More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1370 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



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Replicon accession
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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00536  copper/silver efflux system, membrane component  58.45 
 
 		 1047 aa  1272    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.756563  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3054  heavy metal efflux pump, CzcA family  58.55 
 
 		 1047 aa  1273    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3534  CzcA family heavy metal efflux protein  58.84 
 
 		 1047 aa  1268    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1332  CzcA family heavy metal efflux protein  48.9 
 
 		 1045 aa  1028    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1525  CzcA family heavy metal efflux protein  35.13 
 
 		 1077 aa  637    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0282  CzcA family heavy metal efflux protein  57.36 
 
 		 1049 aa  1254    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4300  CzcA family heavy metal efflux protein  58.41 
 
 		 1048 aa  1261    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5387  CzcA family heavy metal RND efflux protein  60.08 
 
 		 1052 aa  1302    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.134582 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3983  CzcA family heavy metal efflux protein  57.1 
 
 		 1045 aa  1238    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2506  CzcA family heavy metal efflux protein  35.07 
 
 		 1054 aa  637    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213687  normal  0.043274 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1298  CzcA family heavy metal efflux protein  34.63 
 
 		 1033 aa  640    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2264  CzcA family heavy metal efflux protein  54.1 
 
 		 1066 aa  1167    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05405  cation efflux system transmembrane protein  61.04 
 
 		 1047 aa  1325    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1181  heavy metal efflux pump CzcA  35.13 
 
 		 1077 aa  635    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.263304  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0266  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  55.6 
 
 		 1047 aa  1226    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.792977  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2046  CzcA family heavy metal RND efflux protein  59.25 
 
 		 1070 aa  1281    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.594297  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4858  cation efflux system protein CusA  68.42 
 
 		 1052 aa  1444    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2437  CzcA family heavy metal efflux protein  46.38 
 
 		 1091 aa  983    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463281  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4598  CzcA family heavy metal efflux protein  57.49 
 
 		 1045 aa  1235    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0153  CzcA family heavy metal efflux protein  57.14 
 
 		 1045 aa  1228    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0375  cation efflux family protein  35.42 
 
 		 1053 aa  641    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3376  CzcA family heavy metal efflux protein  59.25 
 
 		 1070 aa  1281    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0089  CzcA family heavy metal efflux protein  48.14 
 
 		 1048 aa  1023    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2361  chemiosmotic efflux system B protein A  48.33 
 
 		 1047 aa  1037    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  36.13 
 
 		 1049 aa  670    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1046  HelA protein  36.51 
 
 		 1052 aa  672    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1583  heavy metal efflux pump, CzcA family  33.88 
 
 		 1049 aa  644    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.840242  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1370  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  100 
 
 		 1042 aa  2101    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.775676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1157  CzcA family heavy metal efflux protein  59.19 
 
 		 1038 aa  1297    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1627  putative cation efflux system transmembrane protein  61.51 
 
 		 1063 aa  1348    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.152152 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2265  heavy metal efflux pump CzcA  55.58 
 
 		 1051 aa  1167    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2480  heavy metal efflux pump CzcA  53.82 
 
 		 1044 aa  1139    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.578305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5182  CzcA family heavy metal efflux protein  58.26 
 
 		 1068 aa  1283    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.669903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3783  CzcA family heavy metal efflux protein  57 
 
 		 1045 aa  1244    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0178  putative cation efflux system transmembrane protein  65.22 
 
 		 1056 aa  1417    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0162  CzcA family heavy metal efflux protein  56.69 
 
 		 1049 aa  1241    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0149  CzcA family heavy metal efflux protein  57.17 
 
 		 1049 aa  1251    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1333  heavy metal efflux pump CzcA  60.46 
 
 		 1060 aa  1309    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3856  CzcA family heavy metal efflux protein  57.1 
 
 		 1045 aa  1246    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3131  heavy metal efflux pump CzcA  54.41 
 
 		 1058 aa  1122    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0514  CzcA family heavy metal efflux protein  59.61 
 
 		 1070 aa  1277    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.564268  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  34.82 
 
 		 1077 aa  638    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4513  CzcA family heavy metal efflux protein  61.6 
 
 		 1055 aa  1347    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2246  CzcA family heavy metal efflux protein  46.52 
 
 		 1100 aa  960    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0061  RND family outer membrane copper/silver/drug transport protein  54.13 
 
 		 1069 aa  1151    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1530  heavy metal efflux pump  56.53 
 
 		 1067 aa  1207    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1535  heavy metal efflux pump  46.6 
 
 		 1074 aa  1022    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2396  heavy metal efflux pump CzcA  60.44 
 
 		 1056 aa  1315    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.592906  normal  0.0141595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3621  heavy metal efflux pump CzcA  34.73 
 
 		 1050 aa  639    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.099788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1714  putative inner membrane component for iron transport  53.67 
 
 		 1074 aa  1164    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0452812  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  34.96 
 
