84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1448 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1448  Spore coat U domain protein  100 
 
 
178 aa  352  2e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2817  Spore coat U domain protein  84.27 
 
 
178 aa  292  2e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5299  hypothetical protein  53.95 
 
 
182 aa  167  7e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61520  hypothetical protein  53.95 
 
 
180 aa  165  3e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.201355 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2110  spore coat U domain-containing protein  38.67 
 
 
184 aa  97.8  7e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1665  hypothetical protein  35.71 
 
 
194 aa  97.1  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.528385  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1776  spore coat U domain-containing protein  35.71 
 
 
185 aa  97.1  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0368617  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1800  spore coat U domain-containing protein  40.4 
 
 
167 aa  80.9  1e-14  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.285465 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3335  spore coat U domain-containing protein  37.65 
 
 
167 aa  75.9  3e-13  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.416044  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2360  spore coat U domain protein  37.65 
 
 
167 aa  75.9  3e-13  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.255553  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1960  spore coat U domain-containing protein  37.28 
 
 
167 aa  72.8  3e-12  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.139904 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2112  spore coat U domain-containing protein  33.33 
 
 
179 aa  71.2  7e-12  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_003296  RS03041  signal peptide protein  33.53 
 
 
173 aa  64.7  6e-10  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667718  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1612  spore coat protein U domain-contain protein  35.85 
 
 
174 aa  64.7  7e-10  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1791  hypothetical protein  35.85 
 
 
174 aa  64.7  7e-10  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1634  type I pilus protein  35.85 
 
 
168 aa  64.3  8e-10  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0479  hypothetical protein  35.85 
 
 
168 aa  64.3  8e-10  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1397  hypothetical protein  35.85 
 
 
168 aa  64.3  8e-10  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0679  hypothetical protein  35.85 
 
 
168 aa  64.3  8e-10  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1959  spore coat U domain-containing protein  32.89 
 
 
177 aa  62  4e-09  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.139904 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3336  spore coat U domain-containing protein  30.19 
 
 
177 aa  61.6  6e-09  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4690  spore coat U domain-containing protein  35.03 
 
 
165 aa  60.8  9e-09  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2679  spore coat protein U domain-contain protein  32.91 
 
 
174 aa  60.8  1e-08  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2359  spore coat U domain protein  29.56 
 
 
177 aa  60.5  1e-08  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3671  spore coat U  32.72 
 
 
166 aa  59.3  3e-08  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2461  spore coat U domain-containing protein  34.48 
 
 
182 aa  58.2  7e-08  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1799  spore coat U domain-containing protein  34.36 
 
 
177 aa  57.4  1e-07  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.294452 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2111  spore coat U domain-containing protein  29.87 
 
 
167 aa  56.6  2e-07  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660787 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01135  spore Coat Protein U domain family  39.84 
 
 
344 aa  55.5  5e-07  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0663503  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001215  CsuA  31.43 
 
 
181 aa  53.9  1e-06  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.748118  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4600  spore coat protein U domain-contain protein  31.95 
 
 
190 aa  52.8  2e-06  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01138  protein U  32.92 
 
 
156 aa  53.5  2e-06  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0616572  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1957  spore coat U domain-containing protein  27.38 
 
 
175 aa  52.8  3e-06  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.144375 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3674  type 1 pili protein CsuB, putative  27.32 
 
 
169 aa  52.4  3e-06  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3672  spore coat U  29.63 
 
 
178 aa  52  4e-06  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.961514  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1797  spore coat U domain-containing protein  27.54 
 
 
175 aa  51.6  5e-06  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.287049 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0537  spore coat U domain-containing protein  36.19 
 
 
153 aa  50.4  1e-05  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.547245  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0780  spore coat U domain-containing protein  29.11 
 
 
163 aa  50.4  1e-05  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5298  hypothetical protein  32.68 
 
 
171 aa  50.1  2e-05  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2357  spore coat U domain protein  27.38 
 
