235425 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  46.74 
 
 
279 aa  149  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4447  beta-Ig-H3/fasciclin  62.41 
 
 
160 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0569511  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1335  beta-Ig-H3/fasciclin  58.78 
 
 
133 aa  145  3e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.286381  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2980  Beta-Ig-H3/fasciclin  58.78 
 
 
133 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.231392  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2096  beta-Ig-H3/fasciclin  53.38 
 
 
178 aa  140  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.243521  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1101  beta-Ig-H3/fasciclin  55.3 
 
 
133 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4858  beta-Ig-H3/fasciclin  54.2 
 
 
151 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2172  beta-Ig-H3/fasciclin  55.24 
 
 
164 aa  136  3.0000000000000003e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.711656  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1606  Beta-Ig-H3/fasciclin  53.03 
 
 
186 aa  135  4e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.922484 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0704  hypothetical protein  60.56 
 
 
157 aa  135  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.563111  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1387  beta-Ig-H3/fasciclin  62.1 
 
 
167 aa  132  5e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0247716 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3373  beta-Ig-H3/fasciclin  51.52 
 
 
194 aa  132  5e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0555818  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0331  beta-Ig-H3/fasciclin  53.1 
 
 
193 aa  131  9e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03050  beta-Ig-H3/fasciclin repeat containing protein  52.17 
 
 
202 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1035  beta-Ig-H3/fasciclin  51.91 
 
 
133 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.882693  hitchhiker  0.000102964 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1006  beta-Ig-H3/fasciclin  51.91 
 
 
133 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1908  Beta-Ig-H3/fasciclin  54.4 
 
 
261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0298726 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3256  beta-Ig-H3/fasciclin  48.11 
 
 
186 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0221  beta-Ig-H3/fasciclin  53.1 
 
 
191 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.46175  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0244  beta-Ig-H3/fasciclin  52.9 
 
 
195 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.263365  normal  0.0636307 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0485  beta-Ig-H3/fasciclin  52.41 
 
 
194 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3372  beta-Ig-H3/fasciclin  58.65 
 
 
190 aa  127  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851575  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2765  beta-Ig-H3/fasciclin  52.03 
 
 
184 aa  127  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11878  Beta-Ig-H3/Fasciclin domain protein  52.05 
 
 
193 aa  126  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4248  beta-Ig-H3/fasciclin  50.98 
 
 
183 aa  126  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2016  Beta-Ig-H3/fasciclin  52.63 
 
 
139 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000921903  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0336  Fas1 domain-containing protein  50.7 
 
 
184 aa  124  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1696  beta-Ig-H3/fasciclin  44.81 
 
 
185 aa  124  8.000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1409  Beta-Ig-H3/fasciclin  45.93 
 
 
220 aa  124  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.92932  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0374  beta-Ig-H3/fasciclin  53.42 
 
 
183 aa  124  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3921  beta-Ig-H3/fasciclin  48.43 
 
 
184 aa  122  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00329996  normal  0.130645 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3919  beta-Ig-H3/fasciclin  49.37 
 
 
190 aa  122  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.509564  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3627  beta-Ig-H3/fasciclin  49.37 
 
 
190 aa  122  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5784  beta-Ig-H3/fasciclin  51.63 
 
 
187 aa  121  8e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.638561  hitchhiker  0.0026448 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2872  beta-Ig-H3/fasciclin  47.26 
 
 
185 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0637604 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5434  beta-Ig-H3/fasciclin  50.98 
 
 
184 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.14413  normal  0.0716533 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0459  hypothetical protein  47.34 
 
 
185 aa  120  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110203  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2034  beta-Ig-H3/fasciclin  50.69 
 
 
186 aa  119  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0997  beta-Ig-H3/fasciclin  50.34 
 
 
184 aa  118  6e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363015  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3054  secreted surface protein  47.95 
 
 
189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.272116 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6577  beta-Ig-H3/fasciclin repeat-containing protein  46.98 
 
 
184 aa  116  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4362  beta-Ig-H3/fasciclin  48.03 
 
 
194 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4495  beta-Ig-H3/fasciclin  48.03 
 
