More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1139 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1139  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 736 aa  1496    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.489697 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1440  TonB dependent, hydroxamate-type ferrisiderophore, outer membrane receptor  42.34 
 
 		 699 aa  536  1e-151  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453975  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0089  TonB-dependent siderophore receptor  42.21 
 
 		 699 aa  538  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.26085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  32.78 
 
 		 797 aa  337  5e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2395  TonB-dependent siderophore receptor  33.29 
 
 		 812 aa  334  3e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  31.52 
 
 		 829 aa  324  3e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4673  TonB-dependent siderophore receptor  32.14 
 
 		 727 aa  322  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  32.82 
 
 		 797 aa  320  6e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6718  ferrichrome receptor precursor protein  33.07 
 
 		 719 aa  319  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0249127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  31.8 
 
 		 806 aa  319  1e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0395  ferrichrome-iron receptor  33.43 
 
 		 696 aa  319  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.458077  hitchhiker  0.000000000000143872 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0416  ferrichrome-iron receptor  33.43 
 
 		 696 aa  318  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345861 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0398  ferrichrome-iron receptor  33.43 
 
 		 698 aa  318  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1775  TonB-dependent siderophore receptor  32.77 
 
 		 721 aa  318  2e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.441598 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4798  TonB-dependent siderophore receptor  32.38 
 
 		 724 aa  318  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0404  ferrichrome-iron receptor  33.43 
 
 		 696 aa  318  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000262521 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0458  ferrichrome-iron receptor  33.28 
 
 		 696 aa  317  5e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000766311 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2140  ferrichrome receptor precursor protein  33.16 
 
 		 740 aa  317  7e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.262117  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  31.56 
 
 		 828 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  31.64 
 
 		 729 aa  312  1e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  31.42 
 
 		 828 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  32.67 
 
 		 820 aa  310  4e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0493  TonB-dependent siderophore receptor  32.45 
 
 		 696 aa  310  9e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3773  TonB-dependent siderophore receptor  32.05 
 
 		 701 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  31.29 
 
 		 828 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  32.15 
 
 		 794 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3258  TonB-dependent siderophore receptor  31.93 
 
 		 736 aa  307  4.0000000000000004e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.875335  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.81 
 
 		 833 aa  306  9.000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  32.12 
 
 		 817 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5189  TonB-dependent siderophore receptor  31.38 
 
 		 808 aa  305  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.435834  normal  0.330016 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1319  TonB-dependent siderophore receptor  31.41 
 
 		 740 aa  303  7.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000200525  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4852  TonB-dependent siderophore receptor  31.71 
 
 		 810 aa  303  1e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1491  TonB-dependent siderophore receptor  31.89 
 
 		 717 aa  301  4e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000036194  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0458  TonB-dependent siderophore receptor  32.49 
 
 		 705 aa  300  5e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3585  ferrichrome receptor precursor protein  31.6 
 
 		 718 aa  300  7e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.885271  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  32.49 
 
 		 778 aa  299  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4121  TonB-dependent siderophore receptor  33.77 
 
 		 791 aa  298  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3613  TonB-dependent siderophore receptor  31.76 
 
 		 789 aa  296  7e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0350  TonB-dependent siderophore receptor  31.76 
 
 		 810 aa  296  8e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4273  TonB-dependent receptor protein  33.62 
 
 		 791 aa  295  1e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12812  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0376  TonB-dependent siderophore receptor  31.76 
 
 		 810 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  32.11 
 
 		 829 aa  295  3e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0378  TonB-dependent siderophore receptor  31.33 
 
 		 810 aa  293  6e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3502  TonB-dependent siderophore receptor  31.93 
 
 		 771 aa  292  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1367  TonB-dependent siderophore receptor  31.65 
 
 		 745 aa  290  5.0000000000000004e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0632202  normal  0.0485131 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2654  TonB-dependent siderophore receptor  32.55 
 
 		 757 aa  288  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0434213 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3895  TonB-dependent siderophore receptor  31.29 
 
 		 753 aa  287  5.999999999999999e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495237  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1006  TonB-dependent siderophore receptor  29.75 
 
 		 726 aa  286  9e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2675  TonB-dependent siderophore receptor  31.31 
 
 		 802 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3272  TonB-dependent siderophore receptor  30.64 
 
 		 750 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46801  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  31.74 
 
 		 799 aa  284  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0154  ferrichrome outer membrane transporter  29.83 
 
