More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_3129 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  100 
 
 		 399 aa  810    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  48.25 
 
 		 418 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  48.75 
 
 		 418 aa  325  8.000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  43.78 
 
 		 393 aa  325  8.000000000000001e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  48 
 
 		 418 aa  324  1e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  46.32 
 
 		 410 aa  322  6e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  50.58 
 
 		 399 aa  318  2e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  46.4 
 
 		 371 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  44.91 
 
 		 408 aa  310  2e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  49 
 
 		 356 aa  311  2e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  45.26 
 
 		 408 aa  311  2e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  46.04 
 
 		 420 aa  310  4e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5890  DNA-directed DNA polymerase  46.72 
 
 		 409 aa  309  6.999999999999999e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.315723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  43.54 
 
 		 385 aa  303  3.0000000000000004e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  46.98 
 
 		 406 aa  302  6.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  45.95 
 
 		 378 aa  301  9e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2663  DNA-directed DNA polymerase  45.59 
 
 		 358 aa  301  2e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0579235  normal  0.454418 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  43.48 
 
 		 426 aa  301  2e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3537  DNA-directed DNA polymerase  45.64 
 
 		 357 aa  298  9e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1330  DNA-directed DNA polymerase  45.43 
 
 		 359 aa  298  1e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.64899  normal  0.124466 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  42.12 
 
 		 409 aa  296  3e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  44.62 
 
 		 402 aa  293  5e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  48.54 
 
 		 374 aa  292  7e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  46.19 
 
 		 424 aa  292  8e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  47.11 
 
 		 378 aa  291  1e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  47.11 
 
 		 378 aa  291  1e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03139  DNA polymerase IV  46.89 
 
 		 369 aa  291  2e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3597  DNA-directed DNA polymerase  45.91 
 
 		 380 aa  289  6e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  44.76 
 
 		 430 aa  289  6e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0455  DNA polymerase IV  47.73 
 
 		 356 aa  289  7e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3265  DNA polymerase IV  46.38 
 
 		 354 aa  288  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1270  DNA-directed DNA polymerase  43.41 
 
 		 430 aa  287  2e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.725906  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  48.82 
 
 		 419 aa  287  2e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  41.37 
 
 		 408 aa  287  2e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1272  DNA-directed DNA polymerase  45.03 
 
 		 359 aa  287  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  46.6 
 
 		 422 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000325025  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  47.04 
 
 		 419 aa  286  5e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5155  DNA polymerase IV  45.27 
 
 		 363 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.702969 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  44.53 
 
 		 415 aa  285  8e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  44.02 
 
 		 372 aa  285  9e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3374  DNA polymerase IV  44.93 
 
 		 385 aa  285  1.0000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2424  DNA-directed DNA polymerase  44.76 
 
 		 415 aa  283  3.0000000000000004e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2024  DNA-directed DNA polymerase  45 
 
 		 373 aa  283  3.0000000000000004e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22910  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  45.03 
 
 		 414 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0450607 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2313  DNA-directed DNA polymerase  47.11 
 
 		 481 aa  282  7.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  42.04 
 
 		 425 aa  281  1e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6078  DNA polymerase IV  45.27 
 
 		 365 aa  281  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  42.11 
 
 		 412 aa  280  2e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000272693  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  42.04 
 
 		 384 aa  280  2e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  40.26 
 
 		 409 aa  280  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0473  DNA-directed DNA polymerase  44.38 
 
 		 375 aa  280  4e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1185  DNA-directed DNA polymerase  46.15 
 
 		 381 aa  280  4e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129375  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  43.16 
 
 		 417 aa  279  7e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0883  DNA-directed DNA polymerase  42.32 
 
 		 360 aa  278  1e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3636  DNA polymerase IV  44.66 
 
 		 396 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  39.63 
 
 		 389 aa  277  2e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1107  DNA-directed DNA polymerase  41.42 
 
 		 385 aa  277  2e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  47.28 
 
 		 355 aa  278  2e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  40.26 
 
 		 409 aa  277  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4922  DNA-directed DNA polymerase  44.24 
 
 		 410 aa  277  3e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  43.38 
 
 		 386 aa  276  3e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  41.34 
 
 		 397 aa  276  4e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3160  DNA-directed DNA polymerase  43.84 
 
 		 359 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2097  DNA-directed DNA polymerase  44.57 
 
 		 373 aa  275  1.0000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16030  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  44.01 
 
 		 407 aa  275  1.0000000000000001e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.218569  normal  0.0704551 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1963  DNA polymerase IV  44.54 
 
 		 357 aa  273  3e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.148262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  40.77 
 
 		 408 aa  273  3e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3621  DNA-directed DNA polymerase  44.91 
 
 		 385 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  42.82 
 
 		 359 aa  272  7e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2656  DNA polymerase IV  44.08 
 
 		 378 aa  271  1e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1587  DNA polymerase IV  44.04 
 
 		 362 aa  271  2e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1635  DNA polymerase IV  44.26 
 
 		 357 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.107243  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4549  DNA polymerase IV  43.3 
 
 		 419 aa  269  5.9999999999999995e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.849423  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0732  DNA-directed DNA polymerase  45.82 
 
 		 363 aa  269  8e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833353  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0190  DNA-directed DNA polymerase  39.18 
 
 		 410 aa  268  1e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3995  DNA polymerase IV  41.47 
 
 		 417 aa  267  2e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1566  DNA polymerase IV  45.43 
 
 		 369 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0682981  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1538  DNA polymerase IV  43.7 
 
 		 359 aa  266  4e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.142291  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0931  DNA polymerase IV  42.9 
 
 		 353 aa  265  1e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.643762  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1923  DNA-directed DNA polymerase  41.29 
 
 		 369 aa  265  1e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000722148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3604  DNA polymerase IV  41.71 
 
 		 364 aa  265  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.85941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2160  DNA polymerase IV  42.9 
 
 		 408 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.916632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  41.97 
 
 		 395 aa  263  4.999999999999999e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0662  DNA-directed DNA polymerase  43.54 
 
 		 353 aa  263  4.999999999999999e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5935  DNA polymerase IV  42.9 
 
 		 383 aa  263  6e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0630772  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2142  DNA polymerase IV  42.9 
 
 		 361 aa  263  6e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3990  DNA polymerase IV  43.68 
 
 		 353 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1654  DNA polymerase IV  40.39 
 
 		 407 aa  262  6.999999999999999e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.263851  normal  0.0394567 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1122  DNA polymerase IV  40.89 
 
 		 413 aa  261  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0597  DNA polymerase IV  44.25 
 
 		 355 aa  260  2e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1397  DNA polymerase IV  42.94 
 
 		 354 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2023  DNA-directed DNA polymerase  40.21 
 
 		 421 aa  260  3e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137176  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02810  DNA polymerase IV  43.15 
 
 		 368 aa  260  3e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.495536  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0614  DNA polymerase IV  44.25 
 
 		 355 aa  259  4e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1859  DNA polymerase IV  42.74 
 
 		 392 aa  260  4e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1070  DNA-directed DNA polymerase  39.79 
 
 		 409 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2808  DNA polymerase IV  41.58 
 
 		 417 aa  259  6e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2179  DNA polymerase IV  42.54 
 
 		 405 aa  259  6e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.288104  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52310  DNA polymerase IV  46.33 
 
 		 349 aa  259  7e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.88026 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0756  DNA polymerase IV  44.57 
 
 		 376 aa  258  1e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>