More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1300 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1300  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 
150 aa  306  4e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0501246  normal  0.27707 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1952  3-dehydroquinate dehydratase  64.24 
 
 
154 aa  197  6e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000216086  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1422  3-dehydroquinate dehydratase  60.14 
 
 
155 aa  191  4e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.216842  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0373  3-dehydroquinate dehydratase  62.25 
 
 
159 aa  187  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.131464 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2481  3-dehydroquinate dehydratase  64.38 
 
 
149 aa  187  5.999999999999999e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2703  3-dehydroquinate dehydratase  49.26 
 
 
145 aa  145  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3469  3-dehydroquinate dehydratase, type II  47.3 
 
 
152 aa  135  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04491  3-dehydroquinate dehydratase  41.78 
 
 
146 aa  134  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.609687  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2796  3-dehydroquinate dehydratase, type II  46.32 
 
 
138 aa  134  6.0000000000000005e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.396749  normal  0.170402 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1119  3-dehydroquinate dehydratase  47.3 
 
 
153 aa  133  7.000000000000001e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1721  3-dehydroquinate dehydratase  44.83 
 
 
145 aa  132  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1698  3-dehydroquinate dehydratase, type II  44.52 
 
 
145 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  46.9 
 
 
147 aa  131  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995076  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  45.52 
 
 
150 aa  130  5e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_002950  PG1731  3-dehydroquinate dehydratase  49.26 
 
 
141 aa  130  6e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04381  3-dehydroquinate dehydratase  44.83 
 
 
145 aa  130  9e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0561971  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  47.26 
 
 
144 aa  129  9e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04071  3-dehydroquinate dehydratase  38.89 
 
 
147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04381  3-dehydroquinate dehydratase  38.36 
 
 
147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0715  3-dehydroquinate dehydratase  46.21 
 
 
153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1172  3-dehydroquinate dehydratase  45.75 
 
 
162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00149838  normal  0.362195 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0744  3-dehydroquinate dehydratase  46.21 
 
 
153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00682582  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  45.52 
 
 
148 aa  128  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2190  3-dehydroquinate dehydratase, type II  44.67 
 
 
150 aa  128  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0544  3-dehydroquinate dehydratase  41.78 
 
 
152 aa  128  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0067  3-dehydroquinate dehydratase, type II  47.18 
 
 
139 aa  127  4.0000000000000003e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463951  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0032  3-dehydroquinate dehydratase  45.52 
 
 
149 aa  127  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3637  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.51 
 
 
142 aa  127  7.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2664  3-dehydroquinate dehydratase  42.18 
 
 
150 aa  126  8.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0211  3-dehydroquinate dehydratase  47.55 
 
 
156 aa  126  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1924  3-dehydroquinate dehydratase  44.85 
 
 
142 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1474  3-dehydroquinate dehydratase, type II  43.54 
 
 
152 aa  125  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00136549  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1210  3-dehydroquinate dehydratase  45.89 
 
 
151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1544  3-dehydroquinate dehydratase  43.84 
 
 
166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0189  3-dehydroquinate dehydratase  45.14 
 
 
156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0200  3-dehydroquinate dehydratase  46.85 
 
 
156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0204  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.61 
 
 
147 aa  124  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1436  3-dehydroquinate dehydratase  43.84 
 
 
151 aa  124  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.767902  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0784  3-dehydroquinate dehydratase  44.52 
 
 
173 aa  124  6e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.559355  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3731  3-dehydroquinate dehydratase  47.89 
 
 
157 aa  123  7e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.318206  hitchhiker  0.00144149 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0128  3-dehydroquinate dehydratase, type II  41.91 
 
 
137 aa  123  9e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.297868  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0932  3-dehydroquinate dehydratase  45.89 
 
 
151 aa  122  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1242  3-dehydroquinate dehydratase, type II  45.52 
 
 
145 aa  121  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0915  3-dehydroquinate dehydratase  44.9 
 
 
149 aa  120  4e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249833  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3243  3-dehydroquinate dehydratase  49.25 
 
 
144 aa  120  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.414343 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0246  3-dehydroquinate dehydratase, type II  43.97 
 
 
156 aa  120  6e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  46.76 
 
 
145 aa  120  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3392  3-dehydroquinate dehydratase  44.9 
 
 
158 aa  120  8e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0209  3-dehydroquinate dehydratase  45.21 
 
 
155 aa  120  8e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0306548 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2435  3-dehydroquinate dehydratase, type II  49.59 
 
 
142 aa  120  9e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.476649 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4272  3-dehydroquinate dehydratase  41.61 
 