 		 729 aa  284  5.000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0142  ferrichrome outer membrane transporter  29.96 
 
 		 729 aa  284  5.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4489  TonB-dependent siderophore receptor  29.9 
 
 		 785 aa  283  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1045  TonB-dependent siderophore receptor  31.32 
 
 		 699 aa  281  2e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616371  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4121  TonB-dependent siderophore receptor  29.78 
 
 		 785 aa  281  3e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.922703 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  32.18 
 
 		 779 aa  281  3e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3474  ferrichrome receptor precursor protein  31.63 
 
 		 719 aa  281  3e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.588367  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  30.51 
 
 		 806 aa  281  4e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3577  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  29.67 
 
 		 718 aa  281  4e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.601026  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1502  ferrichrome outer membrane transporter  29.76 
 
 		 729 aa  280  7e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3064  TonB-dependent siderophore receptor  32.17 
 
 		 719 aa  278  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.981244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2867  TonB-dependent siderophore receptor  30.96 
 
 		 733 aa  276  7e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132982  normal  0.0165927 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  32.46 
 
 		 797 aa  276  8e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0945  TonB-dependent siderophore receptor  32.66 
 
 		 717 aa  276  9e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2779  TonB-dependent siderophore receptor  30.5 
 
 		 863 aa  276  1.0000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0220  ferrichrome outer membrane transporter  29.31 
 
 		 729 aa  275  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874732  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22630  TonB-dependent siderophore receptor protein  29.71 
 
 		 799 aa  273  6e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1027  TonB-dependent siderophore receptor  32.66 
 
 		 717 aa  273  7e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.424895 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4135  ferrioxamine B receptor precursor protein  30.7 
 
 		 726 aa  272  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156472  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0209  ferrichrome outer membrane transporter  30.17 
 
 		 703 aa  272  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0208  ferrichrome outer membrane transporter  30.17 
 
 		 703 aa  272  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2082  TonB-dependent siderophore receptor  30.62 
 
 		 771 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340788  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4602  TonB-dependent siderophore receptor  29.99 
 
 		 784 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  30.36 
 
 		 723 aa  268  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  31.24 
 
 		 701 aa  265  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  30.6 
 
 		 733 aa  265  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4365  TonB-dependent siderophore receptor  30.98 
 
 		 769 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145999  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0683  TonB-dependent siderophore receptor  30.43 
 
 		 728 aa  264  4.999999999999999e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0344523 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0672  TonB-dependent siderophore receptor  30.57 
 
 		 728 aa  263  8e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264811  normal  0.669281 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1079  TonB-dependent siderophore receptor  30.27 
 
 		 714 aa  261  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.181404  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3736  TonB-dependent siderophore receptor  31.24 
 
 		 735 aa  261  4e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  30.1 
 
 		 821 aa  259  8e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2736  TonB-dependent siderophore receptor  31.95 
 
 		 705 aa  259  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111092 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7042  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  29.75 
 
 		 689 aa  258  3e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1338  TonB-dependent siderophore receptor  29.87 
 
 		 815 aa  258  3e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  29.94 
 
 		 819 aa  258  3e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2374  TonB-dependent siderophore receptor  28.87 
 
 		 822 aa  258  4e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.18637  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3521  TonB-dependent siderophore receptor  30.18 
 
 		 699 aa  257  6e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00149  ferrichrome outer membrane transporter  28.5 
 
 		 747 aa  256  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145506  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2192  ferrioxamine B receptor precursor protein  30.19 
 
 		 724 aa  254  4.0000000000000004e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.411084  decreased coverage  0.00773577 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3509  ferrichrome outer membrane transporter  28.37 
 
 		 747 aa  254  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0167136  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00148  hypothetical protein  28.44 
 
 		 745 aa  254  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.140481  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0160  ferrichrome outer membrane transporter  28.37 
 
 		 747 aa  254  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1644  TonB-dependent siderophore receptor  31.56 
 
 		 745 aa  254  5.000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  29.46 
 
 		 799 aa  254  6e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0646  TonB-dependent siderophore receptor  30.59 
 
 		 665 aa  253  8.000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123915  normal  0.553141 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4098  TonB-dependent siderophore receptor  31.13 
 
 		 754 aa  253  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4066  TonB-dependent siderophore receptor  30.71 
 
 		 785 aa  252  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  31.34 
 
 		 831 aa  251  4e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>