 		 1070 aa  644    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1547  heavy metal efflux pump CzcA  48.22 
 
 		 1045 aa  1030    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00394954  normal  0.706432 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0332  CzcA family heavy metal RND efflux protein  59.25 
 
 		 1070 aa  1281    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.744474  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3475  CzcA family heavy metal efflux protein  57.33 
 
 		 1048 aa  1231    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1177  CzcA family heavy metal efflux protein  36.5 
 
 		 1048 aa  639    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1778  heavy metal efflux pump CzcA  59.86 
 
 		 1054 aa  1242    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1856  heavy metal efflux pump CzcA  33.8 
 
 		 1064 aa  637    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1390  CzcA family heavy metal efflux protein  59.52 
 
 		 1039 aa  1298    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.245764  normal  0.515313 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0883  heavy metal efflux pump CzcA  44.54 
 
 		 1015 aa  870    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3650  CzcA family heavy metal efflux protein  48.13 
 
 		 1045 aa  1015    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2238  CzcA family heavy metal RND efflux protein  59.25 
 
 		 1070 aa  1281    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1406  heavy metal efflux pump CzcA  50.67 
 
 		 1059 aa  1081    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1483  CzcA family heavy metal efflux protein  54.5 
 
 		 1043 aa  1169    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3402  CzcA family heavy metal efflux protein  58.94 
 
 		 1068 aa  1279    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  35.53 
 
 		 1077 aa  641    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4104  heavy metal efflux pump CzcA  46.13 
 
 		 1094 aa  968    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1103  heavy metal efflux pump CzcA  53.1 
 
 		 1051 aa  1114    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.953555 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0411  heavy metal efflux pump CzcA  55.38 
 
 		 1043 aa  1170    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1931  Co/Zn/Cd efflux system membrane component  69.27 
 
 		 1039 aa  1477    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2703  CzcA family heavy metal efflux protein  54.98 
 
 		 1059 aa  1169    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.54771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3935  ATP synthase F1, alpha subunit  66.8 
 
 		 1042 aa  1394    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4657  heavy metal efflux pump CzcA  53.54 
 
 		 1052 aa  1132    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.306321 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0011  heavy metal efflux pump CzcA  35.13 
 
 		 1077 aa  635    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649062  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2551  heavy metal efflux pump CzcA  35.27 
 
 		 1040 aa  642    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1440  heavy metal efflux pump CzcA  35.13 
 
 		 1077 aa  637    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3491  heavy metal efflux pump CzcA  61.11 
 
 		 1056 aa  1333    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0262  CzcA family heavy metal efflux protein  58.32 
 
 		 1048 aa  1259    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0401  heavy metal efflux pump CzcA  35.13 
 
 		 1077 aa  635    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3509  heavy metal efflux pump CzcA  56.52 
 
 		 1042 aa  1206    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0136  CzcA family heavy metal efflux protein  70.84 
 
 		 1040 aa  1505    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2741  heavy metal efflux pump CzcA  54.03 
 
 		 1043 aa  1132    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2926  CzcA family heavy metal efflux protein  47.4 
 
 		 1046 aa  982    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.377794  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  34.96 
 
 		 1070 aa  641    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4359  heavy metal efflux pump CzcA  53.6 
 
 		 1060 aa  1124    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4404  heavy metal efflux pump CzcA  54.5 
 
 		 1065 aa  1132    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2212  CzcA family heavy metal efflux protein  59.66 
 
 		 1049 aa  1314    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589008  normal  0.652924 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3385  CzcA family heavy metal efflux protein  52.18 
 
 		 1061 aa  1117    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1854  heavy metal efflux pump CzcA  53.46 
 
 		 1060 aa  1128    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.871861  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3046  CzcA family heavy metal RND efflux protein  59.25 
 
 		 1070 aa  1281    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6136  proton antiporter cation efflux protein SilA  59.67 
 
 		 1056 aa  1317    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0754089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1232  CzcA family heavy metal efflux protein  58.81 
 
 		 1039 aa  1279    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.99301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0319  CzcA family heavy metal RND efflux protein  59.25 
 
 		 1070 aa  1280    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5033  copper and silver tricomponent efflux pump cusA  61.74 
 
 		 1055 aa  1349    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2393  heavy metal efflux pump CzcA  57.17 
 
 		 1044 aa  1228    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.73106  normal  0.0219915 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2441  heavy metal efflux pump CzcA  58.42 
 
 		 1044 aa  1244    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2550  heavy metal efflux pump CzcA  58.71 
 
 		 1047 aa  1284    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.750026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  34.96 
 
 		 1070 aa  641    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008061  Bcen_4765  heavy metal efflux pump CzcA  58.94 
 
 		 1068 aa  1279    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008228  Patl_2392  CzcA family heavy metal efflux protein  67.18 
 
 		 1045 aa  1439    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008242  Meso_4386  CzcA family heavy metal efflux protein  56.15 
 
 		 1058 aa  1162    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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