 
146 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4103  3-dehydroquinate dehydratase  41.61 
 
 
146 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3941  3-dehydroquinate dehydratase  41.61 
 
 
146 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3952  3-dehydroquinate dehydratase  41.61 
 
 
146 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4329  3-dehydroquinate dehydratase  41.61 
 
 
146 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  47.48 
 
 
145 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4423  3-dehydroquinate dehydratase  41.61 
 
 
146 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4219  3-dehydroquinate dehydratase  41.61 
 
 
146 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  48.92 
 
 
145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  41.67 
 
 
144 aa  118  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0662  3-dehydroquinate dehydratase  45.89 
 
 
147 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1505  3-dehydroquinate dehydratase  36.73 
 
 
159 aa  118  1.9999999999999998e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4052  3-dehydroquinate dehydratase  42.28 
 
 
146 aa  118  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3376  3-dehydroquinate dehydratase  46.1 
 
 
147 aa  118  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1540  3-dehydroquinate dehydratase  47.59 
 
 
156 aa  118  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0606879 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11973  3-dehydroquinate dehydratase  41.18 
 
 
144 aa  117  3.9999999999999996e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3174  3-dehydroquinate dehydratase  46.15 
 
 
153 aa  117  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.715681 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12557  3-dehydroquinate dehydratase  42.67 
 
 
147 aa  117  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000372311  normal  0.0899495 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3022  3-dehydroquinate dehydratase  46.1 
 
 
147 aa  117  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00285164  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0211  3-dehydroquinate dehydratase  44.85 
 
 
149 aa  117  6e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.324309  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3860  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 
148 aa  117  6e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0470796 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2415  3-dehydroquinate dehydratase  46.58 
 
 
146 aa  117  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.491796  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2715  3-dehydroquinate dehydratase  46.58 
 
 
151 aa  117  7e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2893  3-dehydroquinate dehydratase  42.36 
 
 
146 aa  116  7.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2345  3-dehydroquinate dehydratase, type II  41.91 
 
 
137 aa  116  9e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.660798  normal  0.653044 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2547  3-dehydroquinate dehydratase, type II  45.39 
 
 
142 aa  116  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.758716  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2433  3-dehydroquinate dehydratase  44.52 
 
 
156 aa  115  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0370  3-dehydroquinate dehydratase  37.93 
 
 
159 aa  116  9.999999999999999e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00140278  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  42.96 
 
 
152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2695  3-dehydroquinate dehydratase, type II  44.2 
 
 
145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.800528 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0123  3-dehydroquinate dehydratase  48.87 
 
 
141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.573144  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0849  3-dehydroquinate dehydratase  39.71 
 
 
142 aa  115  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00904578  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0925  3-dehydroquinate dehydratase  40.94 
 
 
146 aa  115  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3032  3-dehydroquinate dehydratase  43.92 
 
 
145 aa  114  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.225268  hitchhiker  0.000680386 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4309  3-dehydroquinate dehydratase  40.94 
 
 
146 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3500  3-dehydroquinate dehydratase  47.55 
 
 
155 aa  114  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.651593 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0687  3-dehydroquinate dehydratase  37.84 
 
 
160 aa  114  5e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.715219  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0231  3-dehydroquinate dehydratase  43.38 
 
 
149 aa  114  5e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.447722  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0383  3-dehydroquinate dehydratase  39.23 
 
 
166 aa  114  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3692  3-dehydroquinate dehydratase  45.26 
 
 
150 aa  114  6.9999999999999995e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.526895  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2785  3-dehydroquinate dehydratase  47.48 
 
 
156 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2077  3-dehydroquinate dehydratase  47.52 
 
 
150 aa  113  6.9999999999999995e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.556948  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3145  3-dehydroquinate dehydratase  45.14 
 
 
146 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35351  normal  0.502836 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0364  3-dehydroquinate dehydratase  36.55 
 
 
159 aa  113  7.999999999999999e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0718569  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2097  3-dehydroquinate dehydratase  46.38 
 
 
153 aa  113  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0695  3-dehydroquinate dehydratase  39.46 
 
 
146 aa  113  8.999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114768  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03831  3-dehydroquinate dehydratase  46.15 
 
 
148 aa  113  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1198  3-dehydroquinate dehydratase  39.16 
 
 
141 aa  113  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03030  3-dehydroquinate dehydratase  43.24 
 
 
148 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343672  hitchhiker  0.0000797805 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0255  3-dehydroquinate dehydratase, type II  42.07 
 
 
184 aa  112  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>