More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0134 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0134  protein of unknown function UPF0079  100 
 
 
146 aa  303  8.000000000000001e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0122  protein of unknown function UPF0079  72.14 
 
 
158 aa  207  4e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000147481  hitchhiker  0.00840651 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0100  protein of unknown function UPF0079  65.73 
 
 
151 aa  206  1e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0009157  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2666  hypothetical protein  59.57 
 
 
143 aa  178  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0641125  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0090  protein of unknown function UPF0079  59.57 
 
 
145 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.184225  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1987  hypothetical protein  55.64 
 
 
145 aa  145  1.0000000000000001e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0095  hypothetical protein  50.35 
 
 
146 aa  141  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.442138  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  45.11 
 
 
160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  38.06 
 
 
161 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  42.14 
 
 
161 aa  107  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  37.76 
 
 
154 aa  105  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  37.76 
 
 
154 aa  105  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0444  protein of unknown function UPF0079  43.17 
 
 
157 aa  103  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19780  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  40.14 
 
 
152 aa  103  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0805781  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11800  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  44.6 
 
 
163 aa  102  2e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0182  protein of unknown function UPF0079  40.88 
 
 
148 aa  99.8  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0313363  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  40.6 
 
 
159 aa  98.6  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0046  protein of unknown function UPF0079  35.97 
 
 
174 aa  98.2  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  41.18 
 
 
164 aa  97.8  4e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1881  hypothetical protein  37.04 
 
 
160 aa  97.4  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000937898  hitchhiker  0.0000223198 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2016  hypothetical protein  33.33 
 
 
158 aa  97.8  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  34.04 
 
 
153 aa  96.7  9e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  39.2 
 
 
159 aa  96.7  9e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2319  hypothetical protein  36.43 
 
 
162 aa  96.7  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  39.52 
 
 
150 aa  96.7  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1263  protein of unknown function UPF0079  40 
 
 
153 aa  94.7  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204178  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0483  protein of unknown function UPF0079  37.23 
 
 
149 aa  94.4  5e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.790809  normal  0.0607901 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  36.36 
 
 
157 aa  93.6  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3020  protein of unknown function UPF0079  40.77 
 
 
153 aa  94  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0713  hypothetical protein  38.52 
 
 
187 aa  93.6  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  0.667416 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  37.06 
 
 
157 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  36.36 
 
 
157 aa  92.8  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  36.36 
 
 
157 aa  92.8  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  36.36 
 
 
157 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  36.36 
 
 
157 aa  92.8  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  37.06 
 
 
157 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  35.66 
 
 
157 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  34.53 
 
 
152 aa  93.2  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1469  hypothetical protein  40 
 
 
143 aa  92  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  35.66 
 
 
157 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0965  protein of unknown function UPF0079  37.96 
 
 
156 aa  92.4  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2126  hypothetical protein  36.36 
 
 
164 aa  92  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  36.36 
 
 
157 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  32.35 
 
 
173 aa  91.7  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2089  hypothetical protein  36.36 
 
 
164 aa  92  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.38888  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  38.81 
 
 
152 aa  92  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1664  hypothetical protein  36.03 
 
 
153 aa  90.9  5e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1005  hypothetical protein  41.03 
 
 
160 aa  90.5  7e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000601093  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  35.66 
 
 
158 aa  90.5  8e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0809  hypothetical protein  34.35 
 
 
148 aa  90.1  8e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  38.52 
 
 
160 aa  89.7  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0617  protein of unknown function UPF0079  38.76 
 
 
150 aa  90.1  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.202797  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1531  ATPase or kinase  35 
 
 
149 aa  89.7  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4357  hypothetical protein  37.32 
 
 
189 aa  89.4  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2364  protein of unknown function UPF0079  40.16 
 
 
183 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.118731  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2261  hypothetical protein  37.41 
 
 
164 aa  89  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000158801  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1800  hypothetical protein  40.17 
 
 
161 aa  88.6  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.009423  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2452  protein of unknown function UPF0079  39.02 
 
 
183 aa  87.8  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  35.25 
 
 
157 aa  88.2  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1869  hypothetical protein  38.17 
 
 
158 aa  87.8  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000565626  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1503  hypothetical protein  39.02 
 
 
188 aa  87.4  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.170985  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  35.04 
 
 
155 aa  87.4  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4975  hypothetical protein  35.29 
 
 
171 aa  87  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_339  hypothetical protein  32.14 
 
 
163 aa  86.7  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00581672  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0396  hypothetical protein  31.43 
 
 
163 aa  86.3  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1390  protein of unknown function UPF0079  35.97 
 
 
167 aa  86.3  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.004631  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2508  hypothetical protein  34.38 
 
 
144 aa  86.7  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0224892  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0611  hypothetical protein  35.77 
 
 
153 aa  86.7  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.400731 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0375  hypothetical protein  32.14 
 
 
163 aa  85.9  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128461  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3281  hypothetical protein  34.04 
 
 
144 aa  85.5  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223285  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0346  hypothetical protein  37.41 
 
 
143 aa  85.9  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.101542  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2169  hypothetical protein  37.41 
 
 
167 aa  85.1  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.884354  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2842  hypothetical protein  37.98 
 
 
158 aa  84.7  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.523389 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2330  hypothetical protein  40.37 
 
 
182 aa  84  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2530  protein of unknown function UPF0079  38.98 
 
 
176 aa  84  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117314  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0374  protein of unknown function UPF0079  34.43 
 
 
149 aa  84  7e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4283  protein of unknown function UPF0079  39.81 
 
 
138 aa  82.8  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2907  hypothetical protein  32.09 
 
 
135 aa  83.2  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.470987  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  33.82 
 
 
150 aa  82.8  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3245  hypothetical protein  38.06 
 
 
504 aa  82.4  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  33.6 
 
 
184 aa  82  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2955  hypothetical protein  33.83 
 
 
161 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.263755  normal  0.0249448 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2896  protein of unknown function UPF0079  40.16 
 
 
149 aa  81.6  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.166162  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0961  hypothetical protein  37.84 
 
 
163 aa  81.3  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.14989  hitchhiker  0.00154455 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0596  hypothetical protein  36.04 
 
 
176 aa  80.9  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0487  hypothetical protein  34.31 
 
 
148 aa  80.5  0.000000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0366  hypothetical protein  32.37 
 
 
169 aa  80.1  0.000000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  35.38 
 
 
152 aa  80.1  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2531  hypothetical protein  36.92 
 
 
162 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4044  protein of unknown function UPF0079  35.04 
 
 
170 aa  79  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.193855  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4455  hypothetical protein  34.46 
 
 
152 aa  78.2  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0174  hypothetical protein  33.85 
 
 
169 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00309519  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1261  protein of unknown function UPF0079  28.86 
 
 
178 aa  77  0.00000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.810955  normal  0.0782471 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1296  hypothetical protein  34.07 
 
 
161 aa  77.4  0.00000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0433075  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1159  hypothetical protein  34.07 
 
 
161 aa  77  0.00000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0147113  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1522  hypothetical protein  33.85 
 
 
161 aa  77  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.229097  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3029  hypothetical protein  33.57 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.63375  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0927  hypothetical protein  32.26 
 
 
138 aa  75.5  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.641059 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2671  RNA binding S1  37.72 
 
 
157 aa  75.9  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.543969  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0376  hypothetical protein  30.22 
 
 
147 aa  75.5  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>