 
197 aa  49.7  2e-05  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.507972 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0341  putative lipoprotein  31.86 
 
 
122 aa  49.7  2e-05  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.615172  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0146  spore coat U domain-containing protein  31.71 
 
 
228 aa  49.3  3e-05  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.296083  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61510  hypothetical protein  32.03 
 
 
177 aa  49.3  3e-05  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.200762 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2681  hypothetical protein  27.17 
 
 
167 aa  48.5  4e-05  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61500  hypothetical protein  30 
 
 
182 aa  48.5  5e-05  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.116613 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1269  Spore coat U domain protein  35.38 
 
 
339 aa  48.1  6e-05  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.484388 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3338  spore coat U domain-containing protein  26.79 
 
 
197 aa  48.1  6e-05  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5297  hypothetical protein  29.78 
 
 
182 aa  48.1  6e-05  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2472  spore coat U domain-containing protein  30.81 
 
 
331 aa  48.1  7e-05  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169797  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0008  spore coat protein  31.78 
 
 
154 aa  47.4  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0009  Spore coat U domain protein  31.78 
 
 
154 aa  47.4  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.164066  hitchhiker  0.00841458 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3673  spore coat U  29.21 
 
 
177 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5756  secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  30.54 
 
 
333 aa  47.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1449  Spore coat U domain protein  30.23 
 
 
182 aa  46.6  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001216  CsuB  30.67 
 
 
148 aa  46.6  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.801331  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2339  spore coat U domain-containing protein  29.29 
 
 
178 aa  45.8  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.206881 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2338  spore coat U domain-containing protein  30.23 
 
 
331 aa  45.4  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.156142 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0777  spore coat U domain-containing protein  39.78 
 
 
156 aa  45.1  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2815  Spore coat U domain protein  34.62 
 
 
182 aa  44.7  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2473  spore coat U domain-containing protein  29.29 
 
 
178 aa  44.7  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.241559  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4397  putative secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  31.58 
 
 
165 aa  44.7  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.239263  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0306  spore coat protein, late developmental, putative  31.71 
 
 
181 aa  43.9  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.86749  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1267  Spore coat U domain protein  27.49 
 
 
318 aa  43.9  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0483759  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0677  hypothetical protein  26.71 
 
 
167 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03044  lipoprotein signal peptide  31.78 
 
 
325 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0900773  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1777  spore coat U domain-containing protein  26.52 
 
 
176 aa  43.9  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0475012  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0481  hypothetical protein  26.71 
 
 
167 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1610  hypothetical protein  26.71 
 
 
181 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.442578  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1632  type I pilus protein  26.71 
 
 
181 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2462  spore coat U domain-containing protein  29.41 
 
 
189 aa  44.3  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1395  hypothetical protein  26.71 
 
 
167 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4394  putative secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  36.79 
 
 
320 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.991106  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1270  Spore coat U domain protein  34.83 
 
 
174 aa  42.4  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal  0.0373463 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0872  hypothetical protein  26.71 
 
 
234 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1789  hypothetical protein  26.71 
 
 
234 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2458  spore coat U domain-containing protein  29.25 
 
 
321 aa  42.7  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0868  putative lipoprotein  29.45 
 
 
372 aa  42.4  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.236755  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0303  putative lipoprotein  36.17 
 
 
170 aa  42  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1803  spore coat U domain-containing protein  28.44 
 
 
323 aa  41.6  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0188481  normal  0.102888 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2668  hypothetical protein  25.58 
 
 
163 aa  41.2  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.641514  normal  0.0539014 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1666  hypothetical protein  25.58 
 
 
163 aa  41.2  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.607535  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1066  putative lipoprotein  33.01 
 
 
336 aa  41.2  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1072  putative lipoprotein  33.01 
 
 
345 aa  41.2  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1224  putative lipoprotein  33.01 
 
 
336 aa  41.2  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0971862  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>