235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1614 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1614  cation transporter  100 
 
 		 490 aa  969    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000455151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0039  potassium uptake protein TrkH  49.79 
 
 		 480 aa  462  1e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.169188 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3796  TrkH family potassium uptake protein  47.42 
 
 		 484 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000285199 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1826  TrkH family potassium uptake protein  51.29 
 
 		 483 aa  432  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.634597  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2406  Trk system potassium uptake protein  48.64 
 
 		 482 aa  435  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517889  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4507  TrkH family potassium uptake protein  47.21 
 
 		 484 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2477  potassium uptake protein TrkH  47.81 
 
 		 481 aa  429  1e-119  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4013  cation transporter  47.21 
 
 		 484 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.398378  hitchhiker  0.000106015 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0025  TrkH family potassium uptake protein  48.94 
 
 		 480 aa  429  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.053373  hitchhiker  0.00232056 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0028  potassium uptake protein TrkH  48.31 
 
 		 480 aa  427  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1404  TrkH family potassium uptake protein  47.42 
 
 		 484 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0143112  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0020  TrkH family potassium uptake protein  49.15 
 
 		 480 aa  426  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0023  TrkH family potassium uptake protein  48.73 
 
 		 480 aa  428  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0882974 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3433  cation transport protein  50 
 
 		 484 aa  425  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0027  TrkH family potassium uptake protein  48.09 
 
 		 480 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0149541 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1801  potassium uptake protein TrkH  47.21 
 
 		 484 aa  422  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641993  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3593  K+ transporter Trk  47.21 
 
 		 484 aa  422  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0183365  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15550  K+ transporter protein  50.52 
 
 		 483 aa  422  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0027  potassium uptake protein, TrkH family  48.09 
 
 		 480 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000304543 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1479  K+ transporter Trk  46.78 
 
 		 484 aa  424  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0756741  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40470  TrkH family potassium uptake protein  49.79 
 
 		 484 aa  422  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0031  TrkH family potassium uptake protein  48.52 
 
 		 480 aa  425  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000580956  hitchhiker  0.00000165872 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0023  TrkH family potassium uptake protein  48.09 
 
 		 480 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.991161  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0028  TrkH family potassium uptake protein  48.09 
 
 		 480 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172554  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002053  potassium uptake protein TrkH  47.05 
 
 		 481 aa  419  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1567  TrkH family potassium uptake protein  49.37 
 
 		 484 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.120184 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00395  K+ transport system protein  47.39 
 
 		 481 aa  421  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3953  TrkH family potassium uptake protein  49.16 
 
 		 484 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1935  cation transporter  48.12 
 
 		 482 aa  418  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.27929 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3740  TrkH family potassium uptake protein  48.73 
 
 		 480 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227037 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0031  TrkH family potassium uptake protein  47.88 
 
 		 480 aa  412  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal  0.0679192 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0034  TrkH family potassium uptake protein  47.46 
 
 		 480 aa  415  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0561968 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22690  potassium uptake protein TrkH  47.81 
 
 		 484 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0159023 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0020  potassium uptake protein, TrkH family protein  46.56 
 
 		 480 aa  410  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76809  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0037  cation transporter  49.58 
 
 		 481 aa  410  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1869  cation transporter  48.95 
 
 		 484 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.130982 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1916  potassium uptake protein TrkH  47.6 
 
 		 484 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1134  cation transporter  49.02 
 
 		 498 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075109  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1500  cation transport protein  44.21 
 
 		 466 aa  398  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1451  cation transport protein  45.11 
 
 		 466 aa  392  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0027  TrkH family potassium uptake protein  47.67 
 
 		 480 aa  386  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1663  cation transporter  43.84 
 
 		 500 aa  387  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.330745  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1859  cation transporter  45.64 
 
 		 482 aa  382  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00547678 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2171  cation transporter  50.67 
 
 		 493 aa  384  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0082  potassium uptake protein TrkH  44.91 
 
 		 481 aa  384  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1427  cation transporter  46.19 
 
 		 472 aa  382  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0490  cation transporter  44.75 
 
 		 485 aa  371  1e-101  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1567  cation transporter  47.64 
 
 		 510 aa  365  1e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0469  cation transporter  45.74 
 
 		 498 aa  362  7.0000000000000005e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.261483  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5285  cation transporter  41.63 
 
 		 484 aa  362  1e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0982  putative potassium uptake protein  42.27 
 
