More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1952 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1952  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 
154 aa  314  2e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000216086  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0373  3-dehydroquinate dehydratase  73.2 
 
 
159 aa  233  9e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.131464 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1422  3-dehydroquinate dehydratase  69.59 
 
 
155 aa  228  2e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.216842  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2481  3-dehydroquinate dehydratase  70.14 
 
 
149 aa  209  1e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1300  3-dehydroquinate dehydratase  64.24 
 
 
150 aa  197  6e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0501246  normal  0.27707 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2703  3-dehydroquinate dehydratase  47.55 
 
 
145 aa  134  3.0000000000000003e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.3 
 
 
144 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1119  3-dehydroquinate dehydratase  45.45 
 
 
153 aa  133  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1731  3-dehydroquinate dehydratase  48.94 
 
 
141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0784  3-dehydroquinate dehydratase  44.9 
 
 
173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.559355  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2664  3-dehydroquinate dehydratase  44.44 
 
 
150 aa  128  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1436  3-dehydroquinate dehydratase  44.44 
 
 
151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.767902  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1544  3-dehydroquinate dehydratase  44.22 
 
 
166 aa  128  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  45.14 
 
 
150 aa  127  6e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1210  3-dehydroquinate dehydratase  45.58 
 
 
151 aa  127  7.000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  44.76 
 
 
147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995076  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2190  3-dehydroquinate dehydratase, type II  47.06 
 
 
150 aa  126  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04491  3-dehydroquinate dehydratase  38.26 
 
 
146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.609687  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0932  3-dehydroquinate dehydratase  47.3 
 
 
151 aa  125  3e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  44.44 
 
 
144 aa  124  5e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0032  3-dehydroquinate dehydratase  47.65 
 
 
149 aa  124  6e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0211  3-dehydroquinate dehydratase  43.45 
 
 
149 aa  123  7e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.324309  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04381  3-dehydroquinate dehydratase  38.62 
 
 
147 aa  123  9e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2077  3-dehydroquinate dehydratase  47.14 
 
 
150 aa  122  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.556948  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  44.52 
 
 
148 aa  122  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04071  3-dehydroquinate dehydratase  38.62 
 
 
147 aa  122  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1721  3-dehydroquinate dehydratase  42.47 
 
 
145 aa  121  3e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0915  3-dehydroquinate dehydratase  45.58 
 
 
149 aa  121  3e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249833  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0845  3-dehydroquinate dehydratase, type II  47.62 
 
 
145 aa  121  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1698  3-dehydroquinate dehydratase, type II  41.13 
 
 
145 aa  120  5e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3469  3-dehydroquinate dehydratase, type II  42.95 
 
 
152 aa  120  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1172  3-dehydroquinate dehydratase  45.03 
 
 
162 aa  120  8e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00149838  normal  0.362195 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0662  3-dehydroquinate dehydratase  46.15 
 
 
147 aa  120  9e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3063  3-dehydroquinate dehydratase  44.37 
 
 
162 aa  120  9e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2796  3-dehydroquinate dehydratase, type II  43.06 
 
 
138 aa  119  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.396749  normal  0.170402 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0128  3-dehydroquinate dehydratase, type II  42.36 
 
 
137 aa  119  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.297868  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2695  3-dehydroquinate dehydratase, type II  41.5 
 
 
145 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.800528 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1164  3-dehydroquinate dehydratase  43.15 
 
 
207 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04381  3-dehydroquinate dehydratase  42.07 
 
 
145 aa  119  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0561971  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0231  3-dehydroquinate dehydratase  40.27 
 
 
149 aa  119  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.447722  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3205  3-dehydroquinate dehydratase  43.62 
 
 
148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0087334 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1474  3-dehydroquinate dehydratase, type II  46.05 
 
 
152 aa  118  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00136549  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11973  3-dehydroquinate dehydratase  40.82 
 
 
144 aa  118  3e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3499  3-dehydroquinate dehydratase  43.15 
 
 
207 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3500  3-dehydroquinate dehydratase  48.57 
 
 
155 aa  118  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.651593 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0421  3-dehydroquinate dehydratase  43.15 
 
 
207 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3637  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.28 
 
 
142 aa  118  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2022  3-dehydroquinate dehydratase  45.58 
 
 
150 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3502  3-dehydroquinate dehydratase  43.15 
 
