More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0386 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00789  thiamine transporter membrane protein  65.68 
 
 		 516 aa  683    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0350  thiamine transporter membrane protein  66.6 
 
 		 540 aa  648    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2118  thiamine transporter membrane protein  64.29 
 
 		 530 aa  644    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001685  thiamin ABC transporter transmembrane component  66.27 
 
 		 516 aa  690    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0386  thiamine transporter membrane protein  100 
 
 		 534 aa  1060    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3543  thiamine transporter membrane protein  44.12 
 
 		 535 aa  410  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2944  thiamine transporter membrane protein  44.12 
 
 		 535 aa  409  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.305825 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3415  thiamine transporter membrane protein  44.12 
 
 		 535 aa  409  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0071  thiamine transporter membrane protein  46.18 
 
 		 536 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3590  thiamine transporter membrane protein  46.18 
 
 		 536 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.838581  hitchhiker  0.00000463415 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0069  thiamine transporter membrane protein  46.18 
 
 		 536 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0071  thiamine transporter membrane protein  45.78 
 
 		 536 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.818645  normal  0.387113 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0072  thiamine transporter membrane protein  46.39 
 
 		 536 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0059  thiamine transporter membrane protein  46.18 
 
 		 536 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00069  thiamin ABC transporter membrane protein  45.98 
 
 		 536 aa  404  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3532  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  45.98 
 
 		 536 aa  404  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0113  thiamine transporter membrane protein  44.74 
 
 		 536 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.195449 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0114  thiamine transporter membrane protein  44.74 
 
 		 536 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.576888 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00068  hypothetical protein  45.98 
 
 		 536 aa  404  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0614  thiamine transporter membrane protein  44.55 
 
 		 536 aa  399  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.012901 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0118  thiamine transporter membrane protein  44.55 
 
 		 536 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0333218 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0111  thiamine transporter membrane protein  44.55 
 
 		 536 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0118  thiamine transporter membrane protein  44.55 
 
 		 536 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3620  thiamine transporter membrane protein  44.62 
 
 		 535 aa  394  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.393942  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3809  thiamine transporter membrane protein  44.62 
 
 		 535 aa  394  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0736  thiamine transporter membrane protein  43.05 
 
 		 535 aa  383  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0622  thiamine transporter membrane protein  44.68 
 
 		 536 aa  365  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1012  thiamine transporter membrane protein  39.49 
 
 		 514 aa  343  4e-93  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.775062  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3108  thiamine transporter membrane protein  42.04 
 
 		 531 aa  339  7e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0583  thiamine transporter membrane protein  42.86 
 
 		 537 aa  332  7.000000000000001e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.221441  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1758  thiamine transporter membrane protein  37.58 
 
 		 543 aa  332  1e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.000432752  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3471  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  40.28 
 
 		 509 aa  321  1.9999999999999998e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1141  thiamine transporter membrane protein  38.2 
 
 		 541 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.661169  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4267  thiamine transporter membrane protein  37.77 
 
 		 542 aa  303  5.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3260  thiamine transporter membrane protein  39.25 
 
 		 545 aa  293  8e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2817  thiamine transporter membrane protein  35.73 
 
 		 523 aa  256  7e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.229213  normal  0.678489 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2799  thiamine transporter membrane protein  35.33 
 
 		 504 aa  250  6e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0329  thiamine transporter membrane protein  34.5 
 
 		 521 aa  243  7.999999999999999e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.356206 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1392  thiamine transporter membrane protein  35.09 
 
 		 504 aa  240  4e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1199  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  37.22 
 
 		 555 aa  240  4e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.60189  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0059  thiamine transporter membrane protein  36.28 
 
 		 504 aa  239  9e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3245  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.42 
 
 		 550 aa  103  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0461  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.04 
 
 		 663 aa  100  9e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.745838  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.25 
 
 		 510 aa  100  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.31572  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.37 
 
 		 606 aa  95.1  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.24 
 
 		 515 aa  92  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0434  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.14 
 
 		 544 aa  91.7  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.10733  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.67 
 
 		 540 aa  91.3  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.666018  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.55 
 
 		 565 aa  88.6  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.09 
 
 		 634 aa  86.7  9e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0144  thiamine ABC transporter, permease protein  22.25 
 
 		 560 aa  85.1  0.000000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.997679  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.68 
 
 		 572 aa  82.4  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000013975  decreased coverage  0.00476885 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0007  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.75 
 
 		 512 aa  80.9  0.00000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000649932  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1924  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  30.92 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4879  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.49 
 
 		 677 aa  77.4  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.426175 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.42 
 
 		 532 aa  75.9  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.763133  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04590  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  23.91 
 
 		 551 aa  75.9  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.41 
 
 		 564 aa  74.3  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.957532  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.22 
 
 		 597 aa  74.3  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0257  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit  27.35 
 
 		 269 aa  73.9  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.748764  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.5 
 
 		 565 aa  73.9  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.17 
 
 		 509 aa  73.6  0.000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.553789  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1438  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  20.33 
 
 		 583 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0087  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  30.53 
 
 		 226 aa  72  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.27 
 
 		 585 aa  72  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5009  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.97 
 
 		 574 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1238  iron compound ABC transporter permease  19.54 
 
 		 552 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1214  iron ABC transporter permease  19.54 
 
 		 583 aa  70.5  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1979  NifC-like ABC-type porter  29.3 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5136  ABC transporter, permease protein  23.69 
 
 		 574 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.897571  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1216  iron ABC transporter permease  20.37 
 
 		 583 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1758  NifC-like ABC-type porter  28.95 
 
 		 260 aa  69.7  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0923  NifC-like ABC-type porter  28.95 
 
 		 260 aa  69.7  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1021  NifC-like ABC-type porter  28.95 
 
 		 260 aa  70.1  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.68 
 
 		 533 aa  69.7  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000795875 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1479  putative 2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  20.17 
 
 		 545 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1949  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  28.95 
 
 		 259 aa  68.2  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31200  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  20.38 
 
 		 547 aa  68.2  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.393839  normal  0.564354 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.47 
 
 		 586 aa  67.8  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0327  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  29.57 
 
 		 273 aa  67.8  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0249986  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4969  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  27.42 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2546  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  29.63 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.914305 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2680  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  29.79 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19318  normal  0.445227 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3968  putative iron compound ABC transporter, permease protein  20.37 
 
 		 585 aa  67.4  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1413  putative iron compound ABC transporter, permease protein  19.33 
 
 		 585 aa  67  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2689  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  27.96 
 
 		 269 aa  67  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.106468  normal  0.549789 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0329  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  23.7 
 
 		 574 aa  67  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.90369 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19470  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  23.13 
 
 		 576 aa  67  0.0000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.65 
 
 		 314 aa  66.6  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5189  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  24.12 
 
 		 574 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3493  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  28.09 
 
 		 273 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.40713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3480  Sulfate ABC transporter, permease protein CysW  28.09 
 
 		 273 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3543  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  28.09 
 
 		 273 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5368  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  24.71 
 
 		 574 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.25 
 
 		 569 aa  65.1  0.000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.290045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1376  putative iron compound ABC transporter, permease protein  20.17 
 
 		 585 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0257  NifC-like ABC-type porter  27.98 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.09 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3985  molybdate ABC transporter permease  28.42 
 
 		 338 aa  64.3  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.108268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.08 
 
 		 585 aa  64.3  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.992334  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>