 		 466 aa  353  4e-96  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.385005  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1374  cation transporter  44.6 
 
 		 484 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0536  cation transporter  40.54 
 
 		 482 aa  335  9e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.306165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1853  potassium uptake transporter, transmembrane component, TrkH  39.67 
 
 		 482 aa  324  2e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385186  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0502  cation transporter  39.67 
 
 		 482 aa  324  2e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  38.27 
 
 		 479 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000731748  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  37.45 
 
 		 481 aa  319  7e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  37.03 
 
 		 466 aa  319  7.999999999999999e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0021  trk system potassium uptake membrane protein TrkH  40.9 
 
 		 488 aa  318  1e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5998  cation transporter  38.75 
 
 		 488 aa  315  9.999999999999999e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443617 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  37.16 
 
 		 482 aa  315  9.999999999999999e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4543  cation transporter  39.17 
 
 		 498 aa  312  9e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3505  cation transporter  39.54 
 
 		 485 aa  310  4e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2041  TrkH family potassium uptake protein  38.2 
 
 		 485 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.505265  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0087  cation transporter  37.27 
 
 		 485 aa  309  5.9999999999999995e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3911  cation transporter  38.25 
 
 		 488 aa  309  5.9999999999999995e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.874012 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3260  cation transporter  38.25 
 
 		 488 aa  308  2.0000000000000002e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208251  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1854  potassium uptake transporter, transmembrane component, TrkH  40.21 
 
 		 484 aa  306  7e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0503  cation transporter  40 
 
 		 484 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0640  cation transporter  40.75 
 
 		 484 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.831916  normal  0.358722 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2029  K+ transporter Trk  38.95 
 
 		 481 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00911384  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  39.83 
 
 		 494 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5095  cation transporter  38.82 
 
 		 491 aa  303  6.000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  38.36 
 
 		 483 aa  303  7.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  38.48 
 
 		 481 aa  301  1e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0018  K+ transporter Trk  39.18 
 
 		 485 aa  294  3e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  36.48 
 
 		 483 aa  293  4e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  38.3 
 
 		 483 aa  293  6e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4081  cation transporter  36.55 
 
 		 491 aa  292  8e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1093  putative potassium uptake protein TrkH  36.23 
 
 		 486 aa  291  1e-77  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0019  TrkH family potassium uptake protein  39.7 
 
 		 485 aa  292  1e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000172617  normal  0.0765099 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0017  potassium uptake protein TrkH  37.32 
 
 		 482 aa  291  2e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000733585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0021  TrkH family potassium uptake protein  39.49 
 
 		 485 aa  291  2e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000191681  hitchhiker  0.00118285 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0027  TrkH family potassium uptake protein  39.49 
 
 		 485 aa  291  2e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0260602  hitchhiker  0.0000000366479 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0016  TrkH family potassium uptake protein  39.07 
 
 		 485 aa  291  2e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.917288  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0019  TrkH family potassium uptake protein  38.98 
 
 		 485 aa  290  4e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.195703  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0186  K+ transporter Trk  37.7 
 
 		 483 aa  290  4e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.568155  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0023  potassium uptake protein, TrkH family  38.98 
 
 		 485 aa  290  4e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000299675 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0023  TrkH family potassium uptake protein  38.98 
 
 		 485 aa  290  4e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.211854  normal  0.0148489 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0035  TrkH family potassium uptake protein  38.64 
 
 		 485 aa  290  4e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161257  normal  0.16596 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0024  TrkH family potassium uptake protein  38.98 
 
 		 485 aa  290  4e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0989593  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3217  TrkH family potassium uptake protein  35.85 
 
 		 482 aa  290  5.0000000000000004e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0022  TrkH family potassium uptake protein  38.68 
 
 		 485 aa  289  9e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00747974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0026  TrkH family potassium uptake protein  38.02 
 
 		 485 aa  288  1e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0293301  normal  0.0416133 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0022  trk system potassium uptake membrane protein  35.56 
 
 		 485 aa  286  4e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.78231  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_002950  PG2219  potassium uptake protein TrkH  36.23 
 
 		 487 aa  286  5e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000665433 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0016  potassium uptake protein, TrkH family protein  38.97 
 
 		 485 aa  286  5e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.339355  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0024  potassium uptake protein TrkH  38.98 
 
 		 486 aa  286  7e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1969  potassium uptake protein, TrkH family  38.96 
 
 		 482 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.938293  normal  0.091936 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1468  cation transporter  38.46 
 
 		 483 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>