More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1172 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1172  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 
162 aa  331  3e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00149838  normal  0.362195 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1436  3-dehydroquinate dehydratase  68.92 
 
 
151 aa  212  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.767902  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1210  3-dehydroquinate dehydratase  69.01 
 
 
151 aa  209  1e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1544  3-dehydroquinate dehydratase  60.9 
 
 
166 aa  209  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1119  3-dehydroquinate dehydratase  70.42 
 
 
153 aa  205  2e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0784  3-dehydroquinate dehydratase  64.63 
 
 
173 aa  198  3e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.559355  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0932  3-dehydroquinate dehydratase  68.53 
 
 
151 aa  196  9e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  52.08 
 
 
147 aa  155  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995076  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2695  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.8 
 
 
145 aa  154  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.800528 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0744  3-dehydroquinate dehydratase  53.15 
 
 
153 aa  150  8e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00682582  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0715  3-dehydroquinate dehydratase  53.15 
 
 
153 aa  150  8e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0662  3-dehydroquinate dehydratase  56.52 
 
 
147 aa  150  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1505  3-dehydroquinate dehydratase  48.94 
 
 
159 aa  148  3e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1731  3-dehydroquinate dehydratase  52.21 
 
 
141 aa  146  9e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0204  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.71 
 
 
147 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1474  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.17 
 
 
152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00136549  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3469  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.68 
 
 
152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  52.48 
 
 
144 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0915  3-dehydroquinate dehydratase  49.66 
 
 
149 aa  144  4.0000000000000006e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249833  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  52.48 
 
 
148 aa  144  6e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0849  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 
142 aa  143  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00904578  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  48.92 
 
 
145 aa  142  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  49.65 
 
 
144 aa  141  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1733  3-dehydroquinate dehydratase  56.43 
 
 
161 aa  141  4e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  48.2 
 
 
145 aa  141  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2190  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.72 
 
 
150 aa  140  5e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2547  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.05 
 
 
142 aa  141  5e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.758716  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06130  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.94 
 
 
148 aa  140  8e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3520  3-dehydroquinate dehydratase  48.95 
 
 
145 aa  140  9e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000267198  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2657  3-dehydroquinate dehydratase  51.37 
 
 
149 aa  140  9e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000254633 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1924  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 
142 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4052  3-dehydroquinate dehydratase  48.28 
 
 
146 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 
145 aa  139  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1540  3-dehydroquinate dehydratase  54.61 
 
 
156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0606879 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0230  3-dehydroquinate dehydratase  44.68 
 
 
160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  49.31 
 
 
150 aa  138  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0364  3-dehydroquinate dehydratase  46.81 
 
 
159 aa  138  3e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0718569  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1559  3-dehydroquinate dehydratase  51.37 
 
 
149 aa  138  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.897026  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3392  3-dehydroquinate dehydratase  51.05 
 
 
158 aa  137  4.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4272  3-dehydroquinate dehydratase  46.9 
 
 
146 aa  137  6e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4329  3-dehydroquinate dehydratase  46.9 
 
 
146 aa  137  6e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4103  3-dehydroquinate dehydratase  46.9 
 
 
146 aa  137  7e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3941  3-dehydroquinate dehydratase  46.9 
 
 
146 aa  137  7e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3952  3-dehydroquinate dehydratase  46.9 
 
 
146 aa  137  7e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4219  3-dehydroquinate dehydratase  46.9 
 
 
146 aa  137  7e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4423  3-dehydroquinate dehydratase  46.9 
 
 
146 aa  137  7e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4309  3-dehydroquinate dehydratase  47.59 
 
 
146 aa  137  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0290  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.25 
 
 
160 aa  137  7.999999999999999e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.347415  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0925  3-dehydroquinate dehydratase  47.59 
 
 
146 aa  137  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2345  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.91 
 
 
137 aa  136  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.660798  normal  0.653044 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1003  3-dehydroquinate dehydratase  52.86 
 
 
150 aa  135  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0032  3-dehydroquinate dehydratase  50.69 
 
 
149 aa  135  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0370  3-dehydroquinate dehydratase  47.52 
 
 
159 aa  135  2e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00140278  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3731  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 
157 aa  135  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.318206  hitchhiker  0.00144149 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2893  3-dehydroquinate dehydratase  47.22 
 
