More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1394 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  100 
 
 
334 aa  700    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00174271  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  75 
 
 
290 aa  471  1e-132  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1371  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  69.86 
 
 
334 aa  440  9.999999999999999e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.896786  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1459  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  65.14 
 
 
333 aa  437  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.749481  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1141  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  65.18 
 
 
338 aa  434  1e-120  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0905  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  69.79 
 
 
284 aa  426  1e-118  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0960  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  65.62 
 
 
287 aa  414  1e-114  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1949  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  57.93 
 
 
351 aa  350  3e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00200432  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0012  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  55.18 
 
 
306 aa  339  4e-92  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1456  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  57.04 
 
 
284 aa  324  1e-87  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0102824  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0746  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  54.77 
 
 
286 aa  323  2e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000037264  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  55.8 
 
 
284 aa  323  3e-87  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2825  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  54.77 
 
 
289 aa  320  3e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2977  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  54.77 
 
 
289 aa  317  1e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2184  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  51.25 
 
 
301 aa  299  4e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2261  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  51.25 
 
 
301 aa  299  4e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1591  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50.17 
 
 
305 aa  298  1e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2393  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50.89 
 
 
301 aa  297  2e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2588  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  51.96 
 
 
301 aa  296  3e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1488  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50.7 
 
 
305 aa  296  5e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2435  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  51.96 
 
 
301 aa  294  1e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.759859 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1857  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  51.6 
 
 
301 aa  294  1e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1891  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  51.6 
 
 
302 aa  293  3e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.860262 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1884  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  51.6 
 
 
301 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2636  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.24 
 
 
301 aa  286  4e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000411372  normal  0.0277902 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2506  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.06 
 
 
300 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1754  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  49.82 
 
 
301 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.229998  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2304  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.83 
 
 
301 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1991  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.46 
 
 
309 aa  281  1e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.145028 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0222  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  44.11 
 
 
311 aa  225  1e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.763171  hitchhiker  3.90951e-21 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2948  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  40.67 
 
 
322 aa  210  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0501  peptide methionine sulfoxide reductase  59.38 
 
 
173 aa  206  3e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0754  methionine sulfoxide reductase B  53.33 
 
 
169 aa  182  8.000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.192538  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1055  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 
178 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.300876  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 
178 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2075  methionine sulfoxide reductase A  54.19 
 
 
175 aa  172  5e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0476  peptide methionine sulfoxide reductase  51.92 
 
 
208 aa  172  7.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1308  peptide methionine sulfoxide reductase  48.08 
 
 
184 aa  170  3e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5202  peptide methionine sulfoxide reductase  50.64 
 
 
180 aa  170  3e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1241  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  50.64 
 
 
176 aa  169  4e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00589693  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1464  methionine-R-sulfoxide reductase  66.38 
 
 
121 aa  170  4e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0263105  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1246  peptide methionine sulfoxide reductase  53.69 
 
 
155 aa  169  5e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2452  methionine sulfoxide reductase A  50 
 
 
158 aa  169  7e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0688  methionine sulfoxide reductase B  68.1 
 
 
159 aa  169  8e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0652  peptide methionine sulfoxide reductase  51.68 
 
 
158 aa  168  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0153224  normal  0.157322 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  48.72 
 
 
197 aa  168  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1028  peptide methionine sulfoxide reductase  66.38 
 
 
124 aa  167  2e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.589309  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0843  peptide methionine sulfoxide reductase  50.97 
 
 
209 aa  166  4e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.207853 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0190  methionine sulfoxide reductase A  50.65 
 
 
176 aa  166  5e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1380  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 
180 aa  166  5e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3735  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 
229 aa  166  5.9999999999999996e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0995  peptide methionine sulfoxide reductase  53.38 
 
 
150 aa  166  6.9999999999999995e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.760428 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2013  methionine sulfoxide reductase A  51.92 
 
 
156 aa  166  6.9999999999999995e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.808571  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1255  methionine sulfoxide reductase B  65.52 
 
 
119 aa  165  8e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0609  methionine sulfoxide reductase B  63.56 
 
 
119 aa  165  9e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2736  peptide methionine sulfoxide reductase  46.79 
 