 
194 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.454582  normal  0.0107081 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2869  beta-Ig-H3/fasciclin  46.97 
 
 
238 aa  115  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1656  beta-Ig-H3/fasciclin  47.47 
 
 
189 aa  114  8.999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.29566  normal  0.495263 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0074  beta-Ig-H3/fasciclin  46.58 
 
 
184 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0260992 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  44.12 
 
 
558 aa  113  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3053  beta-Ig-H3/fasciclin  50.69 
 
 
191 aa  112  5e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.937158  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3984  beta-Ig-H3/fasciclin  53.79 
 
 
168 aa  111  8.000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal  0.572954 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0089  beta-Ig-H3/fasciclin  48.99 
 
 
184 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.759896  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1192  beta-Ig-H3/fasciclin  42.11 
 
 
140 aa  109  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3782  beta-Ig-H3/fasciclin  42.59 
 
 
183 aa  108  6e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.404689  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2243  beta-Ig-H3/fasciclin  45.81 
 
 
187 aa  107  9.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.251437  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14646  predicted protein  44.93 
 
 
142 aa  107  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2251  beta-Ig-H3/fasciclin  48.48 
 
 
160 aa  106  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206889  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2207  beta-Ig-H3/fasciclin  49.24 
 
 
160 aa  105  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1655  beta-Ig-H3/fasciclin  44.22 
 
 
596 aa  103  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0779815 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6236  Beta-Ig-H3/fasciclin  45 
 
 
308 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0669562  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07881  hypothetical protein  42.96 
 
 
210 aa  101  7e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1399  beta-Ig-H3/fasciclin  38.89 
 
 
192 aa  100  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.409432 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  41.94 
 
 
201 aa  99.4  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5225  beta-Ig-H3/fasciclin  40.36 
 
 
194 aa  97.8  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.109231  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1113  beta-Ig-H3/fasciclin  39.85 
 
 
134 aa  95.9  4e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5227  beta-Ig-H3/fasciclin  37.78 
 
 
138 aa  95.1  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.273546  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0973  beta-Ig-H3/fasciclin  39.26 
 
 
202 aa  95.1  6e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.517899  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2094  Beta-Ig-H3/fasciclin  36.92 
 
 
133 aa  94.7  9e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.679914 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1271  hypothetical protein  48.78 
 
 
161 aa  94  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235173  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1174  beta-Ig-H3/fasciclin  40.45 
 
 
184 aa  93.6  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1375  putative adhesion lipoprotein  49.26 
 
 
611 aa  92.8  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3985  twin-arginine translocation pathway signal  43.57 
 
 
169 aa  92.4  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0926621  normal  0.568461 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27077  predicted protein  44.8 
 
 
143 aa  91.3  9e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.259215  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0949  beta-Ig-H3/fasciclin  33.33 
 
 
135 aa  90.1  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3070  beta-Ig-H3/fasciclin  33.76 
 
 
354 aa  89.7  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0201984  normal  0.916822 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1725  beta-Ig-H3/fasciclin  36.03 
 
 
142 aa  89  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3080  beta-Ig-H3/fasciclin  36.36 
 
 
157 aa  88.6  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000418721 
 
 
-
 
NC_002936  DET1303  fasciclin domain-containing protein  36.84 
 
 
134 aa  88.2  9e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196893  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1823  beta-Ig-H3/fasciclin  47.58 
 
 
315 aa  87.8  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0234116  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10261  predicted protein  40.4 
 
 
150 aa  87.8  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00158824  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4241  beta-Ig-H3/fasciclin  31.34 
 
 
139 aa  85.5  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3001  hypothetical protein  38.62 
 
 
215 aa  85.1  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.100606  hitchhiker  0.00156356 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0405  hypothetical protein  38.36 
 
 
200 aa  84.3  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00160979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0737  beta-Ig-H3/fasciclin  44.35 
 
 
212 aa  84.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.437666  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2373  beta-Ig-H3/fasciclin  41.84 
 
 
163 aa  84  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1723  beta-Ig-H3/fasciclin  32.33 
 
 
141 aa  84.3  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>