 
146 aa  134  4e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2283  3-dehydroquinate dehydratase  50.68 
 
 
145 aa  134  4e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1223  3-dehydroquinate dehydratase  50.71 
 
 
151 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3121  3-dehydroquinate dehydratase, type II  47.62 
 
 
149 aa  134  6.0000000000000005e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2703  3-dehydroquinate dehydratase  47.76 
 
 
145 aa  134  8e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1028  3-dehydroquinate dehydratase  50.71 
 
 
151 aa  134  8e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0063  3-dehydroquinate dehydratase  43.97 
 
 
159 aa  133  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3692  3-dehydroquinate dehydratase  46.48 
 
 
150 aa  133  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.526895  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1698  3-dehydroquinate dehydratase, type II  45.58 
 
 
145 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0104  3-dehydroquinate dehydratase  43.97 
 
 
159 aa  133  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1094  3-dehydroquinate dehydratase  50.71 
 
 
191 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2664  3-dehydroquinate dehydratase  46.53 
 
 
150 aa  133  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3174  3-dehydroquinate dehydratase  49.31 
 
 
153 aa  133  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.715681 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  45.83 
 
 
150 aa  132  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2022  3-dehydroquinate dehydratase  48.95 
 
 
150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1721  3-dehydroquinate dehydratase  46.9 
 
 
145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04381  3-dehydroquinate dehydratase  47.59 
 
 
145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0561971  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11973  3-dehydroquinate dehydratase  44.68 
 
 
144 aa  131  3e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0211  3-dehydroquinate dehydratase  45.27 
 
 
149 aa  132  3e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.324309  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0076  3-dehydroquinate dehydratase  43.26 
 
 
159 aa  131  3e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2796  3-dehydroquinate dehydratase, type II  46.04 
 
 
138 aa  131  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.396749  normal  0.170402 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2077  3-dehydroquinate dehydratase  47.14 
 
 
150 aa  131  3.9999999999999996e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.556948  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04381  3-dehydroquinate dehydratase  44.14 
 
 
147 aa  131  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0544  3-dehydroquinate dehydratase  43.45 
 
 
152 aa  131  5e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0255  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.25 
 
 
184 aa  130  7.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0586  3-dehydroquinate dehydratase  45.83 
 
 
144 aa  130  7.999999999999999e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0571  3-dehydroquinate dehydratase  45.83 
 
 
144 aa  130  7.999999999999999e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5032  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 
151 aa  130  9e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2097  3-dehydroquinate dehydratase  48.15 
 
 
153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1211  3-dehydroquinate dehydratase, type II  45.39 
 
 
155 aa  130  1.0000000000000001e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4097  3-dehydroquinate dehydratase, type II  46.62 
 
 
165 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.517045  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3916  3-dehydroquinate dehydratase  44.37 
 
 
150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.491166  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04491  3-dehydroquinate dehydratase  44.44 
 
 
146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.609687  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0954  3-dehydroquinate dehydratase  46.43 
 
 
148 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0330586 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4497  3-dehydroquinate dehydratase  46.58 
 
 
149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.81741  normal  0.381959 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2337  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50 
 
 
148 aa  129  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03030  3-dehydroquinate dehydratase  48.28 
 
 
148 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343672  hitchhiker  0.0000797805 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3996  3-dehydroquinate dehydratase  45.21 
 
 
148 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.588334  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0128  3-dehydroquinate dehydratase, type II  47.45 
 
 
137 aa  129  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.297868  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5387  3-dehydroquinate dehydratase  48.25 
 
 
153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.878433  normal  0.435849 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0687  3-dehydroquinate dehydratase  44.76 
 
 
160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.715219  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04071  3-dehydroquinate dehydratase  44.29 
 
 
147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1300  3-dehydroquinate dehydratase  45.75 
 
 
150 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0501246  normal  0.27707 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2207  3-dehydroquinate dehydratase  49.28 
 
 
144 aa  128  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121431  normal  0.285231 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3860  3-dehydroquinate dehydratase  53.68 
 
 
148 aa  128  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0470796 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3637  3-dehydroquinate dehydratase, type II  46.76 
 
 
142 aa  128  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>