 
183 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.144073  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3077  peptide methionine sulfoxide reductase  48.72 
 
 
177 aa  165  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  49.37 
 
 
184 aa  165  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1130  methionine sulfoxide reductase B  64.66 
 
 
119 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3095  peptide methionine sulfoxide reductase  52.32 
 
 
178 aa  164  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5337  peptide methionine sulfoxide reductase  50.33 
 
 
225 aa  164  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1056  methionine sulfoxide reductase B  64.66 
 
 
124 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.690057  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1447  peptide methionine sulfoxide reductase  48.12 
 
 
182 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3068  peptide methionine sulfoxide reductase  41.4 
 
 
249 aa  163  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4142  methionine sulfoxide reductase A  46.88 
 
 
186 aa  164  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330473  normal  0.0121487 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0830  methionine sulfoxide reductase A  50.32 
 
 
178 aa  163  3e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0328757  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  46.54 
 
 
181 aa  163  3e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3161  methionine sulfoxide reductase A  53.69 
 
 
162 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2815  methionine sulfoxide reductase A  51.95 
 
 
181 aa  162  6e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0725435  normal  0.0472359 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0268  methionine sulfoxide reductase A  53.64 
 
 
162 aa  162  6e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2328  peptide methionine sulfoxide reductase  51.02 
 
 
153 aa  162  7e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3532  methionine sulfoxide reductase A  48.03 
 
 
182 aa  162  8.000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0197931 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2085  peptide methionine sulfoxide reductase  51.63 
 
 
179 aa  160  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1523  peptide methionine sulfoxide reductase  54.11 
 
 
212 aa  160  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1856  methionine sulfoxide reductase A  48.39 
 
 
238 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0306  peptide methionine sulfoxide reductase  44.87 
 
 
182 aa  159  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2741  peptide methionine sulfoxide reductase  48.12 
 
 
242 aa  160  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0240  peptide methionine sulfoxide reductase  52.29 
 
 
177 aa  160  4e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1649  peptide methionine sulfoxide reductase  45.45 
 
 
266 aa  160  4e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000349761  normal  0.22298 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  48.39 
 
 
228 aa  159  6e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2731  Peptide-methionine (R)-S-oxide reductase  64.96 
 
 
120 aa  159  7e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000598889  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2645  methionine sulfoxide reductase A  48.7 
 
 
180 aa  159  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0662  peptide methionine sulfoxide reductase  46.75 
 
 
190 aa  158  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1749  peptide methionine sulfoxide reductase  47.44 
 
 
182 aa  158  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2779  peptide methionine sulfoxide reductase  45.86 
 
 
185 aa  158  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220977 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0847  methionine sulfoxide reductase A  49.03 
 
 
177 aa  157  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242718  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3364  methionine sulfoxide reductase A  47.37 
 
 
186 aa  157  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3453  peptide methionine sulfoxide reductase  47.37 
 
 
184 aa  156  4e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1750  methionine sulfoxide reductase A  46.05 
 
 
180 aa  156  5.0000000000000005e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0109887  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0254  peptide methionine sulfoxide reductase  45.16 
 
 
249 aa  156  6e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.275459  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1517  methionine sulfoxide reductase A  43.93 
 
 
236 aa  156  6e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0712  methionine sulfoxide reductase A  47.1 
 
 
179 aa  156  6e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.894466 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2276  peptide methionine sulfoxide reductase  47.44 
 
 
165 aa  155  7e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2559  peptide methionine sulfoxide reductase  42.7 
 
 
211 aa  155  7e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.085304  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1898  peptide methionine sulfoxide reductase  46.74 
 
 
212 aa  155  7e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2160  peptide methionine sulfoxide reductase  52.41 
 
 
163 aa  155  8e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1080  peptide methionine sulfoxide reductase  47.44 
 
 
164 aa  155  9e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.197554  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4335  peptide methionine sulfoxide reductase  49.67 
 
 
162 aa  155  9e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3719  peptide methionine sulfoxide reductase  45.16 
 
 
183 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.836534  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2133  peptide methionine sulfoxide reductase  50.32 
 
 
159 aa  155  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.858192  hitchhiker  0.0000318488 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>