More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1199 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1199  thioredoxin  100 
 
 		 268 aa  552  1e-156  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0450617 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1093  thioredoxin  54.85 
 
 		 268 aa  318  7e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0251638  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1467  thioredoxin  56.34 
 
 		 268 aa  312  2.9999999999999996e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0979  thioredoxin domain-containing protein  50.38 
 
 		 263 aa  288  9e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.248497  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1229  thioredoxin  52.47 
 
 		 268 aa  276  3e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.223518 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2614  thioredoxin family protein  42.96 
 
 		 271 aa  236  2e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1038  thioredoxin  44.78 
 
 		 277 aa  229  5e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1452  thioredoxin  39.63 
 
 		 272 aa  192  5e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  33.22 
 
 		 293 aa  172  5.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  33.33 
 
 		 293 aa  166  5e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  34.83 
 
 		 269 aa  165  8e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  32.63 
 
 		 290 aa  155  6e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0560  Thioredoxin domain protein  32.73 
 
 		 272 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0577  thioredoxin domain protein  32.73 
 
 		 272 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  33.57 
 
 		 306 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0664  Thioredoxin domain protein  33.33 
 
 		 282 aa  151  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  33.09 
 
 		 281 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  32.62 
 
 		 285 aa  150  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  32.12 
 
 		 310 aa  149  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  34.28 
 
 		 334 aa  149  5e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3035  thioredoxin-related  35.74 
 
 		 274 aa  149  6e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  32.6 
 
 		 280 aa  149  7e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  32.72 
 
 		 281 aa  149  7e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  32.03 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  31.87 
 
 		 280 aa  147  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  33.09 
 
 		 289 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  33.09 
 
 		 289 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  34.16 
 
 		 330 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3272  thioredoxin  32.86 
 
 		 326 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315754  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  32.72 
 
 		 287 aa  143  3e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  31.58 
 
 		 290 aa  142  8e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  32.13 
 
 		 280 aa  141  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  32.27 
 
 		 290 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  32.37 
 
 		 290 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  34.04 
 
 		 286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  32.4 
 
 		 306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  32.88 
 
 		 324 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  32.98 
 
 		 290 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  31.58 
 
 		 282 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  32.29 
 
 		 305 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  31.23 
 
 		 306 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  31.58 
 
 		 282 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2469  thioredoxin  33.57 
 
 		 289 aa  139  6e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.744001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2848  thioredoxin, putative  33.57 
 
 		 289 aa  139  6e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1312  thioredoxin  34.97 
 
 		 302 aa  138  7e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.968155  hitchhiker  0.00158392 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  31.58 
 
 		 282 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  31.23 
 
 		 317 aa  138  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  32.85 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  31.45 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  31.21 
 
 		 290 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  30.82 
 
 		 302 aa  135  9e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  32.28 
 
 		 324 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  31.47 
 
 		 302 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0835  thioredoxin  33.1 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0466449 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0837  thioredoxin  31.14 
 
 		 329 aa  132  3.9999999999999996e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24068  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  31.49 
 
 		 324 aa  132  5e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5272  Thioredoxin domain protein  30.97 
 
 		 272 aa  132  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.127007 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0603  thioredoxin domain-containing protein  29.37 
 
 		 287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0802586  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2864  thioredoxin domain-containing protein  32.7 
 
 		 272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.499317  normal  0.13279 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2254  Thioredoxin domain  31.74 
 
 		 338 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.708544  normal  0.526752 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2102  thioredoxin  32.86 
 
 		 291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1865  thioredoxin  32.76 
 
 		 306 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.938725 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  31.27 
 
 		 289 aa  129  5.0000000000000004e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  30.9 
 
 		 320 aa  129  6e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0081  thioredoxin-related  32.98 
 
 		 310 aa  129  6e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2127  thioredoxin domain-containing protein  30.14 
 
 		 311 aa  128  9.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0264  thioredoxin-related  33.45 
 
 		 305 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2938  thioredoxin  31.23 
 
 		 315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0886  putative thioredoxin protein  32.87 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2251  thioredoxin domain-containing protein  31.47 
 
 		 302 aa  125  9e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.285443 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2208  Thioredoxin domain  31.47 
 
 		 300 aa  124  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210633  normal  0.190287 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2526  Thioredoxin domain  31.47 
 
 		 302 aa  125  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2376  thioredoxin-related  33.85 
 
 		 286 aa  124  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.036483  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  30.53 
 
 		 282 aa  123  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0265  thioredoxin  51.49 
 
 		 110 aa  122  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.28448  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  29.66 
 
 		 302 aa  122  5e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0675  thioredoxin domain-containing protein  29.24 
 
 		 297 aa  122  7e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  31.93 
 
 		 282 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  31.23 
 
 		 282 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  30.1 
 
 		 306 aa  120  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  31.58 
 
 		 282 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  30.74 
 
 		 282 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  30.74 
 
 		 282 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  30.74 
 
 		 301 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  27.21 
 
 		 282 aa  119  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4590  thioredoxin  30.99 
 
 		 304 aa  118  7.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315091 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  31.1 
 
 		 282 aa  118  9e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  29.18 
 
 		 282 aa  118  9e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  29.1 
 
 		 287 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  27.56 
 
 		 282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1276  thioredoxin domain protein  30.36 
 
 		 337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1305  thioredoxin  40.91 
 
 		 235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.277929  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3472  thioredoxin  37.85 
 
 		 246 aa  116  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.110554  normal  0.0143649 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1489  thioredoxin domain-containing protein  27.46 
 
 		 304 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3667  thioredoxin domain-containing protein  30.5 
 
 		 298 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0035  thioredoxin domain protein  29.41 
 
 		 303 aa  116  5e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28500  thioredoxin  29.51 
 
 		 299 aa  116  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0139  thioredoxin  27.46 
 
 		 304 aa  115  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115095  normal  0.47686 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2894  thioredoxin  27.68 
 
 		 304 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0198  thioredoxin  29.66 
 
 		 326 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>