 
150 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248237  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2500  3-dehydroquinate dehydratase  43.15 
 
 
150 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.263847  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3464  3-dehydroquinate dehydratase  43.15 
 
 
150 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1559  3-dehydroquinate dehydratase  46.58 
 
 
149 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.897026  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3284  3-dehydroquinate dehydratase  43.15 
 
 
150 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1280  3-dehydroquinate dehydratase  43.15 
 
 
150 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2785  3-dehydroquinate dehydratase  42.25 
 
 
156 aa  117  6e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0744  3-dehydroquinate dehydratase  45.21 
 
 
153 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00682582  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2657  3-dehydroquinate dehydratase  46.58 
 
 
149 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000254633 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  44.14 
 
 
150 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0370  3-dehydroquinate dehydratase  40.52 
 
 
159 aa  116  9.999999999999999e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00140278  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1540  3-dehydroquinate dehydratase  46.85 
 
 
156 aa  116  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0606879 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2531  3-dehydroquinate dehydratase  42.36 
 
 
145 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2433  3-dehydroquinate dehydratase  43.59 
 
 
156 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  50.71 
 
 
145 aa  116  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  45.45 
 
 
145 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0715  3-dehydroquinate dehydratase  45.21 
 
 
153 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03007  3-dehydroquinate dehydratase  42.76 
 
 
148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0204  3-dehydroquinate dehydratase, type II  45.07 
 
 
147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  42.47 
 
 
152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2754  3-dehydroquinate dehydratase  42.22 
 
 
151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2715  3-dehydroquinate dehydratase  44.52 
 
 
151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3392  3-dehydroquinate dehydratase  46.15 
 
 
158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3940  3-dehydroquinate dehydratase  45.77 
 
 
141 aa  115  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000739911  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0255  3-dehydroquinate dehydratase, type II  42.95 
 
 
184 aa  114  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2058  3-dehydroquinate dehydratase  43.79 
 
 
193 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3063  3-dehydroquinate dehydratase  44.9 
 
 
151 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816098  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62322  3-dehydroquinate dehydratase 1 (3-dehydroquinase 1) (Type II DHQase 1)  38.13 
 
 
146 aa  114  3.9999999999999997e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4964  3-dehydroquinate dehydratase  44.9 
 
 
151 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0222066 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4214  3-dehydroquinate dehydratase  43.05 
 
 
163 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392467  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5304  3-dehydroquinate dehydratase  44.9 
 
 
151 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1896  3-dehydroquinate dehydratase  45.64 
 
 
193 aa  114  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3692  3-dehydroquinate dehydratase  40.52 
 
 
150 aa  114  5e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.526895  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2228  3-dehydroquinate dehydratase, type II  39.86 
 
 
149 aa  114  5e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0482  3-dehydroquinate dehydratase  45.64 
 
 
193 aa  114  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.644593  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1753  3-dehydroquinate dehydratase  45.64 
 
 
151 aa  114  6e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111772  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0849  3-dehydroquinate dehydratase  45.64 
 
 
151 aa  114  6e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0067  3-dehydroquinate dehydratase, type II  47.22 
 
 
139 aa  114  6e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463951  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2207  3-dehydroquinate dehydratase  45.64 
 
 
151 aa  114  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  45.45 
 
 
145 aa  114  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0892  3-dehydroquinate dehydratase  45.64 
 
 
151 aa  114  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396481  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0579  3-dehydroquinate dehydratase  44.97 
 
 
193 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0344  3-dehydroquinate dehydratase  45.58 
 
 
151 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960001  normal  0.658958 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2628  3-dehydroquinate dehydratase  45.19 
 
 
154 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2283  3-dehydroquinate dehydratase  43.54 
 
 
145 aa  113  8.999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3467  3-dehydroquinate dehydratase  41.61 
 
 
149 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0364  3-dehydroquinate dehydratase  38.06 
 
 
159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0718569  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3425  3-dehydroquinate dehydratase  45.19 
 
 
151 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112625  normal  0.0823 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3030  3-dehydroquinate dehydratase  43.28 
 
 
155 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4423  3-dehydroquinate dehydratase  42.28 
 
 
146 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0533  3-dehydroquinate dehydratase  45.19 
 
 
151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.665564 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4219  3-dehydroquinate dehydratase  42.28 
 
 
146 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>